PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=372-72-HO5)

Interfaces in PDB 7jy8

ANALYSIS OF A STRAND EXCHANGE REACTION WITH A MINI FILAMENT OF 9-RECA, 27-MER SSDNA, PARTIALLY-HOMOLOGOUS 67 BP DSDNA AND ATPGAMMAS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`227`	`56`	`18466`	`◊`	B	`239`	`65`	`18285`	`2126.0`	`-25.2`	`0.150`	`7`	`4`	`0`	`0.000`
	`2`		G	`225`	`55`	`18315`	`◊`	H	`236`	`63`	`18452`	`2097.1`	`-23.9`	`0.135`	`10`	`3`	`0`	`0.000`
	`3`		D	`231`	`57`	`18172`	`◊`	E	`230`	`65`	`18205`	`2092.5`	`-26.7`	`0.095`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`4`		E	`226`	`57`	`18205`	`◊`	F	`230`	`63`	`18373`	`2092.2`	`-26.0`	`0.107`	`7`	`4`	`0`	`0.000`
	`5`		H	`226`	`58`	`18452`	`◊`	I	`225`	`61`	`15478`	`2089.1`	`-26.5`	`0.077`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
	`6`		F	`225`	`55`	`18373`	`◊`	G	`232`	`63`	`18315`	`2071.8`	`-26.5`	`0.085`	`10`	`4`	`0`	`0.000`
	`7`		B	`223`	`56`	`18285`	`◊`	C	`233`	`65`	`18391`	`2054.7`	`-26.9`	`0.084`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`219`	`55`	`18391`	`◊`	D	`234`	`65`	`18172`	`2043.4`	`-27.3`	`0.070`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`2083.4`	`-26.1`	`0.100`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
2	`9`		F	`63`	`21`	`18373`	`◊`	S	`65`	`6`	`7332`	`574.5`	`-15.0`	`0.392`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
3	`10`		H	`63`	`21`	`18452`	`◊`	S	`66`	`6`	`7332`	`574.3`	`-15.2`	`0.390`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`11`		G	`63`	`20`	`18315`	`◊`	S	`63`	`6`	`7332`	`560.6`	`-13.7`	`0.404`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`12`		B	`61`	`21`	`18285`	`◊`	S	`68`	`7`	`7332`	`552.4`	`-14.0`	`0.409`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`13`		C	`62`	`21`	`18391`	`◊`	S	`64`	`6`	`7332`	`549.8`	`-14.0`	`0.397`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		D	`66`	`21`	`18172`	`◊`	S	`67`	`6`	`7332`	`544.4`	`-13.7`	`0.436`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		E	`64`	`22`	`18205`	`◊`	S	`63`	`6`	`7332`	`542.9`	`-13.8`	`0.430`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`16`		A	`58`	`18`	`18466`	`◊`	S	`48`	`5`	`7332`	`462.2`	`-10.4`	`0.558`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		I	`54`	`20`	`15478`	`◊`	S	`46`	`4`	`7332`	`447.7`	`-10.4`	`0.338`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		S	`55`	`11`	`7332`	`◊`	T	`34`	`10`	`2923`	`440.3`	`-7.2`	`0.601`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
12	`19`		A	`60`	`21`	`18466`	`◊`	[AGS]A:402	`30`	`1`	`642`	`368.6`	`-6.9`	`0.512`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		C	`56`	`17`	`18391`	`◊`	[AGS]C:402	`31`	`1`	`645`	`342.9`	`-5.1`	`0.586`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		B	`55`	`17`	`18285`	`◊`	[AGS]B:402	`31`	`1`	`652`	`342.1`	`-5.6`	`0.574`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		D	`55`	`17`	`18172`	`◊`	[AGS]D:402	`31`	`1`	`645`	`340.8`	`-5.4`	`0.585`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		H	`55`	`16`	`18452`	`◊`	[AGS]H:402	`31`	`1`	`644`	`340.3`	`-5.1`	`0.573`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		I	`55`	`17`	`15478`	`◊`	[AGS]I:402	`31`	`1`	`646`	`339.9`	`-5.4`	`0.549`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		F	`56`	`17`	`18373`	`◊`	[AGS]F:402	`30`	`1`	`645`	`339.5`	`-5.4`	`0.572`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		E	`56`	`17`	`18205`	`◊`	[AGS]E:402	`30`	`1`	`643`	`338.9`	`-5.2`	`0.593`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		G	`54`	`17`	`18315`	`◊`	[AGS]G:402	`31`	`1`	`643`	`338.4`	`-4.9`	`0.573`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`343.5`	`-5.4`	`0.568`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
13	`28`		C	`28`	`8`	`18391`	`◊`	T	`44`	`6`	`2923`	`275.8`	`2.7`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`29`		D	`26`	`8`	`18172`	`◊`	T	`39`	`5`	`2923`	`264.4`	`2.5`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`30`		B	`20`	`6`	`18285`	`◊`	T	`33`	`4`	`2923`	`226.2`	`1.3`	`0.185`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`31`		A	`33`	`10`	`18466`	`◊`	[AGS]B:402	`19`	`1`	`652`	`211.5`	`-3.0`	`0.540`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		H	`32`	`10`	`18452`	`◊`	[AGS]I:402	`19`	`1`	`646`	`208.6`	`-3.1`	`0.516`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		F	`32`	`10`	`18373`	`◊`	[AGS]G:402	`19`	`1`	`643`	`208.3`	`-3.0`	`0.525`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		D	`31`	`10`	`18172`	`◊`	[AGS]E:402	`19`	`1`	`643`	`208.2`	`-3.0`	`0.530`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		C	`33`	`10`	`18391`	`◊`	[AGS]D:402	`19`	`1`	`645`	`207.8`	`-2.8`	`0.568`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		G	`33`	`10`	`18315`	`◊`	[AGS]H:402	`19`	`1`	`644`	`207.1`	`-2.9`	