PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=579-EA-2E7)

Interfaces in PDB 6yei crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.02 Å

ARABIDOPSIS THALIANA GLUTAMATE DEHYDROGENASE ISOFORM 1 IN COMPLEX WITH NAD

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`132`	`31`	`17902`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`133`	`34`	`17659`	`1227.0`	`-7.7`	`0.419`	`18`	`8`	`0`	`0.054`
	`2`		B	`121`	`28`	`17788`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`123`	`29`	`17476`	`1145.3`	`-9.8`	`0.293`	`16`	`6`	`0`	`0.054`
	*Average:*													`1186.1`	`-8.8`	`0.356`	`17`	`7`	`0`	`0.054`
2	`3`		F	`119`	`28`	`16635`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`122`	`28`	`17407`	`1104.6`	`-7.6`	`0.379`	`15`	`6`	`0`	`0.056`
3	`4`		F	`88`	`25`	`16635`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`92`	`31`	`17788`	`803.2`	`-6.9`	`0.329`	`9`	`2`	`0`	`0.027`
4	`5`		D	`84`	`31`	`17902`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`86`	`24`	`17788`	`749.4`	`-4.7`	`0.460`	`10`	`2`	`0`	`0.065`
	`6`		E	`82`	`23`	`17407`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`87`	`30`	`17659`	`730.2`	`-3.3`	`0.564`	`8`	`2`	`0`	`0.065`
	`7`		E	`80`	`29`	`17407`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`82`	`24`	`17476`	`725.8`	`-6.1`	`0.353`	`8`	`2`	`0`	`0.065`
	`8`		C	`87`	`24`	`17659`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`82`	`29`	`17476`	`717.3`	`-5.7`	`0.396`	`7`	`2`	`0`	`0.065`
	*Average:*													`730.7`	`-4.9`	`0.443`	`8`	`2`	`0`	`0.065`
5	`9`		F	`73`	`25`	`16635`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`72`	`22`	`17902`	`693.3`	`-6.4`	`0.272`	`7`	`2`	`0`	`0.038`
6	`10`		E	`64`	`20`	`17407`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`67`	`20`	`17902`	`607.9`	`1.4`	`0.805`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
7	`11`		[NAD]F:501	`44`	`1`	`827`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`80`	`30`	`16635`	`579.7`	`-8.3`	`0.455`	`15`	`0`	`0`	`0.058`
8	`12`		[NAD]D:502	`39`	`1`	`828`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`64`	`23`	`17902`	`478.0`	`-5.1`	`0.525`	`10`	`0`	`0`	`0.070`
	`13`		[NAD]B:501	`40`	`1`	`829`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`65`	`22`	`17788`	`477.0`	`-5.2`	`0.545`	`10`	`0`	`0`	`0.070`
	`14`		[NAD]A:501	`39`	`1`	`822`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`61`	`21`	`17476`	`471.6`	`-5.4`	`0.490`	`10`	`0`	`0`	`0.070`
	`15`		[NAD]C:501	`37`	`1`	`829`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`60`	`21`	`17659`	`470.5`	`-4.5`	`0.550`	`10`	`0`	`0`	`0.070`
	`16`		[NAD]E:502	`40`	`1`	`833`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`62`	`22`	`17407`	`462.6`	`-5.5`	`0.555`	`9`	`0`	`0`	`0.070`
	*Average:*													`471.9`	`-5.2`	`0.533`	`10`	`0`	`0`	`0.070`
9	`17`		A	`33`	`12`	`17476`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`34`	`9`	`17476`	`291.3`	`-2.7`	`0.397`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
10	`18`		A	`33`	`11`	`17476`	`◊`	C	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`31`	`11`	`17659`	`288.1`	`2.6`	`0.825`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
11	`19`		D	`35`	`13`	`17902`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`40`	`13`	`17788`	`270.4`	`-0.4`	`0.618`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
12	`20`		C	`30`	`10`	`17659`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`23`	`8`	`17788`	`237.0`	`3.5`	`0.921`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
13	`21`		E	`22`	`11`	`17407`	`◊`	C	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`20`	`10`	`17659`	`191.7`	`2.4`	`0.878`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
14	`22`		F	`22`	`5`	`16635`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`17476`	`189.0`	`-0.1`	`0.650`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		[MPD]B:503	`7`	`1`	`276`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`17788`	`187.7`	`-13.1`	`0.471`	`1`	`0`	`0`	`0.048`
16	`24`		C	`21`	`6`	`17659`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`17788`	`186.5`	`0.0`	`0.671`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
	`25`		E	`19`	`5`	`17407`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`17902`	`178.0`	`-0.1`	`0.645`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`182.2`	`-0.0`	`0.658`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
17	`26`		[MPD]E:503	`7`	`1`	`277`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`17407`	`186.1`	`-12.8`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
18	`27`		[MPD]A:503	`7`	`1`	`277`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`17476`	`185.6`	`-13.3`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
19	`28`		[MPD]D:503	`7`	`1`	`277`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`17902`	`185.6`	`-13.1`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
20	`29`		[MPD]C:503	`7`	`1`	`272`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`17659`	`184.8`	`-12.6`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
21	`30`		[MPD]B:504	`7`	`1`	`275`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`17788`	`157.6`	`-10.8`	`0.528`	`1`	`0`	`0`	`0.040`
22	`31`		[MPD]A:502	`7`	`1`	`279`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`17476`	`156.3`	`-10.5`	`0.602`	`2`	`0`	`0`	`0.046`
	`32`		[MPD]D:504	`7`	`1`	`277`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`17902`	`156.1`	`-10.4`	`0.617`	`3`	`0`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`156.2`	`-10.5`	`0.609`	`3`	`0`	`0`	`0.046`
23	`33`		[MPD]C:502	`7`	`1`	`278`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`17659`	`155.0`	`-10.3`	`0.626`	`2`	`0`	`0`	`0.035`
24	`34`		[MPD]D:506	`7`	`1`	`276`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`17902`	`154.9`	`-10.5`	`0.532`	`1`	`0`	`0`	`0.043`
25	`35`		[MPD]A:504	`7`	`1`	`278`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`17476`	`154.0`	`-10.6`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.033`
26	`36`		[MPD]B:502	`7`	`1`	`275`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`17788`	`153.7`	`-10.1`	`0.615`	`2`	`0`	`0`	`0.039`
27	`37`		[AKG]F:502	`10`	`1`	`279`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`25`	`15`	`16635`	`152.2`	`1.5`	`0.579`	`8`	`0`	`0`	`0.008`
