PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=516-DE-O9L)

Interfaces in PDB 7k8s

STRUCTURE OF THE SARS-COV-2 S 2P TRIMER IN COMPLEX WITH THE HUMAN NEUTRALIZING ANTIBODY FAB FRAGMENT, C002 (STATE 1)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`481`	`146`	`51733`	`◊`	C	`517`	`149`	`51791`	`4579.6`	`-44.2`	`0.263`	`34`	`11`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`479`	`142`	`51881`	`◊`	C	`457`	`137`	`51791`	`4359.8`	`-51.3`	`0.093`	`27`	`11`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`483`	`140`	`51733`	`◊`	B	`451`	`139`	`51881`	`4341.8`	`-43.3`	`0.250`	`35`	`12`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`4427.1`	`-46.2`	`0.202`	`32`	`11`	`0`	`0.000`
2	`4`		M	`91`	`25`	`6771`	`◊`	N	`92`	`26`	`5601`	`805.4`	`-12.3`	`0.219`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
	`5`		O	`89`	`25`	`6516`	`◊`	P	`90`	`26`	`5360`	`781.8`	`-13.1`	`0.178`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		H	`80`	`23`	`6687`	`◊`	L	`88`	`24`	`5384`	`727.6`	`-13.4`	`0.112`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`771.6`	`-12.9`	`0.170`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
3	`7`		A	`83`	`23`	`51733`	`◊`	H	`74`	`22`	`6687`	`728.2`	`-5.8`	`0.568`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`85`	`23`	`51791`	`◊`	M	`78`	`23`	`6771`	`727.7`	`-7.2`	`0.463`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`728.0`	`-6.5`	`0.515`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
4	`9`		B	`83`	`24`	`51881`	`◊`	O	`72`	`24`	`6516`	`636.0`	`-5.2`	`0.623`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
5	`10`		C	`18`	`7`	`51791`	`◊`	L	`30`	`16`	`5384`	`219.2`	`-2.5`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`15`	`6`	`51881`	`◊`	N	`19`	`11`	`5601`	`165.3`	`-1.6`	`0.469`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`192.3`	`-2.1`	`0.406`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`12`		C	`18`	`5`	`51791`	`◊`	N	`24`	`6`	`5601`	`199.5`	`-0.5`	`0.640`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`21`	`5`	`51733`	`◊`	L	`24`	`6`	`5384`	`190.9`	`-0.4`	`0.622`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`195.2`	`-0.4`	`0.631`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
7	`14`		B	`19`	`5`	`51881`	`◊`	P	`19`	`6`	`5360`	`178.2`	`0.6`	`0.668`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
8	`15`		B	`16`	`7`	`51881`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`352`	`143.3`	`4.4`	`0.535`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		A	`17`	`7`	`51733`	`c`	[NAG]A:1302	`10`	`1`	`353`	`142.0`	`4.1`	`0.569`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`142.7`	`4.2`	`0.552`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`17`		C	`15`	`7`	`51791`	`c`	[NAG]C:1302	`10`	`1`	`352`	`136.1`	`3.7`	`0.543`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		A	`14`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]A:1308	`11`	`1`	`355`	`132.3`	`3.5`	`0.428`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		B	`12`	`4`	`51881`	`c`	[NAG]B:1308	`11`	`1`	`353`	`125.1`	`3.4`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		C	`14`	`4`	`51791`	`c`	[NAG]C:1308	`10`	`1`	`355`	`123.4`	`3.7`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`126.9`	`3.5`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`21`		B	`16`	`5`	`51881`	`c`	[NAG]R:1	`11`	`1`	`362`	`132.1`	`3.1`	`0.413`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		A	`15`	`5`	`51733`	`c`	[NAG]G:1	`11`	`1`	`362`	`130.6`	`3.3`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		C	`15`	`5`	`51791`	`c`	[NAG]W:1	`11`	`1`	`361`	`123.0`	`2.7`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`128.6`	`3.0`	`0.407`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`24`		B	`16`	`9`	`51881`	`c`	[NAG]K:1	`12`	`1`	`362`	`130.1`	`2.5`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		A	`16`	`8`	`51733`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`362`	`127.5`	`2.4`	`0.273`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`15`	`7`	`51791`	`c`	[NAG]U:1	`12`	`1`	`360`	`126.7`	`2.6`	`0.285`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`128.1`	`2.5`	`0.281`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`27`		A	`15`	`7`	`51733`	`c`	[NAG]F:1	`10`	`1`	`363`	`119.4`	`3.7`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		B	`13`	`5`	`51881`	`c`	[NAG]Q:1	`11`	`1`	`361`	`111.7`	`3.5`	`0.378`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		C	`13`	`5`	`51791`	`c`	[NAG]V:1	`11`	`1`	`363`	`109.4`	`3.1`	`0.392`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`113.5`	`3.4`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`30`		B	`13`	`4`	`51881`	`c`	[NAG]B:1303	