PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=217-55-67G)

Interfaces in PDB 7laa

STRUCTURE OF SARS-COV-2 S PROTEIN IN COMPLEX WITH RECEPTOR BINDING DOMAIN ANTIBODY DH1041

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`453`	`138`	`50724`	`◊`	B	`486`	`139`	`40953`	`4302.2`	`-54.0`	`0.090`	`31`	`8`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`447`	`130`	`50724`	`◊`	C	`420`	`118`	`40816`	`3989.6`	`-49.5`	`0.096`	`26`	`9`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`410`	`116`	`40953`	`◊`	C	`444`	`127`	`40816`	`3935.3`	`-47.0`	`0.140`	`25`	`7`	`0`	`0.000`
4	`4`		H	`206`	`58`	`11902`	`◊`	L	`224`	`64`	`12089`	`1947.7`	`-29.1`	`0.050`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`64`	`17`	`50724`	`◊`	H	`75`	`20`	`11902`	`645.5`	`-3.4`	`0.521`	`10`	`6`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`22`	`9`	`50724`	`c`	[NAG]A:1203	`9`	`1`	`359`	`150.1`	`3.4`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		C	`16`	`9`	`40816`	`c`	[NAG]S:1	`13`	`1`	`367`	`141.1`	`2.8`	`0.274`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`16`	`9`	`50724`	`c`	[NAG]F:1	`12`	`1`	`362`	`139.3`	`2.8`	`0.301`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		C	`20`	`7`	`40816`	`c`	[NAG]U:1	`11`	`1`	`366`	`138.3`	`3.3`	`0.423`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		A	`14`	`6`	`50724`	`c`	[NAG]I:1	`11`	`1`	`367`	`132.3`	`3.3`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		C	`12`	`5`	`40816`	`c`	[NAG]T:1	`11`	`1`	`365`	`131.4`	`3.2`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`13`	`5`	`40953`	`c`	[NAG]O:1	`10`	`1`	`364`	`130.3`	`3.3`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`130.9`	`3.2`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		B	`17`	`5`	`40953`	`c`	[NAG]P:1	`11`	`1`	`360`	`130.1`	`3.0`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		A	`16`	`8`	`50724`	`c`	[NAG]E:1	`8`	`1`	`366`	`129.8`	`3.2`	`0.542`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		B	`13`	`6`	`40953`	`c`	[NAG]B:1202	`10`	`1`	`366`	`129.4`	`1.6`	`0.251`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		A	`12`	`5`	`50724`	`c`	[NAG]A:1201	`11`	`1`	`358`	`126.1`	`2.5`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		A	`12`	`5`	`50724`	`c`	[NAG]J:1	`12`	`1`	`363`	`125.8`	`2.5`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		B	`15`	`8`	`40953`	`c`	[NAG]N:1	`13`	`1`	`360`	`125.0`	`2.2`	`0.216`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		C	`12`	`5`	`40816`	`c`	[NAG]C:1205	`9`	`1`	`365`	`121.3`	`3.2`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		B	`19`	`6`	`40953`	`c`	[NAG]B:1201	`9`	`1`	`362`	`117.6`	`3.6`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		C	`13`	`6`	`40816`	`c`	[NAG]C:1203	`9`	`1`	`364`	`114.9`	`2.8`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		B	`9`	`3`	`40953`	`c`	[NAG]B:1205	`8`	`1`	`363`	`109.8`	`2.9`	`0.520`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		C	`13`	`5`	`40816`	`c`	[NAG]C:1201	`10`	`1`	`359`	`104.4`	`2.4`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		A	`12`	`5`	`50724`	`c`	[NAG]G:1	`10`	`1`	`361`	`102.8`	`2.4`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		C	`10`	`4`	`40816`	`c`	[NAG]C:1204	`9`	`1`	`360`	`102.7`	`3.7`	`0.452`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		C	`12`	`5`	`40816`	`c`	[NAG]V:1	`8`	`1`	`365`	`100.4`	`3.0`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		B	`12`	`4`	`40953`	`c`	[NAG]B:1204	`9`	`1`	`366`	`99.9`	`2.4`	`0.372`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		C	`9`	`5`	`40816`	`c`	[NAG]C:1202	`9`	`1`	`358`	`99.0`	`2.0`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		B	