28	`38`		[MRD]A:508	`7`	`1`	`275`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`17476`	`151.7`	`1.3`	`0.332`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`39`		[MRD]D:508	`7`	`1`	`275`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`12`	`17902`	`148.2`	`1.3`	`0.369`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`40`		[MRD]C:504	`7`	`1`	`270`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`17659`	`147.7`	`2.6`	`0.409`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		D	`16`	`7`	`17902`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`17`	`6`	`16635`	`147.3`	`1.1`	`0.750`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
32	`42`		[MRD]E:505	`7`	`1`	`276`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`17407`	`147.2`	`1.2`	`0.317`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[MRD]B:505	`7`	`1`	`275`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`17788`	`146.2`	`3.1`	`0.465`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`146.7`	`2.1`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`44`		[MPD]A:505	`7`	`1`	`277`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`17476`	`147.2`	`-8.2`	`0.870`	`1`	`0`	`0`	`0.026`
34	`45`		F	`16`	`5`	`16635`	`x`	F	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`13`	`4`	`16635`	`146.9`	`-1.4`	`0.328`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
35	`46`		[MPD]D:505	`7`	`1`	`270`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`17902`	`127.4`	`-8.5`	`0.608`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
36	`47`		[K]E:504	`1`	`1`	`216`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`17407`	`117.1`	`-85.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.639`
	`48`		[K]C:505	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`17659`	`117.0`	`-85.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.639`
	`49`		[K]A:506	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`17476`	`116.8`	`-85.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.639`
	`50`		[K]D:507	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`17902`	`116.6`	`-86.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.639`
	`51`		[K]A:507	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`17788`	`116.4`	`-84.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.639`
	*Average:*													`116.8`	`-85.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.639`
37	`52`		[K]E:506	`1`	`1`	`216`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`16635`	`116.4`	`-85.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.333`
38	`53`		[MPD]E:501	`6`	`1`	`280`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`17407`	`102.2`	`-5.8`	`0.801`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
39	`54`		[EDO]F:503	`4`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`16635`	`96.4`	`2.2`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`55`		E	`11`	`4`	`17407`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`4`	`16635`	`79.7`	`1.8`	`0.852`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
41	`56`		[MPD]E:501	`5`	`1`	`280`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17902`	`78.9`	`-3.5`	`0.910`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
42	`57`		[MPD]B:502	`5`	`1`	`275`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17902`	`77.4`	`-4.7`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
43	`58`		[MPD]C:502	`5`	`1`	`278`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17476`	`76.2`	`-4.5`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
44	`59`		[MPD]D:504	`5`	`1`	`277`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`16635`	`75.3`	`-4.4`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
45	`60`		[MPD]A:502	`5`	`1`	`279`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17407`	`74.0`	`-4.3`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
46	`61`		[EDO]D:501	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17902`	`65.3`	`1.2`	`0.769`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`62`		D	`6`	`2`	`17902`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`1`	`17788`	`62.4`	`-1.0`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`63`		[EDO]D:501	`3`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17407`	`55.3`	`2.3`	`0.318`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`64`		[AKG]F:502	`6`	`1`	`279`	`f`	[NAD]F:501	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`827`	`52.3`	`0.2`	`0.550`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`65`		[EDO]F:503	`3`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`17407`	`47.4`	`0.7`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`66`		[K]A:507	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17476`	`44.8`	`-22.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`67`		[K]D:507	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17659`	`44.0`	`-22.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`68`		[K]C:505	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17902`	`43.7`	`-22.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`69`		[K]E:506	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17407`	`43.5`	`-22.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`70`		[K]A:506	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17788`	`42.9`	`-22.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	*Average:*													`43.8`	`-22.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
52	`71`		[K]E:504	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`16635`	`43.1`	`-21.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
53	`72`		[EDO]D:501	`2`	`1`	`184`	`f`	[MPD]E:501	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`280`	`33.2`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
54	`73`		A	`7`	`3`	`17476`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`5`	`3`	`17788`	`31.6`	`0.1`	`0.675`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`74`		[EDO]F:503	`1`	`1`	`186`	`f`	[MPD]E:503	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`277`	`19.5`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
56	`75`		[MPD]C:503	`1`	`1`	`272`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17902`	`7.6`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
57	`76`		[MPD]E:501	`1`	`1`	`280`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16635`	`5.7`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`77`		D	`1`	`1`	`17902`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`17476`	`2.7`	`-0.1`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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