`6`	`1`	`362`	`109.7`	`4.2`	`0.754`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		C	`12`	`4`	`51791`	`c`	[NAG]C:1303	`7`	`1`	`362`	`107.0`	`4.1`	`0.675`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`108.4`	`4.2`	`0.715`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`32`		A	`11`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]A:1303	`8`	`1`	`360`	`108.9`	`4.2`	`0.628`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`33`		A	`11`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]A:1307	`10`	`1`	`363`	`108.8`	`2.7`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`34`		B	`14`	`5`	`51881`	`c`	[NAG]B:1307	`8`	`1`	`364`	`107.0`	`2.8`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`35`		C	`14`	`4`	`51791`	`c`	[NAG]C:1307	`8`	`1`	`362`	`103.5`	`2.9`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`36`		B	`10`	`4`	`51881`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`363`	`98.5`	`2.0`	`0.290`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`37`		C	`10`	`3`	`51791`	`c`	[NAG]C:1306	`7`	`1`	`361`	`97.0`	`3.6`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		A	`11`	`3`	`51733`	`c`	[NAG]A:1306	`7`	`1`	`359`	`95.2`	`3.5`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`96.1`	`3.5`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`39`		B	`9`	`3`	`51881`	`c`	[NAG]B:1306	`7`	`1`	`361`	`96.3`	`3.6`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`40`		A	`13`	`5`	`51733`	`c`	[NAG]A:1305	`9`	`1`	`361`	`96.1`	`2.7`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		C	`11`	`4`	`51791`	`c`	[NAG]C:1305	`10`	`1`	`362`	`90.4`	`2.3`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`93.3`	`2.5`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`42`		C	`12`	`4`	`51791`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`362`	`95.3`	`2.1`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`43`		B	`16`	`6`	`51881`	`c`	[NAG]B:1305	`8`	`1`	`361`	`92.2`	`2.6`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`44`		A	`13`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]A:1301	`10`	`1`	`366`	`91.1`	`2.2`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`45`		A	`9`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]D:1	`9`	`1`	`359`	`86.9`	`1.9`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		B	`7`	`3`	`51881`	`c`	[NAG]J:1	`8`	`1`	`356`	`83.7`	`1.3`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		C	`8`	`3`	`51791`	`c`	[NAG]T:1	`10`	`1`	`361`	`78.6`	`1.8`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`83.0`	`1.6`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`48`		B	`11`	`5`	`51881`	`◊`	M	`8`	`3`	`6771`	`83.0`	`-0.9`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		C	`11`	`5`	`51791`	`◊`	H	`5`	`2`	`6687`	`57.9`	`-0.9`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`70.5`	`-0.9`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`50`		B	`9`	`3`	`51881`	`c`	[NAG]S:1	`9`	`1`	`362`	`81.6`	`2.6`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		A	`9`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]I:1	`8`	`1`	`361`	`79.7`	`2.5`	`0.429`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		C	`8`	`3`	`51791`	`c`	[NAG]X:1	`9`	`1`	`361`	`72.0`	`2.3`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`77.8`	`2.5`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`53`		A	`10`	`4`	`51733`	`c`	[NAG]A:1309	`8`	`1`	`354`	`79.7`	`2.6`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		B	`8`	`3`	`51881`	`c`	[NAG]B:1309	`7`	`1`	`353`	`73.5`	`2.6`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`76.6`	`2.6`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`55`		[NAG]F:1	`7`	`1`	`363`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`362`	`75.8`	`1.9`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]V:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]V:2	`7`	`1`	`361`	`74.0`	`1.6`	`0.119`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]T:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]T:2	`7`	`1`	`362`	`71.5`	`1.5`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]K:2	`7`	`1`	`360`	`70.1`	`1.4`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]E:2	`7`	`1`	`360`	`69.8`	`1.5`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]U:1	`5`	`1`	`360`	`c`	[NAG]U:2	`8`	`1`	`355`	`69.2`	`1.3`	`0.091`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.7`	`1.5`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`61`		[NAG]X:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]X:2	`9`	`1`	`361`	`75.3`	`2.4`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`62`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`357`	`74.1`	