PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=434-5G-12P)

Interfaces in PDB 7cab

STRUCTURAL BASIS FOR NEUTRALIZATION OF SARS-COV-2 AND SARS-COV BY A POTENT THERAPEUTIC ANTIBODY

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`636`	`185`	`52587`	`◊`	C	`641`	`179`	`52598`	`5995.2`	`-57.8`	`0.101`	`49`	`6`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`638`	`184`	`52600`	`◊`	B	`646`	`182`	`52587`	`5987.2`	`-57.9`	`0.104`	`49`	`6`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`641`	`182`	`52600`	`◊`	C	`634`	`182`	`52598`	`5981.8`	`-57.6`	`0.107`	`48`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`5988.1`	`-57.8`	`0.104`	`49`	`6`	`0`	`0.000`
2	`4`		C	`18`	`8`	`52598`	`c`	[NAG]C:1302	`12`	`1`	`354`	`175.0`	`4.2`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`18`	`8`	`52587`	`c`	[NAG]B:1302	`12`	`1`	`355`	`173.6`	`4.1`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`17`	`8`	`52600`	`c`	[NAG]A:1302	`12`	`1`	`353`	`173.4`	`4.2`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`174.0`	`4.2`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		C	`19`	`8`	`52598`	`c`	[NAG]C:1305	`10`	`1`	`356`	`152.7`	`4.4`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		A	`18`	`8`	`52600`	`c`	[NAG]A:1305	`10`	`1`	`356`	`152.1`	`4.4`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		B	`18`	`8`	`52587`	`c`	[NAG]B:1305	`10`	`1`	`354`	`151.5`	`4.5`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`152.1`	`4.4`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		C	`15`	`5`	`52598`	`c`	[NAG]Q:1	`12`	`1`	`360`	`134.6`	`2.9`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		A	`15`	`5`	`52600`	`c`	[NAG]G:1	`12`	`1`	`358`	`133.5`	`2.9`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`15`	`5`	`52587`	`c`	[NAG]L:1	`12`	`1`	`359`	`133.3`	`2.9`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`133.8`	`2.9`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		B	`15`	`8`	`52587`	`c`	[NAG]J:1	`12`	`1`	`362`	`129.4`	`2.8`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		C	`16`	`8`	`52598`	`c`	[NAG]O:1	`12`	`1`	`361`	`129.0`	`2.8`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		A	`16`	`8`	`52600`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`363`	`128.8`	`2.8`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`129.1`	`2.8`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`16`		C	`9`	`4`	`52598`	`c`	[NAG]C:1310	`11`	`1`	`350`	`121.2`	`3.0`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		B	`10`	`4`	`52587`	`c`	[NAG]B:1310	`11`	`1`	`351`	`120.9`	`3.0`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		A	`11`	`4`	`52600`	`c`	[NAG]A:1310	`11`	`1`	`349`	`120.9`	`3.0`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`121.0`	`3.0`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`19`		A	`17`	`6`	`52600`	`c`	[NAG]A:1304	`12`	`1`	`355`	`115.9`	`4.3`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		B	`16`	`6`	`52587`	`c`	[NAG]B:1304	`12`	`1`	`354`	`115.9`	`4.3`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		C	`16`	`6`	`52598`	`c`	[NAG]C:1304	`10`	`1`	`355`	`115.3`	`4.3`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`115.7`	`4.3`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`22`		B	`13`	`5`	`52587`	`c`	[NAG]B:1309	`9`	`1`	`363`	`109.1`	`2.8`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		C	`13`	`5`	`52598`	`c`	[NAG]C:1309	`9`	`1`	`362`	`108.8`	`2.8`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		A	`13`	`5`	`52600`	`c`	[NAG]A:1309	`9`	`1`	`362`	`108.7`	`2.8`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`108.9`	`2.8`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`25`		C	`11`	`4`	`52598`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`363`	`100.3`	`2.0`	`0.351`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		A	`11`	`4`	`52600`	`c`	[NAG]A:1301	`9`	`1`	`362`	`99.9`	`1.9`	`0.350`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		B	`11`	`4`	`52587`	`c`	[NAG]B:1301	`9`	`1`	`363`	`99.7`	`1.9`	`0.351`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`100.0`	`1.9`	`0.351`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`28`		B	`10`	`4`	`52587`	`c`	[NAG]K:1	`11`	