`9`	`3`	`40953`	`c`	[NAG]B:1203	`10`	`1`	`370`	`98.1`	`1.7`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		B	`9`	`3`	`40953`	`c`	[NAG]M:1	`7`	`1`	`361`	`97.7`	`3.6`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		A	`11`	`3`	`50724`	`c`	[NAG]A:1205	`9`	`1`	`365`	`96.4`	`2.7`	`0.360`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`32`		C	`12`	`5`	`40816`	`c`	[NAG]C:1206	`11`	`1`	`365`	`95.0`	`2.9`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		B	`12`	`4`	`40953`	`c`	[NAG]B:1206	`8`	`1`	`364`	`91.3`	`2.7`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		A	`12`	`4`	`50724`	`c`	[NAG]A:1202	`9`	`1`	`363`	`89.4`	`2.5`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		C	`7`	`4`	`40816`	`c`	[NAG]R:1	`8`	`1`	`368`	`87.7`	`2.4`	`0.399`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`36`		B	`11`	`4`	`40953`	`c`	[NAG]Q:1	`6`	`1`	`366`	`84.8`	`2.7`	`0.604`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		A	`10`	`3`	`50724`	`c`	[NAG]A:1204	`8`	`1`	`359`	`82.8`	`2.0`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`359`	`80.5`	`1.7`	`0.099`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		A	`10`	`4`	`50724`	`◊`	L	`11`	`3`	`12089`	`79.7`	`-0.4`	`0.609`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		A	`10`	`5`	`50724`	`c`	[NAG]K:1	`8`	`1`	`366`	`78.4`	`2.3`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		[NAG]G:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`358`	`73.1`	`1.8`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]F:2	`10`	`1`	`367`	`72.7`	`1.8`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		[NAG]U:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]U:2	`7`	`1`	`364`	`72.3`	`1.9`	`0.142`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[NAG]I:1	`8`	`1`	`367`	`c`	[NAG]I:2	`7`	`1`	`359`	`71.5`	`1.9`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		[NAG]J:1	`7`	`1`	`363`	`c`	[NAG]J:2	`9`	`1`	`366`	`69.8`	`1.3`	`0.068`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		[NAG]M:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`366`	`69.7`	`1.4`	`0.069`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		C	`10`	`4`	`40816`	`◊`	[NAG]S:2	`4`	`1`	`366`	`67.6`	`1.2`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		C	`8`	`4`	`40816`	`◊`	[NAG]T:2	`7`	`1`	`361`	`67.6`	`1.2`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		[NAG]S:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]S:2	`9`	`1`	`366`	`66.9`	`1.5`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NAG]V:1	`5`	`1`	`365`	`c`	[NAG]V:2	`7`	`1`	`365`	`66.6`	`1.2`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]P:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]P:2	`10`	`1`	`364`	`64.6`	`1.2`	`0.069`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.0`	`1.3`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`52`		A	`6`	`2`	`50724`	`c`	[NAG]D:1	`7`	`1`	`363`	`66.7`	`2.1`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]R:2	`9`	`1`	`367`	`66.4`	`1.2`	`0.076`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		A	`5`	`3`	`50724`	`◊`	[NAG]I:2	`5`	`1`	`359`	`65.0`	`0.6`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		[NAG]E:1	`8`	`1`	`366`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`361`	`64.5`	`1.2`	`0.051`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		[NAG]N:1	`5`	`1`	`360`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`364`	`64.3`	`1.1`	`0.080`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		[NAG]Q:1	`5`	`1`	`366`	`c`	[NAG]Q:2	`7`	`1`	`364`	`63.5`	`1.2`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`362`	`62.7`	