PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=131-45-J78)

Interfaces in PDB 7koj crystal.
Space symmetry group: I 41 2 2. Resolution: 2.02 Å

THE CRYSTAL STRUCTURE OF PAPAIN-LIKE PROTEASE OF SARS COV-2, C111S MUTANT, IN COMPLEX WITH PLP_SNYDER494

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`97`	`22`	`15216`	`◊`	A	x,-y+1/2,-z+1/4	`6_555`	`97`	`22`	`15216`	`737.3`	`-4.4`	`0.582`	`6`	`4`	`0`	`0.021`
2	`2`		A	`53`	`15`	`15216`	`◊`	A	y,x,-z	`15_444`	`53`	`15`	`15216`	`461.3`	`-3.8`	`0.409`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
3	`3`		A	`46`	`13`	`15216`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`47`	`13`	`15216`	`407.2`	`-3.4`	`0.443`	`3`	`4`	`0`	`0.012`
4	`4`		[Y94]A:501	`29`	`1`	`658`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`16`	`15216`	`394.3`	`-0.4`	`0.643`	`5`	`0`	`0`	`0.014`
5	`5`		A	`20`	`7`	`15216`	`◊`	A	-y+1,-x+1,-z	`8_665`	`19`	`7`	`15216`	`211.9`	`-1.8`	`0.411`	`6`	`0`	`0`	`0.010`
6	`6`		[ACT]A:510	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15216`	`110.5`	`-0.1`	`0.681`	`3`	`0`	`0`	`0.008`
7	`7`		[MES]A:509	`8`	`1`	`330`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15216`	`92.4`	`1.6`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		[ACT]A:511	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15216`	`89.5`	`0.5`	`0.816`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		[ACT]A:511	`4`	`1`	`184`	`f`	[Y94]A:501	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`658`	`67.2`	`0.7`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		[MES]A:509	`7`	`1`	`330`	`◊`	A	y,x,-z	`15_444`	`9`	`2`	`15216`	`66.1`	`0.8`	`0.064`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[CL]A:508	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15216`	`56.0`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
12	`12`		[ZN]A:503	`1`	`1`	`98`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`15216`	`49.5`	`-36.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.196`
13	`13`		[UNX]A:515	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15216`	`45.8`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
14	`14`		[MES]A:509	`3`	`1`	`330`	`◊`	[Y94]A:501	y,x,-z	`15_444`	`5`	`1`	`658`	`45.6`	`1.1`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,-y+1/2,-z+1/4	`6_555`	`6`	`4`	`15216`	`39.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
16	`16`		[UNX]A:513	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15216`	`39.6`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`17`		[UNX]A:512	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15216`	`30.5`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`18`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`15216`	`30.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`33.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
17	`19`		[CL]A:507	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`8`	`4`	`15216`	`35.9`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
18	`20`		[UNX]A:521	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15216`	`35.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`21`		[UNX]A:518	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15216`	`29.5`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`22`		[UNX]A:519	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`15216`	`23.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`23`		[UNX]A:522	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`15216`	`20.8`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	*Average:*													`27.2`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
19	`24`		[ZN]A:504	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`15216`	`33.9`	`-18.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
20	`25`		[CL]A:506	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15216`	`33.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
21	`26`		[UNX]A:520	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`15216`	`29.4`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
22	`27`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`6`	`2`	`15216`	`29.4`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`28`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`5`	`1`	`15216`	`15.4`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`22.4`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
23	`29`		[UNX]A:521	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:518	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`28.7`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
24	`30`		[CL]A:507	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15216`	`28.2`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
25	`31`		[CL]A:508	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`15_444`	`4`	`2`	`15216`	`26.9`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
26	`32`		[ZN]A:504	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	y,x,-z	`15_444`	`2`	`1`	`15216`	`25.9`	`-11.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
27	`33`		[UNX]A:515	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:513	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`24.4`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
28	`34`		[ZN]A:505	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15216`	`24.0`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
29	`35`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15216`	`24.0`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`36`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15216`	`20.4`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`22.2`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
30	`37`		[CL]A:508	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]A:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.8`	`-11.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
31	`38`		[ZN]A:505	`1`	`1`	`98`	`cf`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`7`	`3`	`15216`	`23.8`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
32	`39`		[UNX]A:522	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:519	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`22.3`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
33	`40`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:516	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`21.7`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
34	`41`		[ACT]A:511	`1`	`1`	`184`	`◊`	[MES]A:509	y,x,-z	`15_444`	`1`	`1`	`330`	`21.7`	`0.5`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[UNX]A:522	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:520	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`21.6`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
36	`43`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:514	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`21.4`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
37	`44`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:520	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`21.1`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
38	`45`		[UNX]A:519	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:518	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`21.0`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
