PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=424-92-B21)

Interfaces in PDB 7ls5

CRYO-EM STRUCTURE OF THE PRE3-1 20S PROTEASOME CORE PARTICLE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`179`	`42`	`12334`	`◊`	D	`155`	`34`	`12617`	`1585.3`	`-8.5`	`0.326`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
	`2`		Q	`176`	`42`	`12609`	`◊`	R	`140`	`31`	`12573`	`1484.0`	`-11.0`	`0.211`	`12`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1534.7`	`-9.7`	`0.268`	`12`	`3`	`0`	`0.000`
2	`3`		I	`154`	`42`	`12558`	`◊`	J	`178`	`48`	`9604`	`1572.2`	`-18.0`	`0.157`	`15`	`14`	`0`	`0.000`
	`4`		W	`154`	`42`	`12535`	`◊`	X	`177`	`48`	`9516`	`1565.7`	`-17.4`	`0.175`	`13`	`14`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1569.0`	`-17.7`	`0.166`	`14`	`14`	`0`	`0.000`
3	`5`		A	`156`	`39`	`12636`	`◊`	B	`145`	`39`	`13182`	`1450.7`	`-16.2`	`0.135`	`13`	`1`	`0`	`0.000`
	`6`		O	`149`	`39`	`12392`	`◊`	P	`133`	`35`	`12642`	`1383.3`	`-14.9`	`0.154`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1417.0`	`-15.5`	`0.145`	`13`	`1`	`0`	`0.000`
4	`7`		B	`160`	`42`	`13182`	`◊`	C	`138`	`38`	`12334`	`1414.9`	`-17.7`	`0.072`	`9`	`2`	`0`	`0.000`
	`8`		P	`160`	`42`	`12642`	`◊`	Q	`137`	`38`	`12609`	`1404.5`	`-18.1`	`0.065`	`8`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1409.7`	`-17.9`	`0.069`	`9`	`2`	`0`	`0.000`
5	`9`		I	`134`	`36`	`12558`	`◊`	1	`148`	`38`	`11615`	`1399.7`	`-6.1`	`0.539`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
	`10`		W	`135`	`36`	`12535`	`◊`	M	`146`	`38`	`11534`	`1398.7`	`-6.2`	`0.542`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1399.2`	`-6.2`	`0.541`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
6	`11`		T	`150`	`43`	`11308`	`◊`	U	`147`	`35`	`12001`	`1352.9`	`-11.0`	`0.217`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
	`12`		F	`150`	`43`	`11239`	`◊`	G	`147`	`35`	`12069`	`1348.0`	`-11.0`	`0.219`	`12`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1350.4`	`-11.0`	`0.218`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
7	`13`		O	`138`	`31`	`12392`	`◊`	U	`160`	`39`	`12001`	`1349.7`	`-13.0`	`0.187`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		A	`136`	`31`	`12636`	`◊`	G	`159`	`39`	`12069`	`1333.8`	`-13.0`	`0.171`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1341.7`	`-13.0`	`0.179`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		R	`145`	`37`	`12573`	`◊`	S	`133`	`35`	`12216`	`1307.4`	`-10.8`	`0.185`	`15`	`3`	`0`	`0.000`
	`16`		D	`144`	`37`	`12617`	`◊`	E	`130`	`34`	`12109`	`1292.2`	`-10.9`	`0.183`	`14`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1299.8`	`-10.8`	`0.184`	`15`	`3`	`0`	`0.000`
9	`17`		V	`144`	`40`	`9340`	`◊`	N	`130`	`28`	`12298`	`1264.1`	`-9.2`	`0.319`	`14`	`2`	`0`	`0.000`
	`18`		H	`142`	`39`	`9333`	`◊`	2	`130`	`28`	`12221`	`1262.1`	`-9.3`	`0.333`	`14`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1263.1`	`-9.3`	`0.326`	`14`	`3`	`0`	`0.000`
10	`19`		S	`112`	`33`	`12216`	`◊`	T	`111`	`29`	`11308`	`1042.6`	`-11.5`	`0.106`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
	`20`		E	`110`	`32`	`12109`	`◊`	F	`107`	`29`	`11239`	`1035.0`	`-11.2`	`0.107`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1038.8`	`-11.3`	`0.107`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
11	`21`		X	`103`	`25`	`9516`	`◊`	L	`107`	`28`	`9945`	`978.6`	`-1.9`	`0.693`	`11`	`6`	`0`	`0.000`
	`22`		J	`101`	`24`	`9604`	`◊`	Z	`107`	`28`	`10043`	`970.6`	`-2.0`	`0.687`	`13`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`974.6`	`-1.9`	`0.690`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
12	`23`		1	`97`	`29`	`11615`	`◊`	2	`94`	`27`	`12221`	`917.2`	`-2.1`	`0.554`	`9`	`8`	`0`	`0.000`
	`24`		M	`97`	`29`	`11534`	`◊`	N	`92`	`27`	`12298`	`906.8`	`-2.1`	`0.535`	`8`	`8`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`912.0`	`-2.1`	`0.545`	`9`	`8`	`0`	`0.000`
13	`25`		W	`99`	`27`	`12535`	`◊`	N	`95`	`24`	`12298`	`910.7`	`-9.8`	`0.263`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`26`		I	`100`	`27`	`12558`	`◊`	2	`95`	`24`	`12221`	`901.0`	`-9.8`	`0.266`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`905.9`	`-9.8`	`0.265`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
14	`27`		Y	`83`	`20`	`9873`	`◊`	L	`84`	`20`	`9945`	`723.4`	`-3.7`	`0.365`	`5`	`9`	`0`	`0.000`
	`28`		K	`81`	`19`	`9898`	`◊`	Z	`84`	`20`	`10043`	`721.0`	`-3.8`	`0.342`	`5`	`9`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`722.2`	`-3.8`	`0.353`	`5`	`9`	`0`	`0.000`
15	`29`		Z	`78`	`23`	`10043`	`◊`	1	`82`	`23`	`11615`	`722.9`	`-4.9`	`0.292`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
