PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=653-CC-A3L)

Interfaces in PDB 7kj5

SARS-COV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN, PREFUSION WITH ONE RBD UP CONFORMATION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`548`	`158`	`50536`	`◊`	C	`535`	`151`	`49086`	`5003.4`	`-52.3`	`0.063`	`44`	`11`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`496`	`142`	`50536`	`◊`	B	`526`	`145`	`51996`	`4749.0`	`-52.2`	`0.046`	`46`	`8`	`0`	`0.000`
3	`3`		C	`483`	`139`	`49086`	`◊`	B	`436`	`127`	`51996`	`4304.2`	`-46.0`	`0.055`	`36`	`9`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`18`	`10`	`51996`	`c`	[NAG]B:1306	`11`	`1`	`366`	`159.2`	`3.7`	`0.422`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		B	`17`	`9`	`51996`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`365`	`145.7`	`4.4`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`18`	`8`	`50536`	`c`	[NAG]A:1302	`13`	`1`	`368`	`142.7`	`2.9`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`17`	`9`	`51996`	`c`	[NAG]B:1311	`13`	`1`	`366`	`140.2`	`3.7`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`16`	`6`	`50536`	`c`	[NAG]G:1	`13`	`1`	`368`	`137.1`	`2.9`	`0.305`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`15`	`5`	`49086`	`c`	[NAG]N:1	`11`	`1`	`364`	`126.8`	`3.0`	`0.399`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`131.9`	`3.0`	`0.352`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		A	`16`	`9`	`50536`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`365`	`134.6`	`2.6`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		C	`19`	`8`	`49086`	`c`	[NAG]L:1	`13`	`1`	`367`	`133.4`	`3.0`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		C	`11`	`7`	`49086`	`c`	[NAG]C:1306	`11`	`1`	`368`	`132.0`	`3.7`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		A	`11`	`7`	`50536`	`c`	[NAG]A:1305	`9`	`1`	`366`	`131.8`	`3.9`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		A	`22`	`6`	`50536`	`c`	[NAG]A:1301	`10`	`1`	`368`	`129.7`	`3.6`	`0.504`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		C	`17`	`7`	`49086`	`c`	[NAG]M:1	`12`	`1`	`366`	`127.9`	`3.5`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		C	`16`	`8`	`49086`	`c`	[NAG]C:1302	`10`	`1`	`369`	`126.9`	`2.7`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		C	`14`	`5`	`49086`	`c`	[NAG]C:1311	`12`	`1`	`367`	`126.7`	`3.6`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		B	`14`	`4`	`51996`	`c`	[NAG]B:1312	`12`	`1`	`367`	`120.8`	`3.6`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		A	`10`	`4`	`50536`	`c`	[NAG]A:1310	`12`	`1`	`363`	`120.6`	`4.0`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		B	`15`	`5`	`51996`	`c`	[NAG]I:1	`11`	`1`	`368`	`119.6`	`3.2`	`0.361`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		B	`19`	`5`	`51996`	`◊`	[NAG]J:1	`11`	`1`	`367`	`118.3`	`3.3`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		C	`16`	`7`	`49086`	`c`	[NAG]C:1305	`11`	`1`	`369`	`113.2`	`3.6`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		A	`14`	`6`	`50536`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`367`	`110.3`	`2.7`	`0.323`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		A	`11`	`5`	`50536`	`c`	[NAG]A:1309	`7`	`1`	`369`	`109.6`	`2.7`	`0.539`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		A	`14`	`5`	`50536`	`c`	[NAG]A:1304	`10`	`1`	`366`	`108.0`	`3.9`	`0.489`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		B	`14`	`6`	`51996`	`◊`	[NAG]B:1313	`7`	`1`	`362`	`106.6`	`4.2`	`0.703`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		B	`14`	`5`	`51996`	`c`	[NAG]K:1	`8`	`1`	`368`	`106.1`	`3.2`	`0.537`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		C	`10`	`4`	`49086`	`c`	[NAG]C:1310	`7`	`1`	`364`	`105.4`	`2.6`	`0.521`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		B	`10`	`4`	`51996`	`c`	[NAG]B:1310	`7`	`1`	`367`	`103.9`	`2.8`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		B	`14`	`6`	`51996`	`c`	[NAG]B:1305	`9`	`1`	`370`	`102.3`	`3.4`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		B	`9`	`4`	`51996`	`c`	[NAG]B:1304	`7`	`1`	`366`	`102.2`	`3.6`	`0.624`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`32`		B	`12`	`4`	`51996`	`c`	[NAG]B:1301	`9`	`1`	`366`	`101.9`	`2.2`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		C	`15`	`4`	`49086`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`368`	`100.4`	`2.3`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		B	`11`	`4`	`51996`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`363`	`99.8`	`3.0`	`0.468`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		A	`13`	`3`	`50536`	`c`	[NAG]A:1308	`7`	`1`	`367`	`99.4`	`3.8`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`36`		A	`11`	`3`	`50536`	`c`	[NAG]A:1303	`7`	`1`	`366`	`97.7`	`3.5`	`0.611`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		B	`9`	`2`	`51996`	`c`	[NAG]B:1309	`7`	`1`	`369`	`96.6`	`3.8`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		C	`10`	`3`	`49086`	`c`	[NAG]C:1304	`7`	`1`	`367`	`95.0`	`3.2`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		A	`12`	`4`	`50536`	`c`	[NAG]D:1	`9`	`1`	`368`	`93.3`	`1.8`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		C	`11`	`5`	`49086`	`c`	[NAG]C:1303	`7`	`1`	`366`	`93.0`	`3.5`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		