39	`46`		[UNX]A:520	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,-y+1/2,-z+1/4	`6_555`	`5`	`3`	`15216`	`20.9`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`47`		[UNX]A:519	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,-y+1/2,-z+1/4	`6_555`	`5`	`2`	`15216`	`15.9`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`48`		[UNX]A:522	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,-y+1/2,-z+1/4	`6_555`	`5`	`3`	`15216`	`14.9`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`17.2`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
40	`49`		[UNX]A:522	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:521	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`20.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
41	`50`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:522	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`20.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
42	`51`		[CL]A:506	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`4`	`2`	`15216`	`19.8`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
43	`52`		[UNX]A:520	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:519	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`19.6`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
44	`53`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:514	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`19.3`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
45	`54`		[UNX]A:513	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:512	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`18.8`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
46	`55`		[UNX]A:522	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:518	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`18.1`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
47	`56`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:519	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`17.6`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
48	`57`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:513	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`16.7`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
49	`58`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:512	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`16.7`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
50	`59`		[CL]A:507	`1`	`1`	`125`	`◊`	[ZN]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.0`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
51	`60`		[UNX]A:521	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:519	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`15.8`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
52	`61`		[CL]A:506	`1`	`1`	`125`	`◊`	[ZN]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.7`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
53	`62`		[ZN]A:502	`1`	`1`	`98`	`f`	A	-y+1,-x+1,-z	`8_665`	`3`	`1`	`15216`	`13.8`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
54	`63`		[UNX]A:512	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`12.5`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
55	`64`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:512	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`12.0`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
56	`65`		[UNX]A:521	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:520	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`12.0`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
57	`66`		[UNX]A:515	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:514	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`12.0`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
58	`67`		[CL]A:507	`1`	`1`	`125`	`f`	[CL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`11.7`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
59	`68`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:512	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`11.5`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
60	`69`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15216`	`11.2`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
61	`70`		[UNX]A:512	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`10.1`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
62	`71`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`10.1`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
63	`72`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`10.0`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
64	`73`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`10.0`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
65	`74`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`4`	`1`	`15216`	`9.7`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`75`		[UNX]A:512	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`10_554`	`3`	`2`	`15216`	`4.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`7.2`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
66	`76`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:513	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`9.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
67	`77`		[UNX]A:520	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:518	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`9.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
68	`78`		[UNX]A:515	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:512	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`8.1`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
69	`79`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`7.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
70	`80`		[UNX]A:512	`1`	`1`	`129`	`◊`	[ZN]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`6.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
71	`81`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:515	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`5.9`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
72	`82`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`5.3`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
73	`83`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`◊`	[ZN]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`5.1`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
74	`84`		[UNX]A:516	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:513	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`5.0`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
75	`85`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:521	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`4.2`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
76	`86`		[UNX]A:523	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:518	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`3.6`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
77	`87`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`3.5`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
78	`88`		[UNX]A:513	`1`	`1`	`129`	`f`	[CL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`2.8`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
79	`89`		[UNX]A:517	`1`	`1`	`129`	`◊`	[ZN]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.6`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
80	`90`		[UNX]A:514	`1`	`1`	`129`	`◊`	[ZN]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`0.4`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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