PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=767-D5-6DK)

Interfaces in PDB 7ks9

CRYO-EM STRUCTURE OF PREFUSION SARS-COV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN IN COMPLEX WITH 910-30 FAB

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`469`	`142`	`51290`	`◊`	C	`472`	`140`	`51545`	`4426.4`	`-54.1`	`0.093`	`33`	`4`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`451`	`137`	`51290`	`◊`	B	`468`	`135`	`51622`	`4364.4`	`-53.4`	`0.076`	`38`	`16`	`0`	`0.000`
3	`3`		C	`439`	`134`	`51545`	`◊`	B	`422`	`121`	`51622`	`4034.3`	`-44.3`	`0.171`	`38`	`8`	`0`	`0.000`
4	`4`		L	`76`	`21`	`5699`	`◊`	H	`85`	`21`	`5975`	`691.8`	`-10.3`	`0.193`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		H	`72`	`19`	`5975`	`◊`	B	`71`	`20`	`51622`	`673.2`	`-3.0`	`0.699`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		L	`43`	`11`	`5699`	`◊`	B	`48`	`17`	`51622`	`470.1`	`4.4`	`0.964`	`18`	`2`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`15`	`6`	`51622`	`c`	[NAG]B:1302	`12`	`1`	`362`	`153.2`	`3.7`	`0.399`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		B	`17`	`8`	`51622`	`c`	[NAG]B:1310	`13`	`1`	`365`	`148.7`	`3.7`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`17`	`6`	`51290`	`c`	[NAG]G:1	`13`	`1`	`364`	`144.6`	`3.2`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		A	`15`	`7`	`51290`	`c`	[NAG]A:1302	`12`	`1`	`365`	`144.5`	`3.5`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		C	`15`	`7`	`51545`	`c`	[NAG]C:1302	`12`	`1`	`363`	`132.5`	`2.7`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`138.5`	`3.1`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		C	`16`	`9`	`51545`	`c`	[NAG]N:1	`12`	`1`	`363`	`141.0`	`2.8`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		A	`13`	`8`	`51290`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`363`	`138.1`	`2.7`	`0.310`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		C	`15`	`5`	`51545`	`c`	[NAG]P:1	`12`	`1`	`362`	`135.6`	`3.4`	`0.410`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		B	`16`	`5`	`51622`	`c`	[NAG]K:1	`12`	`1`	`361`	`133.4`	`3.3`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		C	`13`	`4`	`51545`	`c`	[NAG]C:1309	`12`	`1`	`363`	`132.2`	`3.6`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		A	`12`	`5`	`51290`	`c`	[NAG]A:1309	`12`	`1`	`359`	`126.1`	`3.5`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`129.2`	`3.6`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		B	`13`	`4`	`51622`	`c`	[NAG]B:1311	`12`	`1`	`366`	`128.3`	`3.6`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		B	`16`	`7`	`51622`	`c`	[NAG]B:1305	`9`	`1`	`363`	`126.5`	`3.8`	`0.553`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		A	`22`	`6`	`51290`	`c`	[NAG]A:1301	`11`	`1`	`365`	`122.0`	`3.5`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		C	`16`	`7`	`51545`	`c`	[NAG]O:1	`11`	`1`	`364`	`121.2`	`3.6`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		A	`16`	`5`	`51290`	`c`	[NAG]A:1304	`12`	`1`	`358`	`120.5`	`3.9`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		A	`19`	`7`	`51290`	`c`	[NAG]F:1	`10`	`1`	`365`	`120.1`	`3.4`	`0.474`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		B	`14`	`6`	`51622`	`c`	[NAG]J:1	`11`	`1`	`363`	`117.3`	`3.1`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		A	`12`	`5`	`51290`	`c`	[NAG]A:1308	`8`	`1`	`365`	`113.4`	`3.0`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		A	`10`	`6`	`51290`	`c`	[NAG]A:1310	`8`	`1`	`356`	`111.2`	`3.1`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		B	`13`	`7`	`51622`	`c`	[NAG]B:1313	`7`	`1`	`360`	`110.9`	`3.5`	`0.643`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		B	`14`	`5`	`51622`	`c`	[NAG]B:1312	`8`	`1`	`359`	`109.9`	