B	`9`	`3`	`51996`	`◊`	[NAG]B:1303	`10`	`1`	`366`	`91.6`	`2.0`	`0.303`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		C	`12`	`4`	`49086`	`c`	[NAG]O:1	`8`	`1`	`367`	`89.7`	`3.0`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		A	`12`	`4`	`50536`	`c`	[NAG]H:1	`7`	`1`	`367`	`86.8`	`2.9`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`88.3`	`2.9`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		C	`10`	`3`	`49086`	`c`	[NAG]C:1309	`7`	`1`	`367`	`87.4`	`2.9`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		A	`10`	`4`	`50536`	`c`	[NAG]A:1307	`9`	`1`	`361`	`86.7`	`2.0`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		C	`8`	`2`	`49086`	`c`	[NAG]C:1307	`9`	`1`	`362`	`84.8`	`2.7`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		C	`11`	`3`	`49086`	`c`	[NAG]C:1312	`7`	`1`	`366`	`84.3`	`3.0`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		C	`5`	`2`	`49086`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`365`	`81.1`	`1.1`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		[NAG]F:1	`7`	`1`	`367`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`369`	`77.3`	`1.8`	`0.092`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`365`	`73.6`	`2.2`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]H:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]H:2	`9`	`1`	`362`	`71.8`	`2.3`	`0.138`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.7`	`2.3`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`52`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`368`	`72.0`	`1.7`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`365`	`69.9`	`1.5`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`367`	`69.4`	`1.6`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]D:2	`8`	`1`	`363`	`66.5`	`1.4`	`0.091`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]G:1	`5`	`1`	`368`	`c`	[NAG]G:2	`10`	`1`	`366`	`66.1`	`1.2`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.3`	`1.4`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`57`		A	`12`	`4`	`50536`	`◊`	[NAG]E:2	`5`	`1`	`367`	`67.5`	`1.3`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		C	`8`	`3`	`49086`	`◊`	[NAG]L:2	`4`	`1`	`366`	`51.2`	`0.8`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`59.3`	`1.0`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`59`		[NAG]J:1	`7`	`1`	`367`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`368`	`67.4`	`1.4`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`60`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`366`	`66.8`	`1.2`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[NAG]L:1	`7`	`1`	`367`	`c`	[NAG]L:2	`7`	`1`	`366`	`65.6`	`1.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]E:2	`10`	`1`	`367`	`65.6`	`1.4`	`0.072`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.0`	`1.3`	`0.080`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		B	`4`	`1`	`51996`	`c`	[NAG]B:1307	`8`	`1`	`366`	`61.6`	`1.7`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`64`		A	`6`	`1`	`50536`	`◊`	[NAG]A:1306	`6`	`1`	`368`	`55.0`	`1.7`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`65`		A	`4`	`2`	`50536`	`◊`	[NAG]G:2	`4`	`1`	`366`	`48.1`	`1.4`	`0.541`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`66`		A	`3`	`1`	`50536`	`◊`	[NAG]B:1304	`5`	`1`	`366`	`45.1`	`0.4`	`0.328`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`67`		C	`4`	`1`	`49086`	`◊`	[NAG]N:2	`4`	`1`	`366`	`44.2`	`1.4`	`0.500`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
60	`68`		C	`6`	`2`	`49086`	`◊`	[NAG]D:1	`3`	`1`	`368`	`35.0`	`1.2`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`69`		C	`6`	`3`	`49086`	`◊`	[NAG]M:2	`3`	`1`	`365`	`32.1`	`1.2`	`0.562`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`70`		B	`5`	`2`	`51996`	`◊`	[NAG]I:2	`3`	`1`	`367`	`29.6`	`1.0`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`71`		B	`6`	`2`	`51996`	`◊`	[NAG]A:1309	`4`	`1`	`369`	`29.2`	`-0.1`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`72`		B	`4`	`2`	`51996`	`◊`	[NAG]J:2	`3`	`1`	`368`	`26.5`	`0.7`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`73`		B	`2`	`1`	`51996`	`◊`	[NAG]A:1310	`2`	`1`	`363`	`16.5`	`0.7`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`74`		A	`2`	`1`	`50536`	`◊`	[NAG]C:1311	`1`	`1`	`367`	`16.3`	`0.7`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`75`		C	`2`	`1`	`49086`	`◊`	[NAG]B:1310	`2`	`1`	`367`	`15.0`	`0.0`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		A	`3`	`2`	`50536`	`◊`	[NAG]C:1310	`3`	`1`	`364`	`14.2`	`-0.1`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`14.6`	`-0.0`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`77`		C	`3`	`1`	`49086`	`◊`	[NAG]B:1312	`1`	`1`	`367`	`14.4`	`0.6`	`0.770`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`78`		C	`2`	`1`	`49086`	`◊`	[NAG]A:1303	`3`	`1`	`366`	`12.2`	`-0.2`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`79`		A	`2`	`1`	`50536`	`◊`	[NAG]B:1303	`2`	`1`	`366`	`9.8`	`0.4`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`80`		A	`3`	`2`	`50536`	`◊`	[NAG]F:2	`1`	`1`	`369`	`5.2`	`0.1`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`81`		A	`1`	`1`	`50536`	`◊`	[NAG]D:2	`1`	`1`	`363`	`1.7`	`0.1`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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