PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=887-KD-411)

Interfaces in PDB 6ysc crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.05 Å

GLYCOSYLATED KNOB-HOLE/DUMMY FC FRAGMENT

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`106`	`29`	`11742`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`104`	`29`	`11901`	`962.2`	`-15.4`	`0.058`	`11`	`4`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`69`	`21`	`11901`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`75`	`22`	`11742`	`654.7`	`-0.8`	`0.666`	`7`	`8`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`40`	`11`	`11742`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`44`	`15`	`11901`	`345.2`	`3.2`	`0.868`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`32`	`8`	`11901`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`41`	`10`	`11901`	`314.3`	`-2.2`	`0.441`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
5	`5`		[NAG]C:1	`13`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`11901`	`145.6`	`3.4`	`0.326`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		[NAG]D:1	`12`	`1`	`351`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`11742`	`143.8`	`4.0`	`0.400`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		[GAL]C:6	`10`	`1`	`297`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`11901`	`139.7`	`3.1`	`0.360`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		[GAL]D:6	`10`	`1`	`292`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`11742`	`137.4`	`3.0`	`0.371`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		[NAG]D:5	`11`	`1`	`353`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`11742`	`127.0`	`2.7`	`0.321`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		[NAG]C:5	`10`	`1`	`361`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`11901`	`124.3`	`2.5`	`0.321`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[NAG]C:2	`11`	`1`	`357`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`11901`	`116.8`	`2.1`	`0.254`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		[NAG]D:2	`11`	`1`	`363`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`11742`	`115.7`	`1.1`	`0.205`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		[MAN]C:4	`8`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]C:5	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`361`	`77.8`	`3.2`	`0.159`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[MAN]D:4	`7`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]D:5	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`353`	`69.2`	`2.5`	`0.181`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`73.5`	`2.8`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[FUC]D:8	`7`	`1`	`281`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11742`	`77.6`	`2.3`	`0.460`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[NAG]D:2	`10`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]D:1	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`351`	`75.8`	`2.1`	`0.095`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		[NAG]C:2	`9`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]C:1	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`358`	`75.3`	`2.1`	`0.104`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[FUC]C:8	`5`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11901`	`74.3`	`2.1`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[BMA]C:3	`7`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`11901`	`70.1`	`0.7`	`0.156`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[BMA]D:3	`8`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`11742`	`68.6`	`1.1`	`0.223`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[GAL]C:6	`5`	`1`	`297`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`3`	`11742`	`67.1`	`0.4`	`0.280`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[MAN]D:7	`8`	`1`	`296`	`cf`	[BMA]D:3	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`291`	`66.1`	`2.5`	`0.200`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[FUC]C:8	`7`	`1`	`281`	`cf`	[NAG]C:1	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`358`	`62.8`	`2.0`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[MAN]D:4	`5`	`1`	`289`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`11742`	`60.5`	`1.3`	`0.399`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[GAL]C:6	`8`	`1`	`297`	`cf`	[NAG]C:5	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`60.2`	`0.9`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[GAL]D:6	`8`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]D:5	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`353`	`59.4`	`1.0`	`0.078`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.8`	`1.0`	`0.076`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[BMA]D:3	`6`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]D:2	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`59.9`	`1.0`	`0.117`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[MAN]C:7	`7`	`1`	`295`	`cf`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`292`	`59.6`	`2.5`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[FUC]D:8	`6`	`1`	`281`	`cf`	[NAG]D:1	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`351`	`59.0`	`1.8`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		B	`8`	`2`	`11742`	`x`	B	x-1/2,-y+3/2,-z	`4_465`	`7`	`3`	`11742`	`58.8`	`0.4`	`0.707`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[BMA]C:3	`7`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`357`	`58.2`	`1.1`	`0.099`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[MAN]D:4	`7`	`1`	`289`	`f`	[NAG]D:2	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`56.8`	`1.7`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[MAN]C:4	`6`	`1`	`293`	`cf`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`292`	`52.2`	`2.3`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		A	`8`	`2`	`11901`	`◊`	[GAL]D:6	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`292`	`51.0`	`0.7`	`0.388`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[MAN]D:4	`6`	`1`	`289`	`cf`	[BMA]D:3	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`291`	`51.0`	`2.2`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[MAN]C:4	`7`	`1`	`293`	`f`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`357`	`49.5`	`1.8`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[MAN]C:4	`5`	`1`	`293`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11901`	`48.0`	`1.6`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[NAG]C:5	`5`	`1`	`361`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`6`	`1`	`11742`	`47.3`	`1.1`	`0.399`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		A	`1`	`1`	`11901`	`◊`	[NAG]D:5	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`353`	`2.7`	`0.0`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.0`	`0.6`	`0.346`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`40`		[FUC]D:8	`4`	`1`	`281`	`f`	[NAG]D:2	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`38.2`	`2.1`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`41`		[FUC]C:8	`4`	`1`	`281`	`f`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`357`	`37.7`	`1.9`	`0.300`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`42`		[MAN]C:7	`4`	`1`	`295`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11901`	`36.3`	`-0.3`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`43`		[FUC]C:8	`3`	`1`	`281`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`5`	`2`	`11901`	`33.6`	`0.5`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`44`		[MAN]D:7	`5`	`1`	`296`	`◊`	[MAN]C:7	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`295`	`32.9`	`-0.8`	`0.056`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`45`		[MAN]D:7	`4`	`1`	`296`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11742`	`23.9`	`-0.1`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		[BMA]C:3	`2`	`1`	`292`	`f`	[NAG]C:5	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`361`	`23.7`	`1.2`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`47`		[MAN]D:7	`3`	`1`	`296`	`f`	[NAG]D:2	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`363`	`15.6`	`0.3`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		[BMA]D:3	`2`	`1`	`291`	`f`	[NAG]D:5	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`353`	`15.6`	`0.7`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`49`		[MAN]D:7	`3`	`1`	`296`	`◊`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`292`	`15.4`	`-0.1`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`50`		[MAN]C:7	`2`	`1`	`295`	`f`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`357`	`14.2`	`0.5`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`51`		[MAN]C:7	`1`	`1`	`295`	`◊`	[BMA]D:3	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`291`	`12.2`	`-0.2`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`52`		[FUC]C:8	`1`	`1`	`281`	`f`	[MAN]C:4	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`293`	`11.2`	`-0.1`	`0.191`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		[FUC]D:8	`2`	`1`	`281`	`f`	[MAN]D:4	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`289`	`6.8`	`-0.1`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		[MAN]C:4	`1`	`1`	`293`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`11742`	`3.4`	`0.1`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		A	`1`	`1`	`11901`	`◊`	B	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`1`	`1`	`11742`	`1.1`	`-0.0`	`0.535`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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