`2.9`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		C	`12`	`7`	`51545`	`c`	[NAG]C:1311	`8`	`1`	`358`	`109.7`	`3.8`	`0.632`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		C	`11`	`4`	`51545`	`c`	[NAG]C:1308	`8`	`1`	`359`	`105.9`	`2.9`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		B	`12`	`3`	`51622`	`c`	[NAG]B:1308	`7`	`1`	`364`	`101.8`	`4.8`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		C	`13`	`4`	`51545`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`365`	`101.7`	`2.3`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		B	`8`	`4`	`51622`	`c`	[NAG]B:1309	`9`	`1`	`365`	`101.7`	`2.7`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		A	`11`	`3`	`51290`	`c`	[NAG]A:1307	`7`	`1`	`363`	`100.4`	`4.7`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		B	`9`	`4`	`51622`	`c`	[NAG]B:1307	`9`	`1`	`360`	`99.2`	`2.6`	`0.401`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		B	`9`	`3`	`51622`	`c`	[NAG]B:1304	`7`	`1`	`366`	`98.5`	`3.7`	`0.627`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		C	`12`	`4`	`51545`	`c`	[NAG]C:1307	`7`	`1`	`364`	`95.8`	`3.3`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		B	`12`	`5`	`51622`	`c`	[NAG]M:1	`9`	`1`	`364`	`95.7`	`3.0`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		A	`9`	`3`	`51290`	`c`	[NAG]A:1303	`7`	`1`	`364`	`94.1`	`3.2`	`0.597`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		C	`12`	`4`	`51545`	`c`	[NAG]Q:1	`9`	`1`	`363`	`93.4`	`2.8`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		A	`11`	`4`	`51290`	`c`	[NAG]I:1	`7`	`1`	`364`	`91.7`	`3.1`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`92.6`	`2.9`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`42`		C	`13`	`4`	`51545`	`c`	[NAG]C:1312	`8`	`1`	`360`	`93.3`	`3.2`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`43`		C	`9`	`3`	`51545`	`c`	[NAG]C:1304	`6`	`1`	`364`	`92.6`	`3.1`	`0.646`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`44`		A	`13`	`6`	`51290`	`c`	[NAG]A:1306	`9`	`1`	`360`	`91.9`	`2.4`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`45`		B	`13`	`4`	`51622`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`365`	`90.4`	`1.8`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		A	`10`	`4`	`51290`	`c`	[NAG]D:1	`10`	`1`	`363`	`89.1`	`1.9`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`47`		B	`9`	`3`	`51622`	`c`	[NAG]B:1303	`11`	`1`	`364`	`87.3`	`2.0`	`0.287`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		C	`8`	`2`	`51545`	`c`	[NAG]C:1305	`9`	`1`	`360`	`84.3`	`2.5`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`49`		C	`8`	`3`	`51545`	`c`	[NAG]C:1303	`6`	`1`	`356`	`78.9`	`2.9`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`50`		C	`8`	`3`	`51545`	`c`	[NAG]C:1306	`10`	`1`	`364`	`78.0`	`1.4`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`51`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]F:2	`10`	`1`	`364`	`75.7`	`1.8`	`0.089`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]M:2	`10`	`1`	`365`	`75.3`	`1.7`	`0.087`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]D:2	`8`	`1`	`356`	`65.9`	`1.5`	`0.094`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.3`	`1.7`	`0.090`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`364`	`74.4`	`1.9`	`0.134`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]O:2	`10`	`1`	`361`	`72.5`	`1.8`	`0.098`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.4`	`1.9`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`56`		[NAG]I:1	`5`	`1`	`364`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`358`	`73.7`	`2.2`	`0.179`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]Q:2	`8`	`1`	`358`	`73.7`	`2.2`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.7`	`2.2`	`0.163`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`58`		