PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=392-66-123)

Interfaces in PDB 7k8w

STRUCTURE OF THE SARS-COV-2 S 2P TRIMER IN COMPLEX WITH THE HUMAN NEUTRALIZING ANTIBODY FAB FRAGMENT, C119

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`482`	`144`	`50637`	`◊`	G	`479`	`144`	`50358`	`4392.7`	`-47.7`	`0.193`	`42`	`4`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`445`	`134`	`50637`	`◊`	B	`477`	`139`	`49241`	`4278.3`	`-53.1`	`0.120`	`29`	`3`	`0`	`0.000`
3	`3`		G	`417`	`123`	`50358`	`◊`	B	`400`	`121`	`49241`	`3863.4`	`-42.8`	`0.288`	`29`	`1`	`0`	`0.000`
4	`4`		H	`89`	`20`	`7024`	`◊`	L	`85`	`21`	`5666`	`731.5`	`-11.7`	`0.207`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		N	`84`	`19`	`7052`	`◊`	S	`86`	`20`	`5649`	`678.0`	`-11.5`	`0.199`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`704.8`	`-11.6`	`0.203`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		G	`57`	`18`	`50358`	`◊`	N	`57`	`18`	`7052`	`561.0`	`-4.1`	`0.498`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
	`7`		A	`59`	`19`	`50637`	`◊`	H	`61`	`19`	`7024`	`560.4`	`-3.7`	`0.600`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`560.7`	`-3.9`	`0.549`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
6	`8`		G	`44`	`14`	`50358`	`◊`	S	`46`	`14`	`5649`	`360.0`	`-0.4`	`0.783`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		A	`36`	`11`	`50637`	`◊`	L	`37`	`14`	`5666`	`283.1`	`0.0`	`0.791`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`321.5`	`-0.2`	`0.787`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		B	`18`	`8`	`49241`	`c`	[NAG]B:1306	`11`	`1`	`351`	`141.2`	`3.4`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		A	`12`	`6`	`50637`	`c`	[NAG]F:1	`12`	`1`	`364`	`138.2`	`2.9`	`0.336`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		G	`15`	`6`	`50358`	`c`	[NAG]Q:1	`11`	`1`	`362`	`131.5`	`3.2`	`0.453`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`134.9`	`3.0`	`0.394`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		B	`11`	`6`	`49241`	`c`	[NAG]K:1	`11`	`1`	`360`	`136.2`	`3.3`	`0.496`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		A	`21`	`9`	`50637`	`c`	[NAG]A:1302	`12`	`1`	`358`	`132.9`	`3.4`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		B	`17`	`5`	`49241`	`c`	[NAG]B:1312	`12`	`1`	`363`	`132.5`	`4.0`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		G	`12`	`5`	`50358`	`c`	[NAG]G:1302	`12`	`1`	`364`	`132.1`	`3.1`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		B	`16`	`7`	`49241`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`358`	`122.8`	`2.7`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		A	`11`	`4`	`50637`	`c`	[NAG]A:1308	`9`	`1`	`355`	`122.4`	`3.6`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`19`		G	`12`	`4`	`50358`	`c`	[NAG]G:1309	`11`	`1`	`362`	`122.2`	`3.7`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		G	`15`	`9`	`50358`	`c`	[NAG]O:1	`12`	`1`	`360`	`121.5`	`2.7`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`21`		B	`13`	`6`	`49241`	`c`	[NAG]B:1311	`12`	`1`	`360`	`120.8`	`2.9`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		A	`14`	`6`	`50637`	`c`	[NAG]A:1307	`8`	`1`	`357`	`120.7`	`2.9`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`23`		A	`16`	`7`	`50637`	`c`	[NAG]D:1	`13`	`1`	`363`	`120.7`	`2.2`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		G	`17`	`7`	`50358`	`c`	[NAG]P:1	`10`	`1`	`364`	`119.9`	`3.2`	`0.459`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		B	`15`	`5`	`49241`	`c`	[NAG]B:1305	`10`	`1`	`362`	`116.7`	`3.9`	`0.537`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		A	`16`	`7`	`50637`	`c`	[NAG]E:1	`11`	`1`	`364`	`115.5`	`3.3`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		A	`12`	`7`	`50637`	`c`	[NAG]A:1309	`7`	`1`	`352`	`112.1`	`3.3`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		G	`12`	`7`	`50358`	`c`	[NAG]T:1	`9`	`1`	`353`	`111.4`	`2.9`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`111.7`	`3.1`	`0.563`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`29`		