PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=254-DD-4J4)

Interfaces in PDB 7k4n

SARS-COV-2 SPIKE IN COMPLEX WITH THE S2E12 NEUTRALIZING ANTIBODY FAB FRAGMENT

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`449`	`131`	`49874`	`◊`	E	`410`	`118`	`49873`	`3937.7`	`-47.0`	`0.517`	`32`	`7`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`409`	`118`	`49919`	`◊`	E	`452`	`132`	`49873`	`3933.8`	`-47.0`	`0.544`	`32`	`7`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`410`	`118`	`49874`	`◊`	B	`449`	`130`	`49919`	`3909.4`	`-46.1`	`0.575`	`32`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`3927.0`	`-46.7`	`0.545`	`32`	`7`	`0`	`0.000`
2	`4`		E	`18`	`8`	`49873`	`c`	[NAG]W:1	`11`	`1`	`363`	`138.6`	`3.3`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		A	`18`	`8`	`49874`	`c`	[NAG]M:1	`11`	`1`	`364`	`138.5`	`3.3`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`18`	`8`	`49919`	`c`	[NAG]R:1	`11`	`1`	`366`	`138.4`	`3.4`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`138.5`	`3.3`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		E	`16`	`7`	`49873`	`c`	[NAG]T:1	`12`	`1`	`367`	`135.8`	`2.5`	`0.298`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		A	`16`	`7`	`49874`	`c`	[NAG]I:1	`12`	`1`	`366`	`135.3`	`2.4`	`0.301`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		B	`16`	`7`	`49919`	`c`	[NAG]O:1	`12`	`1`	`366`	`134.9`	`2.4`	`0.282`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`135.3`	`2.4`	`0.293`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		A	`14`	`8`	`49874`	`c`	[NAG]A:1307	`12`	`1`	`363`	`124.3`	`3.4`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`14`	`8`	`49919`	`c`	[NAG]B:1307	`12`	`1`	`362`	`124.3`	`3.4`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		E	`14`	`8`	`49873`	`c`	[NAG]E:1307	`11`	`1`	`363`	`123.1`	`3.4`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`123.9`	`3.4`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		E	`11`	`4`	`49873`	`c`	[NAG]E:1304	`11`	`1`	`364`	`123.7`	`3.8`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		B	`11`	`4`	`49919`	`c`	[NAG]B:1304	`11`	`1`	`364`	`123.4`	`3.8`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		A	`10`	`4`	`49874`	`c`	[NAG]A:1304	`11`	`1`	`365`	`123.3`	`3.8`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`123.5`	`3.8`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`16`		A	`26`	`6`	`49874`	`c`	[NAG]A:1305	`10`	`1`	`368`	`122.7`	`3.5`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		B	`25`	`6`	`49919`	`c`	[NAG]B:1305	`10`	`1`	`367`	`122.5`	`3.5`	`0.569`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		E	`25`	`6`	`49873`	`c`	[NAG]E:1305	`10`	`1`	`367`	`122.3`	`3.5`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`122.5`	`3.5`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`19`		B	`19`	`6`	`49919`	`c`	[NAG]B:1310	`10`	`1`	`362`	`121.9`	`3.4`	`0.532`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		A	`18`	`6`	`49874`	`c`	[NAG]A:1310	`10`	`1`	`365`	`121.7`	`3.4`	`0.504`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		E	`18`	`6`	`49873`	`c`	[NAG]E:1310	`10`	`1`	`363`	`120.8`	`3.4`	`0.505`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`121.5`	`3.4`	`0.513`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`22`		B	`14`	`6`	`49919`	`c`	[NAG]P:1	`11`	`1`	`366`	`117.0`	`2.9`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		E	`13`	`6`	`49873`	`c`	[NAG]U:1	`12`	`1`	`365`	`116.9`	`2.9`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		A	`13`	`6`	`49874`	`c`	[NAG]J:1	`11`	`1`	`364`	`116.9`	`2.9`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`116.9`	`2.9`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`25`		E	`10`	`6`	`49873`	`◊`	G	`11`	`4`	`5852`	`111.6`	`-2.0`	`0.416`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		B	`10`	`6`	`49919`	`◊`	D	`11`	`4`	`5853`	`111.1`	`-2.0`	`0.440`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		A	`10`	`6`	`49874`	`◊`	L	`11`	`4`	`5847`	`110.9`	`-2.0`	`0.435`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`111.2`	`-2.0`	`0.430`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`28`		A	`11`	`4`	`49874`	`c`	[NAG]A:1311	`9`	`1`	`367`	`106.9`	`2.7`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		B	`11`	`4`	`49919`	`c`	[NAG]B:1311	`9`	`1`	`366`	`106.9`	`2.7`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		E	`11`	`4`	`49873`	`c`	[NAG]E:1311	`9`	`1`	`366`	`106.9`	`2.7`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`106.9`	