`0.523`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		B	`32`	`10`	`18285`	`◊`	[AGS]C:402	`19`	`1`	`645`	`206.9`	`-3.0`	`0.531`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		E	`30`	`10`	`18205`	`◊`	[AGS]F:402	`19`	`1`	`645`	`206.7`	`-3.0`	`0.531`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`208.1`	`-3.0`	`0.533`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`39`		A	`13`	`3`	`18466`	`◊`	T	`18`	`2`	`2923`	`128.5`	`1.7`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`40`		E	`10`	`3`	`18205`	`◊`	T	`15`	`3`	`2923`	`104.3`	`0.7`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`41`		A	`11`	`5`	`18466`	`◊`	[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`41.0`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		F	`12`	`5`	`18373`	`◊`	[MG]F:401	`1`	`1`	`98`	`40.4`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		B	`10`	`5`	`18285`	`◊`	[MG]B:401	`1`	`1`	`98`	`39.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		E	`11`	`5`	`18205`	`◊`	[MG]E:401	`1`	`1`	`98`	`39.2`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		C	`11`	`5`	`18391`	`◊`	[MG]C:401	`1`	`1`	`98`	`38.7`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		D	`11`	`5`	`18172`	`◊`	[MG]D:401	`1`	`1`	`98`	`38.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		I	`11`	`5`	`15478`	`◊`	[MG]I:401	`1`	`1`	`98`	`38.0`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		G	`10`	`4`	`18315`	`◊`	[MG]G:401	`1`	`1`	`98`	`37.9`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		H	`12`	`5`	`18452`	`◊`	[MG]H:401	`1`	`1`	`98`	`37.7`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`39.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`50`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]A:402	`4`	`1`	`642`	`33.6`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[MG]H:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]H:402	`5`	`1`	`644`	`33.2`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[MG]G:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]G:402	`5`	`1`	`643`	`33.0`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[MG]C:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]C:402	`3`	`1`	`645`	`32.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[MG]E:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]E:402	`5`	`1`	`643`	`32.4`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[MG]F:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]F:402	`3`	`1`	`645`	`32.4`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[MG]D:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]D:402	`4`	`1`	`645`	`32.4`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[MG]I:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]I:402	`5`	`1`	`646`	`32.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[MG]B:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	[AGS]B:402	`3`	`1`	`652`	`32.0`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`32.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`59`		C	`3`	`1`	`18391`	`◊`	E	`4`	`1`	`18205`	`30.9`	`0.5`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		D	`4`	`2`	`18172`	`◊`	F	`3`	`1`	`18373`	`30.3`	`0.8`	`0.847`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		F	`3`	`1`	`18373`	`◊`	H	`2`	`1`	`18452`	`28.2`	`0.6`	`0.836`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		B	`4`	`1`	`18285`	`◊`	D	`1`	`1`	`18172`	`27.6`	`0.6`	`0.861`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		A	`4`	`1`	`18466`	`◊`	C	`3`	`1`	`18391`	`27.0`	`0.5`	`0.802`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		E	`4`	`1`	`18205`	`◊`	G	`2`	`1`	`18315`	`25.7`	`0.5`	`0.819`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		G	`4`	`1`	`18315`	`◊`	I	`3`	`1`	`15478`	`25.0`	`0.3`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.8`	`0.6`	`0.817`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`66`		G	`2`	`1`	`18315`	`◊`	[MG]H:401	`1`	`1`	`98`	`15.6`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		F	`2`	`1`	`18373`	`◊`	[MG]G:401	`1`	`1`	`98`	`15.6`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		H	`2`	`1`	`18452`	`◊`	[MG]I:401	`1`	`1`	`98`	`15.6`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		C	`2`	`1`	`18391`	`◊`	[MG]D:401	`1`	`1`	`98`	`15.2`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		D	`2`	`1`	`18172`	`◊`	[MG]E:401	`1`	`1`	`98`	`15.1`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		B	`2`	`1`	`18285`	`◊`	[MG]C:401	`1`	`1`	`98`	`15.1`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		E	`2`	`1`	`18205`	`◊`	[MG]F:401	`1`	`1`	`98`	`14.4`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		A	`2`	`1`	`18466`	`◊`	[MG]B:401	`1`	`1`	`98`	`13.5`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`15.0`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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