B	`18`	`8`	`49241`	`c`	[NAG]J:1	`10`	`1`	`363`	`111.9`	`3.1`	`0.427`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`30`		B	`9`	`4`	`49241`	`c`	[NAG]B:1310	`9`	`1`	`358`	`111.0`	`2.8`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`31`		A	`17`	`5`	`50637`	`c`	[NAG]A:1301	`10`	`1`	`360`	`109.1`	`3.1`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`32`		G	`7`	`3`	`50358`	`c`	[NAG]G:1308	`8`	`1`	`358`	`105.0`	`2.9`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`33`		G	`14`	`4`	`50358`	`c`	[NAG]G:1301	`8`	`1`	`360`	`103.1`	`2.2`	`0.445`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`34`		B	`10`	`3`	`49241`	`c`	[NAG]B:1309	`6`	`1`	`365`	`100.5`	`3.8`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`35`		A	`13`	`3`	`50637`	`c`	[NAG]A:1306	`6`	`1`	`365`	`100.0`	`3.7`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`36`		B	`12`	`4`	`49241`	`c`	[NAG]B:1304	`7`	`1`	`361`	`99.4`	`3.4`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`37`		A	`8`	`3`	`50637`	`c`	[NAG]A:1303	`7`	`1`	`361`	`99.0`	`2.7`	`0.568`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`38`		B	`10`	`4`	`49241`	`c`	[NAG]B:1308	`7`	`1`	`362`	`97.3`	`2.2`	`0.467`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`39`		G	`7`	`3`	`50358`	`c`	[NAG]G:1304	`6`	`1`	`364`	`95.7`	`3.2`	`0.643`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		B	`11`	`4`	`49241`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`360`	`93.8`	`1.9`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		B	`11`	`5`	`49241`	`c`	[NAG]M:1	`8`	`1`	`362`	`93.2`	`2.6`	`0.508`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		G	`10`	`3`	`50358`	`c`	[NAG]G:1307	`7`	`1`	`365`	`92.1`	`4.3`	`0.691`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		B	`9`	`5`	`49241`	`c`	[NAG]B:1313	`9`	`1`	`353`	`86.7`	`2.3`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		A	`12`	`5`	`50637`	`c`	[NAG]I:1	`8`	`1`	`364`	`86.5`	`2.6`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		G	`11`	`4`	`50358`	`c`	[NAG]R:1	`9`	`1`	`364`	`82.5`	`2.4`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`84.5`	`2.5`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		G	`7`	`2`	`50358`	`c`	[NAG]G:1311	`9`	`1`	`364`	`86.4`	`2.7`	`0.379`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		A	`10`	`2`	`50637`	`c`	[NAG]A:1310	`10`	`1`	`357`	`86.1`	`2.5`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		A	`11`	`5`	`50637`	`c`	[NAG]A:1305	`9`	`1`	`357`	`84.4`	`2.2`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`49`		G	`7`	`3`	`50358`	`c`	[NAG]G:1303	`5`	`1`	`352`	`83.2`	`2.9`	`0.657`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`50`		G	`7`	`2`	`50358`	`c`	[NAG]G:1305	`9`	`1`	`361`	`82.3`	`2.4`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]J:2	`10`	`1`	`366`	`77.7`	`2.1`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`52`		[NAG]P:1	`7`	`1`	`364`	`c`	[NAG]P:2	`10`	`1`	`360`	`76.6`	`1.8`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`53`		G	`6`	`2`	`50358`	`c`	[NAG]G:1306	`9`	`1`	`362`	`76.2`	`1.7`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`54`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`364`	`75.1`	`2.1`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`361`	`69.0`	`1.7`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]C:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]C:2	`7`	`1`	`352`	`65.3`	`1.4`	`0.120`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`69.8`	`1.7`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`57`		[NAG]T:1	`6`	`1`	`353`	`c`	[NAG]T:2	`8`	`1`	`359`	`75.0`	`1.6`	`0.112`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`58`		A	`6`	`3`	`50637`	`c`	[NAG]C:1	`9`	`1`	`362`	`74.2`	`1.9`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`59`		[NAG]M:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]M:2	`10`	`1`	`362`	`72.5`	`1.6`	`0.093`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`60`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]R:2	