PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=624-E6-APO)

Interfaces in PDB 6z74 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.00 Å

STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ATU1419 (VANR) IN COMPLEX WITH A FORTUITOUS CITRATE FROM AGROBACTERIUM FABRUM

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`136`	`41`	`11789`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`138`	`41`	`11664`	`1416.6`	`3.5`	`0.764`	`20`	`25`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`136`	`44`	`11974`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`141`	`41`	`11951`	`1359.0`	`1.9`	`0.706`	`19`	`24`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1387.8`	`2.7`	`0.735`	`20`	`25`	`0`	`0.000`
2	`3`		D	`76`	`23`	`11789`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`73`	`24`	`11951`	`685.1`	`3.7`	`0.817`	`12`	`19`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`63`	`21`	`11664`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`64`	`20`	`11974`	`557.6`	`0.5`	`0.638`	`7`	`11`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`621.4`	`2.1`	`0.728`	`10`	`15`	`0`	`0.000`
3	`5`		A	`46`	`14`	`11951`	`◊`	D	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`43`	`10`	`11789`	`441.8`	`-3.2`	`0.313`	`6`	`6`	`0`	`0.007`
4	`6`		A	`44`	`12`	`11951`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`43`	`11`	`11951`	`394.2`	`-1.4`	`0.473`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
5	`7`		B	`35`	`12`	`11974`	`◊`	C	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`39`	`13`	`11664`	`351.8`	`-2.9`	`0.268`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
6	`8`		D	`32`	`9`	`11789`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`11974`	`266.0`	`-1.8`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`28`	`9`	`11664`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`11951`	`262.2`	`-1.7`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`264.1`	`-1.7`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		[CIT]A:302	`12`	`1`	`315`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`18`	`11951`	`191.8`	`2.1`	`0.521`	`12`	`0`	`0`	`0.008`
8	`11`		[CIT]C:302	`12`	`1`	`310`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`29`	`14`	`11664`	`180.7`	`-0.5`	`0.280`	`10`	`0`	`0`	`0.011`
	`12`		[CIT]D:302	`12`	`1`	`306`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`31`	`14`	`11789`	`177.8`	`0.2`	`0.296`	`11`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`179.2`	`-0.2`	`0.288`	`11`	`0`	`0`	`0.011`
9	`13`		[CIT]B:302	`12`	`1`	`310`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`11974`	`179.1`	`-0.2`	`0.291`	`11`	`0`	`0`	`0.011`
10	`14`		B	`19`	`7`	`11974`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`9`	`11789`	`178.0`	`1.0`	`0.695`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		C	`16`	`4`	`11664`	`x`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`4_457`	`22`	`8`	`11664`	`166.0`	`-0.1`	`0.564`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
12	`16`		[GOL]A:303	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`11951`	`135.4`	`-0.6`	`0.477`	`3`	`0`	`0`	`0.005`
13	`17`		[PEG]C:303	`6`	`1`	`260`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`11664`	`109.8`	`2.6`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		[EDO]B:312	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`11974`	`108.2`	`2.8`	`0.430`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`19`		[EDO]A:313	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`11951`	`106.1`	`3.8`	`0.499`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		[EDO]A:312	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11951`	`105.3`	`3.2`	`0.454`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`21`		B	`11`	`3`	`11974`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`13`	`4`	`11951`	`104.1`	`-2.1`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		[EDO]B:311	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`11974`	`103.0`	`3.3`	`0.478`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
19	`23`		[EDO]A:306	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11951`	`102.1`	`2.0`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		[EDO]B:307	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`11974`	`96.4`	`2.4`	`0.409`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		[EDO]C:305	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`11664`	`93.9`	`2.4`	`0.247`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		[EDO]B:313	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`11974`	`92.6`	`3.1`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		B	`10`	`3`	`11974`	`f`	[PEG]C:303	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`7`	`1`	`260`	`90.0`	`0.8`	`0.138`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[EDO]C:306	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`11664`	`88.6`	`2.0`	`0.262`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`29`		[EDO]B:308	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`11974`	`84.4`	`2.2`	`0.425`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		[EDO]A:308	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`11951`	`84.4`	`1.7`	`0.203`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[EDO]C:304	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`11664`	`81.7`	`3.4`	`0.570`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
28	`32`		[EDO]A:304	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`11789`	`80.3`	`1.5`	`0.229`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11951`	`76.0`	`3.0`	`0.332`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		[EDO]A:311	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11951`	`75.7`	`2.6`	`0.529`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[EDO]A:309	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11951`	`75.6`	`1.8`	`0.820`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[EDO]A:310	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`11951`	`72.4`	`2.4`	`0.505`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[EDO]B:306	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`11974`	`72.2`	`1.7`	`0.276`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		[EDO]B:305	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11974`	`72.2`	`2.5`	`0.305`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[EDO]A:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11951`	`71.0`	`1.9`	`0.255`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`40`		[EDO]B:304	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`5`	`11789`	`70.4`	`2.3`	`0.866`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		[EDO]B:309	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`11974`	`69.9`	`1.3`	`0.665`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
