PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=631-56-3L8)

Interfaces in PDB 6xw7 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.15 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF MURINE NOROVIRUS P DOMAIN IN COMPLEX WITH NANOBODY NB-5829 AND GLYCOCHENODEOXYCHOLATE (GCDCA)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`212`	`58`	`13650`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`204`	`56`	`13450`	`1875.4`	`-8.5`	`0.806`	`31`	`8`	`0`	`1.000`
	`2`		B	`207`	`57`	`13682`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`206`	`55`	`13638`	`1866.0`	`-9.8`	`0.754`	`30`	`8`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1870.7`	`-9.2`	`0.780`	`31`	`8`	`0`	`1.000`
2	`3`		G	`84`	`24`	`6052`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`90`	`33`	`13450`	`816.3`	`-3.0`	`0.560`	`16`	`1`	`0`	`0.465`
	`4`		D	`79`	`24`	`6076`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`83`	`29`	`13682`	`788.5`	`-4.1`	`0.478`	`13`	`0`	`0`	`0.465`
	`5`		C	`76`	`24`	`6184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`86`	`30`	`13638`	`781.9`	`-2.7`	`0.576`	`15`	`1`	`0`	`0.465`
	`6`		H	`75`	`23`	`6004`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`82`	`29`	`13650`	`725.8`	`-3.6`	`0.557`	`14`	`0`	`0`	`0.465`
	*Average:*													`778.1`	`-3.4`	`0.543`	`15`	`1`	`0`	`0.465`
3	`7`		A	`52`	`16`	`13638`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`56`	`17`	`6076`	`523.0`	`-6.4`	`0.211`	`5`	`0`	`0`	`0.289`
	`8`		C	`52`	`15`	`6184`	`◊`	E	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`51`	`15`	`13450`	`513.1`	`-6.6`	`0.167`	`5`	`0`	`0`	`0.289`
	*Average:*													`518.1`	`-6.5`	`0.189`	`5`	`0`	`0`	`0.289`
4	`9`		C	`48`	`20`	`6184`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`52`	`19`	`13638`	`455.0`	`-0.3`	`0.709`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		D	`53`	`21`	`6076`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`54`	`19`	`13450`	`454.4`	`-0.4`	`0.707`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		G	`45`	`19`	`6052`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`53`	`19`	`13682`	`433.1`	`0.0`	`0.758`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`447.5`	`-0.2`	`0.725`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
5	`12`		[CHO]E:603	`23`	`1`	`646`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`43`	`12`	`13650`	`316.0`	`3.3`	`0.502`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[CHO]F:900	`23`	`1`	`642`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`42`	`13`	`13450`	`311.2`	`3.0`	`0.464`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[CHO]A:603	`23`	`1`	`646`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`12`	`13682`	`310.3`	`3.0`	`0.446`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[CHO]B:601	`23`	`1`	`643`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`41`	`13`	`13638`	`309.0`	`2.8`	`0.446`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`311.6`	`3.0`	`0.464`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`16`		G	`29`	`9`	`6052`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`13650`	`277.0`	`-2.5`	`0.297`	`2`	`0`	`0`	`0.160`
	`17`		C	`29`	`9`	`6184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`13682`	`274.9`	`-3.4`	`0.210`	`1`	`0`	`0`	`0.160`
	`18`		D	`26`	`9`	`6076`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`13638`	`270.3`	`-2.7`	`0.271`	`2`	`0`	`0`	`0.160`
	`19`		H	`28`	`8`	`6004`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`13450`	`252.1`	`-3.0`	`0.215`	`1`	`0`	`0`	`0.160`
	*Average:*													`268.6`	`-2.9`	`0.248`	`2`	`0`	`0`	`0.160`
7	`20`		G	`34`	`14`	`6052`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`13682`	`268.5`	`-1.8`	`0.508`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`21`		B	`24`	`9`	`13682`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`34`	`14`	`6076`	`265.3`	`-2.0`	`0.416`	`3`	`0`	`0`	`0.113`
	`22`		C	`37`	`14`	`6184`	`◊`	F	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`24`	`9`	`13650`	`260.0`	`-2.1`	`0.403`	`3`	`0`	`0`	`0.113`
	*Average:*													`262.7`	`-2.1`	`0.410`	`3`	`0`	`0`	`0.113`
9	`23`		E	`28`	`8`	`13450`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`27`	`8`	`13682`	`238.0`	`-0.9`	`0.657`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
	`24`		A	`27`	`8`	`13638`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`27`	`8`	`13638`	`230.4`	`-0.6`	`0.706`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`234.2`	`-0.7`	`0.681`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
10	`25`		[CHO]F:900	`17`	`1`	`642`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`13650`	`226.7`	`0.4`	`0.309`	`3`	`0`	`0`	`0.189`