A	`10`	`4`	`51290`	`◊`	[NAG]E:2	`6`	`1`	`365`	`72.3`	`1.5`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`59`		[NAG]G:1	`7`	`1`	`364`	`c`	[NAG]G:2	`8`	`1`	`363`	`71.5`	`1.2`	`0.067`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`60`		B	`7`	`2`	`51622`	`c`	[NAG]B:1306	`10`	`1`	`362`	`71.0`	`1.7`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`61`		[NAG]P:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]P:2	`9`	`1`	`364`	`68.6`	`1.2`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]K:2	`8`	`1`	`364`	`68.1`	`1.2`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.3`	`1.2`	`0.092`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		C	`5`	`2`	`51545`	`c`	[NAG]C:1310	`8`	`1`	`360`	`68.0`	`2.2`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`64`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`365`	`67.3`	`1.3`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]N:2	`10`	`1`	`364`	`66.0`	`1.1`	`0.078`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.6`	`1.2`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`66`		A	`5`	`1`	`51290`	`c`	[NAG]A:1305	`7`	`1`	`362`	`64.1`	`2.1`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`67`		C	`10`	`4`	`51545`	`◊`	[NAG]N:2	`5`	`1`	`364`	`62.9`	`0.9`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`68`		C	`6`	`3`	`51545`	`◊`	[NAG]D:1	`4`	`1`	`363`	`51.7`	`1.7`	`0.615`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		A	`3`	`2`	`51290`	`◊`	[NAG]B:1303	`3`	`1`	`364`	`12.0`	`0.4`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`31.8`	`1.0`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`70`		A	`6`	`2`	`51290`	`◊`	[NAG]G:2	`5`	`1`	`363`	`46.2`	`1.1`	`0.408`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
61	`71`		B	`6`	`2`	`51622`	`◊`	[NAG]K:2	`4`	`1`	`364`	`40.6`	`1.0`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		C	`6`	`2`	`51545`	`◊`	[NAG]P:2	`4`	`1`	`364`	`40.2`	`1.0`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		B	`3`	`2`	`51622`	`◊`	[NAG]C:1303	`5`	`1`	`356`	`37.2`	`0.4`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		B	`6`	`2`	`51622`	`◊`	[NAG]J:2	`3`	`1`	`364`	`33.8`	`1.2`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		A	`3`	`1`	`51290`	`◊`	[NAG]B:1304	`4`	`1`	`366`	`30.0`	`0.3`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		C	`2`	`1`	`51545`	`◊`	[NAG]A:1303	`2`	`1`	`364`	`5.6`	`-0.0`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.8`	`0.1`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`77`		C	`6`	`3`	`51545`	`◊`	[NAG]D:2	`2`	`1`	`356`	`27.3`	`0.7`	`0.503`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`78`		A	`1`	`1`	`51290`	`◊`	[NAG]C:1309	`4`	`1`	`363`	`22.0`	`0.9`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		C	`1`	`1`	`51545`	`◊`	[NAG]B:1311	`2`	`1`	`366`	`20.0`	`0.8`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`21.0`	`0.8`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`80`		B	`1`	`1`	`51622`	`◊`	[NAG]A:1309	`2`	`1`	`359`	`18.5`	`0.8`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`81`		C	`3`	`1`	`51545`	`◊`	[NAG]O:2	`3`	`1`	`361`	`17.1`	`0.7`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`82`		C	`1`	`1`	`51545`	`◊`	[NAG]B:1309	`3`	`1`	`365`	`16.9`	`0.2`	`0.381`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`83`		A	`2`	`1`	`51290`	`◊`	[NAG]C:1308	`3`	`1`	`359`	`14.5`	`-0.1`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`84`		B	`1`	`1`	`51622`	`◊`	[NAG]A:1308	`3`	`1`	`365`	`8.4`	`-0.3`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`85`		A	`2`	`2`	`51290`	`◊`	[NAG]F:2	`2`	`1`	`364`	`4.2`	`0.2`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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