38	`42`		[EDO]C:304	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`11789`	`67.6`	`1.3`	`0.172`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`43`		[EDO]B:310	`4`	`1`	`182`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`11974`	`67.2`	`2.4`	`0.279`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`44`		[EDO]B:308	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11951`	`65.7`	`1.2`	`0.199`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`45`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`11974`	`65.2`	`1.2`	`0.180`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		A	`12`	`6`	`11951`	`f`	[NA]D:303	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`125`	`64.7`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
43	`47`		[EDO]A:307	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`11951`	`64.7`	`2.1`	`0.287`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		[EDO]B:309	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`11951`	`64.4`	`2.1`	`0.293`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		[NA]D:304	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11789`	`64.4`	`-9.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
46	`50`		[SO4]B:303	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`11974`	`62.2`	`-8.1`	`0.582`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
47	`51`		[EDO]C:306	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`11974`	`60.2`	`2.4`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`52`		[EDO]A:309	`3`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`11789`	`54.4`	`1.7`	`0.279`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		[EDO]B:313	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11664`	`45.4`	`0.6`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`54`		[EDO]B:306	`3`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11951`	`39.8`	`1.0`	`0.762`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`55`		[EDO]A:311	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`6`	`2`	`11951`	`39.8`	`0.3`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`56`		[EDO]A:307	`3`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11789`	`39.4`	`-0.0`	`0.466`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`57`		[EDO]B:310	`4`	`1`	`182`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11664`	`38.7`	`-0.0`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`58`		[EDO]B:311	`3`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`11951`	`38.5`	`1.2`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`59`		[EDO]B:304	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11974`	`38.0`	`1.4`	`0.947`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
56	`60`		[EDO]A:310	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11974`	`37.8`	`1.2`	`0.294`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`61`		[EDO]A:313	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`11974`	`37.8`	`0.5`	`0.750`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`62`		A	`6`	`3`	`11951`	`◊`	C	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`7`	`4`	`11664`	`36.7`	`0.3`	`0.655`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`63`		[ZN]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11951`	`36.0`	`-26.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`64`		[ZN]B:301	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11974`	`35.0`	`-25.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`65`		[ZN]D:301	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11789`	`34.9`	`-25.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`66`		[ZN]C:301	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11664`	`34.8`	`-27.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	*Average:*													`35.2`	`-26.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
60	`67`		A	`5`	`3`	`11951`	`◊`	C	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`4`	`3`	`11664`	`34.8`	`-1.1`	`0.208`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`68`		A	`4`	`2`	`11951`	`◊`	[NA]D:304	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`125`	`32.0`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
62	`69`		[EDO]A:307	`3`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`11974`	`31.1`	`1.0`	`0.818`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`70`		[NA]D:303	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11789`	`30.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
64	`71`		[EDO]B:305	`2`	`1`	`184`	`f`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`11789`	`30.0`	`1.4`	`0.937`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`72`		[CIT]B:302	`5`	`1`	`310`	`f`	[ZN]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.7`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`73`		[CIT]D:302	`6`	`1`	`306`	`f`	[ZN]D:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.7`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`74`		[CIT]C:302	`5`	`1`	`310`	`f`	[ZN]C:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.4`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`29.6`	`-13.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
66	`75`		[EDO]B:306	`2`	`1`	`186`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`5`	`2`	`11951`	`29.4`	`0.8`	`0.559`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`76`		[CIT]A:302	`3`	`1`	`315`	`f`	[ZN]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`28.7`	`-11.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
68	`77`		[EDO]B:310	`3`	`1`	`182`	`◊`	[EDO]A:307	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`28.6`	`1.9`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`78`		[EDO]B:306	`4`	`1`	`186`	`f`	[EDO]A:310	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`27.8`	`1.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`79`		[EDO]A:311	`3`	`1`	`182`	`f`	[EDO]A:310	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`26.3`	`1.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`80`		[EDO]B:312	`3`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11951`	`25.1`	`1.5`	`0.967`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`81`		[EDO]B:310	`3`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`11951`	`24.6`	`1.0`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`82`		[EDO]A:308	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:306	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`19.3`	`0.6`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
74	`83`		[EDO]A:311	`2`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11974`	`19.1`	`0.4`	`0.752`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`84`		[EDO]B:313	`2`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11951`	`17.5`	`0.5`	`0.903`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`85`		B	`3`	`1`	`11974`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`4_457`	`1`	`1`	`11664`	`15.0`	`0.4`	`0.825`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`86`		[EDO]B:309	`1`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:305	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`14.6`	`0.6`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`87`		[EDO]B:306	`1`	`1`	`186`	`f`	[EDO]A:311	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`182`	`10.7`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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