`2.3`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`63`		[NAG]S:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]S:2	`9`	`1`	`359`	`73.8`	`2.1`	`0.135`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`64`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]Q:2	`7`	`1`	`363`	`73.4`	`2.1`	`0.141`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`359`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`358`	`71.3`	`1.7`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.3`	`1.9`	`0.117`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`66`		C	`6`	`2`	`51791`	`c`	[NAG]C:1309	`7`	`1`	`359`	`71.4`	`2.4`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`67`		[NAG]J:1	`5`	`1`	`356`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`355`	`71.1`	`1.7`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`68`		B	`9`	`2`	`51881`	`c`	[NAG]B:1304	`10`	`1`	`365`	`66.4`	`1.5`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		A	`6`	`1`	`51733`	`c`	[NAG]A:1304	`7`	`1`	`363`	`64.7`	`1.4`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.5`	`1.4`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`70`		[NAG]G:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]G:2	`10`	`1`	`363`	`66.2`	`1.2`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]R:2	`10`	`1`	`362`	`65.9`	`1.3`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		[NAG]W:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]W:2	`9`	`1`	`361`	`65.4`	`1.2`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.8`	`1.2`	`0.080`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`73`		C	`11`	`4`	`51791`	`◊`	[NAG]U:2	`6`	`1`	`355`	`65.1`	`1.3`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		B	`10`	`4`	`51881`	`◊`	[NAG]K:2	`6`	`1`	`360`	`61.8`	`1.1`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		A	`9`	`3`	`51733`	`◊`	[NAG]E:2	`6`	`1`	`360`	`59.2`	`1.0`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`62.0`	`1.1`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`76`		C	`6`	`1`	`51791`	`c`	[NAG]C:1304	`8`	`1`	`365`	`61.7`	`1.4`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`77`		B	`5`	`1`	`51881`	`◊`	[NAG]R:2	`5`	`1`	`362`	`43.8`	`1.3`	`0.436`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		A	`6`	`2`	`51733`	`◊`	[NAG]G:2	`4`	`1`	`363`	`42.2`	`1.1`	`0.472`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		C	`4`	`1`	`51791`	`◊`	[NAG]W:2	`6`	`1`	`361`	`32.4`	`1.1`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`39.5`	`1.2`	`0.428`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`80`		A	`5`	`2`	`51733`	`◊`	[NAG]F:2	`3`	`1`	`362`	`32.9`	`1.3`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`81`		C	`6`	`3`	`51791`	`◊`	[NAG]V:2	`2`	`1`	`361`	`24.4`	`1.1`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		B	`6`	`3`	`51881`	`◊`	[NAG]Q:2	`2`	`1`	`363`	`21.8`	`1.0`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`26.4`	`1.2`	`0.680`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`83`		B	`4`	`1`	`51881`	`◊`	[NAG]A:1303	`5`	`1`	`360`	`26.4`	`-0.0`	`0.180`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`84`		C	`4`	`2`	`51791`	`◊`	[NAG]A:1307	`6`	`1`	`363`	`25.5`	`0.4`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`85`		C	`3`	`1`	`51791`	`◊`	[NAG]B:1303	`5`	`1`	`362`	`24.3`	`0.8`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		A	`4`	`1`	`51733`	`◊`	[NAG]C:1303	`3`	`1`	`362`	`11.5`	`-0.1`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.9`	`0.4`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`87`		A	`3`	`1`	`51733`	`◊`	[NAG]B:1307	`5`	`1`	`364`	`23.4`	`0.4`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`88`		B	`1`	`1`	`51881`	`◊`	[NAG]C:1308	`4`	`1`	`355`	`23.4`	`1.0`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		C	`1`	`1`	`51791`	`◊`	[NAG]A:1308	`4`	`1`	`355`	`21.3`	`0.9`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`22.3`	`0.9`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`90`		B	`3`	`1`	`51881`	`◊`	[NAG]C:1307	`3`	`1`	`362`	`20.1`	`0.2`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`91`		B	`1`	`1`	`51881`	`◊`	[NAG]A:1309	`2`	`1`	`354`	`17.2`	`0.0`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`92`		A	`2`	`1`	`51733`	`◊`	[NAG]T:1	`2`	`1`	`361`	`14.3`	`0.2`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`93`		C	`4`	`2`	`51791`	`◊`	[NAG]J:1	`1`	`1`	`356`	`12.5`	`0.4`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`94`		C	`2`	`1`	`51791`	`◊`	[NAG]J:2	`1`	`1`	`355`	`4.6`	`0.0`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`95`		C	`1`	`1`	`51791`	`◊`	[NAG]B:1309	`1`	`1`	`353`	`0.8`	`-0.0`	`0.272`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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