`1`	`363`	`100.1`	`3.1`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		C	`10`	`4`	`52598`	`c`	[NAG]P:1	`11`	`1`	`363`	`100.0`	`3.0`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		A	`10`	`4`	`52600`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`362`	`100.0`	`3.1`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`100.0`	`3.1`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`31`		A	`12`	`5`	`52600`	`c`	[NAG]A:1307	`7`	`1`	`352`	`99.9`	`3.7`	`0.598`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`12`	`5`	`52587`	`c`	[NAG]B:1307	`7`	`1`	`353`	`99.6`	`3.7`	`0.589`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		C	`13`	`5`	`52598`	`c`	[NAG]C:1307	`7`	`1`	`353`	`99.3`	`3.7`	`0.588`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`99.6`	`3.7`	`0.592`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`34`		B	`10`	`3`	`52587`	`c`	[NAG]B:1303	`7`	`1`	`366`	`98.6`	`3.7`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		A	`10`	`3`	`52600`	`c`	[NAG]A:1303	`7`	`1`	`364`	`98.2`	`3.7`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		C	`10`	`3`	`52598`	`c`	[NAG]C:1303	`7`	`1`	`365`	`97.8`	`3.7`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`98.2`	`3.7`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`37`		A	`12`	`4`	`52600`	`c`	[NAG]D:1	`11`	`1`	`358`	`96.6`	`2.1`	`0.264`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		B	`12`	`4`	`52587`	`c`	[NAG]I:1	`11`	`1`	`361`	`96.4`	`2.0`	`0.258`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		C	`12`	`4`	`52598`	`c`	[NAG]N:1	`11`	`1`	`361`	`96.2`	`2.0`	`0.266`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`96.4`	`2.0`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`40`		C	`12`	`3`	`52598`	`c`	[NAG]C:1308	`6`	`1`	`358`	`92.7`	`3.7`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		B	`12`	`3`	`52587`	`c`	[NAG]B:1308	`6`	`1`	`358`	`92.7`	`3.7`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		A	`12`	`3`	`52600`	`c`	[NAG]A:1308	`6`	`1`	`358`	`92.5`	`3.7`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`92.6`	`3.7`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`43`		C	`14`	`6`	`52598`	`◊`	[NAG]D:1	`7`	`1`	`358`	`92.5`	`3.8`	`0.622`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		B	`14`	`6`	`52587`	`◊`	[NAG]N:1	`7`	`1`	`361`	`91.9`	`3.8`	`0.635`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		A	`14`	`6`	`52600`	`◊`	[NAG]I:1	`7`	`1`	`361`	`91.9`	`3.8`	`0.621`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`92.1`	`3.8`	`0.626`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`46`		B	`8`	`2`	`52587`	`c`	[NAG]B:1306	`7`	`1`	`357`	`85.4`	`3.1`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`47`		A	`8`	`2`	`52600`	`c`	[NAG]A:1306	`8`	`1`	`365`	`84.1`	`2.1`	`0.363`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`48`		C	`7`	`2`	`52598`	`c`	[NAG]C:1306	`9`	`1`	`362`	`79.6`	`2.2`	`0.264`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`49`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]I:2	`9`	`1`	`365`	`75.7`	`2.1`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`364`	`75.7`	`2.1`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`363`	`74.7`	`2.0`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`75.4`	`2.1`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`52`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`356`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`360`	`73.7`	`2.4`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]H:1	`6`	`1`	`356`	`c`	[NAG]H:2	`8`	`1`	`359`	`73.4`	`2.5`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`355`	`c`	[NAG]R:2	`8`	`1`	`360`	`73.4`	`2.4`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.5`	`2.4`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`55`		[NAG]P:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]P:2	`8`	`1`	`361`	`72.7`	`2.1`	`0.119`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`56`		B	`7`	`3`	`52587`	`◊`	[NAG]J:2	`6`	`1`	`363`	`71.7`	`1.6`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		A	`7`	`3`	`52600`	`◊`	[NAG]E:2	`6`	`1`	`366`	`71.5`	`1.6`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		C	`7`	`3`	`52598`	`◊`	[NAG]O:2	