`8`	`1`	`357`	`72.3`	`2.1`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`354`	`70.8`	`1.9`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.5`	`2.0`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`62`		G	`5`	`2`	`50358`	`c`	[NAG]G:1310	`8`	`1`	`363`	`71.5`	`2.4`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`63`		B	`7`	`3`	`49241`	`c`	[NAG]B:1303	`8`	`1`	`357`	`71.0`	`1.7`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`64`		A	`13`	`3`	`50637`	`◊`	[NAG]D:2	`5`	`1`	`363`	`69.7`	`1.4`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`65`		A	`6`	`1`	`50637`	`c`	[NAG]A:1304	`7`	`1`	`361`	`67.7`	`2.2`	`0.413`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`66`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]K:2	`10`	`1`	`362`	`65.9`	`1.2`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]Q:2	`8`	`1`	`362`	`63.8`	`1.1`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`64.8`	`1.1`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`68`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]F:2	`7`	`1`	`357`	`65.4`	`1.2`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`69`		B	`5`	`1`	`49241`	`c`	[NAG]B:1307	`9`	`1`	`364`	`65.2`	`1.5`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`70`		[NAG]D:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`363`	`63.8`	`1.1`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`71`		B	`6`	`4`	`49241`	`◊`	L	`5`	`2`	`5666`	`53.3`	`-1.1`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		G	`7`	`3`	`50358`	`◊`	[NAG]O:2	`4`	`1`	`361`	`50.5`	`0.7`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		B	`4`	`2`	`49241`	`◊`	[NAG]K:2	`6`	`1`	`362`	`39.6`	`0.6`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		G	`5`	`1`	`50358`	`◊`	[NAG]A:1303	`5`	`1`	`361`	`38.0`	`-0.2`	`0.202`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		A	`6`	`2`	`50637`	`◊`	[NAG]G:1308	`5`	`1`	`358`	`35.8`	`0.4`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`76`		H	`4`	`3`	`7024`	`◊`	N	`5`	`2`	`7052`	`33.5`	`0.1`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`77`		G	`6`	`3`	`50358`	`◊`	[NAG]C:1	`3`	`1`	`362`	`32.8`	`1.2`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`78`		A	`5`	`1`	`50637`	`◊`	[NAG]B:1304	`4`	`1`	`361`	`31.1`	`0.0`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`79`		A	`2`	`1`	`50637`	`◊`	[NAG]F:2	`6`	`1`	`357`	`30.8`	`0.4`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		G	`4`	`1`	`50358`	`◊`	[NAG]Q:2	`6`	`1`	`362`	`30.2`	`1.1`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`30.5`	`0.7`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`81`		G	`5`	`2`	`50358`	`◊`	[NAG]P:2	`3`	`1`	`360`	`23.4`	`0.9`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`82`		A	`2`	`1`	`50637`	`◊`	N	`3`	`1`	`7052`	`23.2`	`0.1`	`0.695`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
72	`83`		G	`2`	`1`	`50358`	`◊`	[NAG]B:1310	`2`	`1`	`358`	`22.0`	`0.4`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`84`		G	`2`	`2`	`50358`	`◊`	[NAG]C:2	`3`	`1`	`352`	`14.0`	`0.6`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`85`		B	`1`	`1`	`49241`	`◊`	[NAG]A:1307	`2`	`1`	`357`	`13.2`	`0.1`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`86`		B	`3`	`1`	`49241`	`◊`	[NAG]J:2	`1`	`1`	`366`	`9.8`	`0.2`	`0.580`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`87`		A	`3`	`1`	`50637`	`◊`	[NAG]E:2	`2`	`1`	`364`	`9.1`	`0.4`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`88`		A	`1`	`1`	`50637`	`◊`	[NAG]B:1303	`2`	`1`	`357`	`7.8`	`0.2`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`89`		B	`1`	`1`	`49241`	`◊`	[NAG]G:1304	`1`	`1`	`364`	`2.9`	`-0.0`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`90`		G	`2`	`1`	`50358`	`◊`	[NAG]B:1312	`1`	`1`	`363`	`2.4`	`0.0`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`91`		B	`1`	`1`	`49241`	`◊`	[NAG]A:1308	`1`	`1`	`355`	`1.0`	`0.0`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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