`1.1`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[NAG]T:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]T:2	`8`	`1`	`361`	`61.4`	`1.0`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`62.5`	`1.1`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`60`		[NAG]K:1	`7`	`1`	`366`	`c`	[NAG]K:2	`8`	`1`	`366`	`63.1`	`1.0`	`0.069`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`61`		[NAG]N:2	`5`	`1`	`364`	`c`	[BMA]N:3	`6`	`1`	`293`	`62.6`	`1.0`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`62`		[NAG]P:2	`7`	`1`	`364`	`c`	[BMA]P:3	`6`	`1`	`295`	`62.4`	`1.2`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`63`		B	`9`	`3`	`40953`	`◊`	[NAG]N:2	`6`	`1`	`364`	`62.3`	`1.5`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`64`		[NAG]U:2	`6`	`1`	`364`	`c`	[BMA]U:3	`6`	`1`	`295`	`61.8`	`0.9`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`65`		[NAG]S:2	`4`	`1`	`366`	`c`	[BMA]S:3	`6`	`1`	`294`	`61.4`	`1.1`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`66`		A	`10`	`3`	`50724`	`◊`	[NAG]F:2	`4`	`1`	`367`	`59.9`	`1.0`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`67`		[NAG]K:2	`4`	`1`	`366`	`c`	[BMA]K:3	`6`	`1`	`294`	`58.2`	`0.9`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`68`		[NAG]J:2	`4`	`1`	`366`	`c`	[BMA]J:3	`6`	`1`	`290`	`57.7`	`1.1`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`69`		B	`8`	`3`	`40953`	`◊`	[NAG]O:2	`6`	`1`	`362`	`53.1`	`0.7`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`70`		B	`3`	`1`	`40953`	`◊`	[NAG]P:2	`6`	`1`	`364`	`46.1`	`1.6`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`71`		A	`5`	`1`	`50724`	`◊`	[NAG]J:2	`4`	`1`	`366`	`41.0`	`1.0`	`0.428`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`72`		C	`5`	`2`	`40816`	`◊`	[NAG]D:1	`2`	`1`	`363`	`36.1`	`0.8`	`0.523`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`73`		C	`3`	`2`	`40816`	`◊`	[NAG]U:2	`5`	`1`	`364`	`36.0`	`0.8`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`74`		A	`8`	`4`	`50724`	`◊`	[NAG]C:1205	`6`	`1`	`365`	`27.9`	`0.1`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`75`		A	`2`	`2`	`50724`	`◊`	[NAG]K:2	`1`	`1`	`366`	`24.7`	`0.8`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`76`		C	`2`	`1`	`40816`	`◊`	[NAG]O:1	`5`	`1`	`364`	`23.0`	`0.9`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		B	`2`	`1`	`40953`	`◊`	[NAG]I:1	`4`	`1`	`367`	`21.3`	`0.8`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`22.1`	`0.9`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`78`		A	`3`	`1`	`50724`	`◊`	[NAG]T:1	`3`	`1`	`365`	`18.7`	`0.8`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`79`		A	`3`	`2`	`50724`	`◊`	[NAG]B:1203	`2`	`1`	`370`	`14.8`	`0.7`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`80`		A	`2`	`1`	`50724`	`◊`	[NAG]M:1	`3`	`1`	`361`	`10.8`	`-0.1`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`81`		A	`2`	`2`	`50724`	`◊`	[NAG]G:2	`1`	`1`	`358`	`9.8`	`0.4`	`0.765`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`82`		B	`1`	`1`	`40953`	`◊`	[NAG]E:1	`4`	`1`	`366`	`9.4`	`-0.4`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`83`		C	`2`	`2`	`40816`	`◊`	[NAG]B:1205	`3`	`1`	`363`	`8.9`	`0.0`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`84`		A	`1`	`1`	`50724`	`◊`	[NAG]T:2	`1`	`1`	`361`	`7.5`	`0.1`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`85`		B	`1`	`1`	`40953`	`◊`	[NAG]Q:2	`2`	`1`	`364`	`5.6`	`0.2`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`86`		B	`1`	`1`	`40953`	`◊`	[NAG]R:1	`1`	`1`	`368`	`1.7`	`-0.0`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`87`		B	`1`	`1`	`40953`	`◊`	[NAG]I:2	`1`	`1`	`359`	`0.3`	`-0.0`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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