`6`	`1`	`363`	`71.2`	`1.5`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.5`	`1.6`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`59`		[NAG]K:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`363`	`71.0`	`1.7`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]E:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]E:2	`10`	`1`	`366`	`68.4`	`1.5`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[NAG]J:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]J:2	`10`	`1`	`363`	`67.5`	`1.4`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]O:1	`5`	`1`	`361`	`c`	[NAG]O:2	`10`	`1`	`363`	`67.5`	`1.5`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.6`	`1.5`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`63`		B	`8`	`4`	`52587`	`c`	[NAG]M:1	`7`	`1`	`356`	`69.7`	`2.4`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		C	`9`	`4`	`52598`	`c`	[NAG]R:1	`7`	`1`	`355`	`69.3`	`2.4`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		A	`8`	`4`	`52600`	`c`	[NAG]H:1	`7`	`1`	`356`	`68.6`	`2.4`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`69.2`	`2.4`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`66`		[NAG]F:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]F:2	`8`	`1`	`362`	`69.5`	`1.7`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`67`		[NAG]L:1	`6`	`1`	`359`	`c`	[NAG]L:2	`9`	`1`	`361`	`65.6`	`1.3`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[NAG]G:1	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`361`	`65.5`	`1.2`	`0.081`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]Q:2	`9`	`1`	`361`	`65.4`	`1.3`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.5`	`1.3`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`70`		C	`8`	`4`	`52598`	`◊`	[NAG]P:2	`3`	`1`	`361`	`46.1`	`1.7`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`71`		B	`4`	`1`	`52587`	`◊`	[NAG]L:2	`6`	`1`	`361`	`44.2`	`1.5`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		C	`4`	`1`	`52598`	`◊`	[NAG]Q:2	`6`	`1`	`361`	`44.0`	`1.5`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		A	`4`	`1`	`52600`	`◊`	[NAG]G:2	`6`	`1`	`361`	`43.6`	`1.5`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`43.9`	`1.5`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`74`		C	`6`	`2`	`52598`	`◊`	[NAG]D:2	`4`	`1`	`363`	`40.8`	`0.2`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		B	`6`	`2`	`52587`	`◊`	[NAG]N:2	`4`	`1`	`364`	`40.8`	`0.2`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		A	`6`	`2`	`52600`	`◊`	[NAG]I:2	`4`	`1`	`365`	`40.7`	`0.2`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`40.8`	`0.2`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`77`		C	`2`	`1`	`52598`	`◊`	[NAG]B:1309	`6`	`1`	`363`	`30.5`	`0.4`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		B	`2`	`1`	`52587`	`◊`	[NAG]A:1309	`6`	`1`	`362`	`30.2`	`0.4`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		A	`2`	`1`	`52600`	`◊`	[NAG]C:1309	`6`	`1`	`362`	`30.2`	`0.4`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`30.3`	`0.4`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`80`		A	`4`	`2`	`52600`	`◊`	[NAG]F:2	`1`	`1`	`362`	`27.8`	`0.9`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`81`		B	`4`	`2`	`52587`	`◊`	[NAG]K:2	`2`	`1`	`363`	`27.4`	`0.9`	`0.658`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`82`		B	`6`	`2`	`52587`	`◊`	[NAG]I:2	`3`	`1`	`365`	`19.1`	`0.4`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		A	`6`	`2`	`52600`	`◊`	[NAG]D:2	`3`	`1`	`363`	`19.0`	`0.5`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		C	`6`	`2`	`52598`	`◊`	[NAG]N:2	`3`	`1`	`364`	`18.8`	`0.5`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.0`	`0.5`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`85`		C	`1`	`1`	`52598`	`◊`	[NAG]B:1310	`2`	`1`	`351`	`18.1`	`0.8`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		B	`1`	`1`	`52587`	`◊`	[NAG]A:1310	`3`	`1`	`349`	`18.0`	`0.7`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		A	`1`	`1`	`52600`	`◊`	[NAG]C:1310	`2`	`1`	`350`	`17.9`	`0.8`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`18.0`	`0.8`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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