`2.7`	`0.483`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`31`		B	`13`	`5`	`49919`	`c`	[NAG]S:1	`9`	`1`	`364`	`106.3`	`3.3`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		A	`13`	`5`	`49874`	`c`	[NAG]N:1	`10`	`1`	`363`	`106.0`	`3.3`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		E	`13`	`5`	`49873`	`c`	[NAG]X:1	`10`	`1`	`362`	`105.4`	`3.2`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`105.9`	`3.2`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`34`		B	`12`	`4`	`49919`	`c`	[NAG]B:1309	`7`	`1`	`367`	`103.2`	`3.4`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		E	`12`	`4`	`49873`	`c`	[NAG]E:1309	`7`	`1`	`368`	`102.8`	`3.4`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		A	`12`	`4`	`49874`	`c`	[NAG]A:1309	`7`	`1`	`367`	`102.2`	`3.4`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`102.7`	`3.4`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`37`		B	`11`	`4`	`49919`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`368`	`100.9`	`3.5`	`0.466`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		E	`11`	`4`	`49873`	`c`	[NAG]E:1301	`10`	`1`	`368`	`100.3`	`3.5`	`0.465`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		A	`11`	`4`	`49874`	`c`	[NAG]A:1301	`10`	`1`	`367`	`100.2`	`3.5`	`0.466`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`100.5`	`3.5`	`0.466`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`40`		A	`11`	`3`	`49874`	`c`	[NAG]A:1303	`7`	`1`	`368`	`98.9`	`4.8`	`0.714`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		B	`11`	`3`	`49919`	`c`	[NAG]B:1303	`7`	`1`	`367`	`98.4`	`4.8`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		E	`11`	`3`	`49873`	`c`	[NAG]E:1303	`7`	`1`	`368`	`98.2`	`4.8`	`0.714`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`98.5`	`4.8`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`43`		E	`12`	`4`	`49873`	`c`	[NAG]V:1	`8`	`1`	`365`	`97.9`	`3.0`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		B	`11`	`4`	`49919`	`c`	[NAG]Q:1	`9`	`1`	`366`	`97.7`	`3.0`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		A	`11`	`4`	`49874`	`c`	[NAG]K:1	`8`	`1`	`365`	`97.4`	`3.0`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`97.7`	`3.0`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`46`		A	`9`	`3`	`49874`	`c`	[NAG]A:1308	`10`	`1`	`365`	`96.9`	`1.9`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		E	`9`	`3`	`49873`	`c`	[NAG]E:1308	`10`	`1`	`364`	`95.3`	`1.9`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		B	`8`	`3`	`49919`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`364`	`93.2`	`2.1`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`95.2`	`2.0`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`49`		E	`12`	`5`	`49873`	`c`	[NAG]E:1306	`9`	`1`	`365`	`94.4`	`2.5`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		B	`11`	`4`	`49919`	`c`	[NAG]B:1306	`9`	`1`	`364`	`94.2`	`2.6`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		A	`12`	`5`	`49874`	`c`	[NAG]A:1306	`9`	`1`	`364`	`94.2`	`2.6`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`94.3`	`2.6`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`52`		A	`8`	`2`	`49874`	`c`	[NAG]A:1302	`9`	`1`	`367`	`84.0`	`2.4`	`0.347`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		E	`8`	`2`	`49873`	`c`	[NAG]E:1302	`9`	`1`	`368`	`83.9`	`2.4`	`0.347`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		B	`8`	`2`	`49919`	`c`	[NAG]B:1302	`9`	`1`	`366`	`83.5`	`2.4`	`0.370`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`83.8`	`2.4`	`0.355`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`55`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]Q:2	`9`	`1`	`364`	`72.1`	`2.1`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`364`	`71.3`	`2.1`	`0.115`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]V:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]V:2	`9`	`1`	`363`	`71.2`	`2.1`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.5`	`2.1`	`0.118`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`58`		B	`9`	`4`	`49919`	`◊`	[NAG]O:2	`5`	`1`	`368`	`71.6`	`1.6`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		A	`9`	`4`	`49874`	`◊`	[NAG]I:2	`5`	`1`	`365`	`71.2`	`1.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		E	`9`	`4`	`49873`	`◊`	[NAG]T:2	`5`	`1`	`367`	`70.6`	`1.