	`26`		[CHO]A:603	`17`	`1`	`646`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`10`	`13638`	`225.1`	`0.3`	`0.300`	`4`	`0`	`0`	`0.189`
	`27`		[CHO]E:603	`17`	`1`	`646`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`13450`	`225.0`	`0.3`	`0.304`	`3`	`0`	`0`	`0.189`
	`28`		[CHO]B:601	`17`	`1`	`643`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`11`	`13682`	`224.6`	`0.3`	`0.299`	`3`	`0`	`0`	`0.189`
	*Average:*													`225.4`	`0.3`	`0.303`	`3`	`0`	`0`	`0.189`
11	`29`		B	`24`	`9`	`13682`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`25`	`9`	`13682`	`222.9`	`-2.6`	`0.393`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`30`		G	`19`	`6`	`6052`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`6184`	`169.6`	`1.8`	`0.801`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`31`		F	`21`	`8`	`13650`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`13638`	`154.1`	`-1.8`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`32`		B	`15`	`5`	`13682`	`◊`	E	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`15`	`5`	`13450`	`133.9`	`-1.6`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		A	`14`	`5`	`13638`	`◊`	F	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`14`	`5`	`13650`	`131.8`	`-1.4`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`132.8`	`-1.5`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`34`		E	`15`	`6`	`13450`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`15`	`6`	`13450`	`130.9`	`0.7`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`35`		[EDO]A:601	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`13638`	`108.1`	`3.6`	`0.517`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`36`		[EDO]E:601	`4`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`13450`	`107.6`	`3.6`	`0.519`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
18	`37`		[EDO]A:602	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`13638`	`95.6`	`2.3`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`38`		[EDO]E:602	`4`	`1`	`185`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`13450`	`94.3`	`2.1`	`0.466`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`39`		[EDO]H:700	`4`	`1`	`184`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`6004`	`93.6`	`2.9`	`0.486`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
21	`40`		[EDO]G:700	`4`	`1`	`184`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`6052`	`92.0`	`2.9`	`0.477`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
22	`41`		[EDO]D:700	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`6076`	`91.5`	`3.1`	`0.494`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
23	`42`		[EDO]C:700	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`6184`	`90.7`	`3.0`	`0.482`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
24	`43`		[EDO]C:700	`3`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`13638`	`59.5`	`1.3`	`0.248`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`44`		[EDO]G:700	`3`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`13450`	`56.8`	`1.1`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`45`		[EDO]D:700	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`13682`	`56.1`	`1.0`	`0.220`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`46`		[MG]B:602	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`13682`	`55.6`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.283`
28	`47`		[EDO]H:700	`3`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`13650`	`53.7`	`0.9`	`0.591`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`48`		[EDO]E:602	`2`	`1`	`185`	`f`	D	-x,y,-z	`2_555`	`5`	`3`	`6076`	`30.4`	`0.5`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`49`		[EDO]A:602	`2`	`1`	`186`	`f`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`2`	`1`	`6184`	`27.4`	`0.2`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`50`		G	`4`	`2`	`6052`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`2`	`6076`	`18.4`	`-0.0`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		C	`3`	`2`	`6184`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`3`	`2`	`6184`	`11.5`	`-0.3`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.0`	`-0.1`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`52`		F	`1`	`1`	`13650`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`3`	`2`	`13638`	`17.1`	`-0.0`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`53`		[MG]B:602	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13638`	`4.2`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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