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.1`	`1.6`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`61`		[NAG]W:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]W:2	`8`	`1`	`369`	`67.9`	`1.4`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]R:2	`8`	`1`	`367`	`67.3`	`1.3`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`367`	`66.9`	`1.3`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.4`	`1.3`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`64`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]N:2	`10`	`1`	`366`	`66.8`	`1.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]S:1	`7`	`1`	`364`	`c`	[NAG]S:2	`9`	`1`	`368`	`66.8`	`1.4`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[NAG]X:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]X:2	`9`	`1`	`367`	`66.7`	`1.4`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[NAG]T:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]T:2	`9`	`1`	`367`	`64.6`	`1.3`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`368`	`64.4`	`1.3`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]I:2	`9`	`1`	`365`	`63.9`	`1.2`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.5`	`1.3`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`70`		[NAG]P:1	`7`	`1`	`366`	`c`	[NAG]P:2	`8`	`1`	`369`	`65.5`	`1.0`	`0.065`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[NAG]U:1	`7`	`1`	`365`	`c`	[NAG]U:2	`8`	`1`	`365`	`65.1`	`1.0`	`0.072`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		[NAG]J:1	`7`	`1`	`364`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`367`	`65.0`	`1.0`	`0.065`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.2`	`1.0`	`0.067`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`73`		A	`4`	`2`	`49874`	`◊`	[NAG]N:2	`2`	`1`	`366`	`22.4`	`0.9`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		E	`4`	`2`	`49873`	`◊`	[NAG]X:2	`2`	`1`	`367`	`22.3`	`0.9`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		B	`4`	`2`	`49919`	`◊`	[NAG]S:2	`2`	`1`	`368`	`21.8`	`0.9`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`22.2`	`0.9`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`76`		B	`2`	`2`	`49919`	`◊`	[NAG]E:1308	`5`	`1`	`364`	`20.9`	`0.6`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		E	`2`	`2`	`49873`	`◊`	[NAG]A:1308	`5`	`1`	`365`	`20.8`	`0.6`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		A	`2`	`2`	`49874`	`◊`	[NAG]B:1308	`5`	`1`	`364`	`20.5`	`0.5`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`20.7`	`0.6`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`79`		A	`2`	`1`	`49874`	`◊`	[NAG]B:1309	`3`	`1`	`367`	`20.0`	`0.3`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		E	`2`	`1`	`49873`	`◊`	[NAG]A:1309	`3`	`1`	`367`	`19.7`	`0.3`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`81`		B	`2`	`1`	`49919`	`◊`	[NAG]E:1309	`3`	`1`	`368`	`19.6`	`0.3`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.8`	`0.3`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`82`		B	`1`	`1`	`49919`	`◊`	[NAG]A:1311	`6`	`1`	`367`	`19.1`	`0.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		E	`1`	`1`	`49873`	`◊`	[NAG]B:1311	`6`	`1`	`366`	`18.9`	`0.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		A	`1`	`1`	`49874`	`◊`	[NAG]E:1311	`6`	`1`	`366`	`18.7`	`0.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`18.9`	`0.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`85`		A	`1`	`1`	`49874`	`◊`	[NAG]E:1304	`2`	`1`	`364`	`17.4`	`0.7`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		B	`1`	`1`	`49919`	`◊`	[NAG]A:1304	`2`	`1`	`365`	`17.3`	`0.7`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		E	`1`	`1`	`49873`	`◊`	[NAG]B:1304	`2`	`1`	`364`	`17.1`	`0.7`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.3`	`0.7`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`88`		B	`2`	`2`	`49919`	`◊`	[NAG]R:2	`3`	`1`	`367`	`10.4`	`0.1`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		A	`2`	`2`	`49874`	`◊`	[NAG]M:2	`3`	`1`	`367`	`10.2`	`0.1`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		E	`2`	`2`	`49873`	`◊`	[NAG]W:2	`3`	`1`	`369`	`10.1`	`0.1`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`10.3`	`0.1`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`91`		E	`2`	`1`	`49873`	`◊`	[NAG]A:1301	`1`	`1`	`367`	`9.0`	`-0.0`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		A	`2`	`1`	`49874`	`◊`	[NAG]B:1301	`1`	`1`	`368`	`8.9`	`-0.0`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`93`		B	`2`	`1`	`49919`	`◊`	[NAG]E:1301	`1`	`1`	`368`	`8.8`	`-0.0`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`8.9`	`-0.0`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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