	`30`		L	`79`	`23`	`9945`	`◊`	M	`82`	`23`	`11534`	`722.6`	`-4.9`	`0.290`	`5`	`5`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`722.8`	`-4.9`	`0.291`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
16	`31`		X	`86`	`20`	`9516`	`◊`	M	`84`	`22`	`11534`	`679.3`	`-3.6`	`0.453`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
	`32`		J	`87`	`20`	`9604`	`◊`	1	`84`	`21`	`11615`	`678.9`	`-3.6`	`0.463`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`679.1`	`-3.6`	`0.458`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
17	`33`		Y	`64`	`18`	`9873`	`◊`	Z	`77`	`23`	`10043`	`671.0`	`-0.5`	`0.615`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
	`34`		K	`62`	`18`	`9898`	`◊`	L	`77`	`23`	`9945`	`662.7`	`-0.6`	`0.604`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`666.9`	`-0.6`	`0.610`	`5`	`5`	`0`	`0.000`
18	`35`		P	`76`	`20`	`12642`	`◊`	W	`63`	`17`	`12535`	`670.1`	`-6.0`	`0.405`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`36`		B	`76`	`20`	`13182`	`◊`	I	`62`	`17`	`12558`	`669.5`	`-6.4`	`0.375`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`669.8`	`-6.2`	`0.390`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
19	`37`		A	`70`	`17`	`12636`	`◊`	I	`60`	`15`	`12558`	`644.8`	`-1.6`	`0.594`	`6`	`10`	`0`	`0.000`
	`38`		O	`69`	`17`	`12392`	`◊`	W	`60`	`15`	`12535`	`643.9`	`-1.7`	`0.605`	`6`	`10`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`644.4`	`-1.7`	`0.600`	`6`	`10`	`0`	`0.000`
20	`39`		K	`68`	`19`	`9898`	`◊`	Y	`72`	`19`	`9873`	`636.8`	`-1.8`	`0.464`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
21	`40`		V	`61`	`19`	`9340`	`◊`	2	`69`	`20`	`12221`	`623.7`	`-2.0`	`0.535`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	`41`		H	`60`	`19`	`9333`	`◊`	N	`72`	`20`	`12298`	`621.2`	`-1.7`	`0.580`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`622.4`	`-1.9`	`0.557`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
22	`42`		H	`70`	`16`	`9333`	`◊`	V	`70`	`16`	`9340`	`619.2`	`-6.9`	`0.215`	`3`	`7`	`0`	`0.000`
23	`43`		T	`60`	`15`	`11308`	`◊`	2	`67`	`19`	`12221`	`587.1`	`-1.1`	`0.577`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	`44`		F	`59`	`15`	`11239`	`◊`	N	`67`	`19`	`12298`	`581.8`	`-1.3`	`0.563`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`584.4`	`-1.2`	`0.570`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
24	`45`		J	`65`	`23`	`9604`	`◊`	K	`59`	`21`	`9898`	`558.3`	`-3.5`	`0.391`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`46`		X	`65`	`23`	`9516`	`◊`	Y	`56`	`19`	`9873`	`546.9`	`-4.0`	`0.351`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`552.6`	`-3.7`	`0.371`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
25	`47`		P	`44`	`12`	`12642`	`◊`	X	`56`	`16`	`9516`	`498.1`	`-4.6`	`0.312`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		B	`44`	`12`	`13182`	`◊`	J	`55`	`16`	`9604`	`496.4`	`-4.6`	`0.325`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`497.3`	`-4.6`	`0.318`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`49`		Q	`46`	`11`	`12609`	`◊`	Y	`54`	`15`	`9873`	`473.7`	`-1.1`	`0.473`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`50`		C	`46`	`11`	`12334`	`◊`	K	`54`	`15`	`9898`	`471.2`	`-1.2`	`0.466`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`472.5`	`-1.2`	`0.470`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
27	`51`		V	`51`	`16`	`9340`	`◊`	W	`50`	`20`	`12535`	`470.0`	`-2.7`	`0.547`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
	`52`		H	`52`	`16`	`9333`	`◊`	I	`52`	`20`	`12558`	`469.4`	`-2.6`	`0.568`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`469.7`	`-2.7`	`0.558`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
28	`53`		G	`44`	`11`	`12069`	`◊`	H	`59`	`17`	`9333`	`463.7`	`-3.2`	`0.399`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`54`		U	`45`	`11`	`12001`	`◊`	V	`56`	`15`	`9340`	`448.0`	`-2.9`	`0.416`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`455.8`	`-3.0`	`0.407`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
29	`55`		S	`48`	`11`	`12216`	`◊`	1	`53`	`15`	`11615`	`459.0`	`0.5`	`0.675`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`56`		E	`51`	`13`	`12109`	`◊`	M	`55`	`16`	`11534`	`453.7`	`0.5`	`0.672`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`456.4`	`0.5`	`0.674`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
30	`57`		C	`54`	`15`	`12334`	`◊`	J	`44`	`10`	`9604`	`456.6`	`-3.4`	`0.361`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		Q	`54`	`14`	`12609`	`◊`	X	`43`	`10`	`9516`	`450.9`	`-3.7`	`0.330`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`453.8`	`-3.6`	`0.346`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`59`		G	`54`	`16`	`12069`	`◊`	N	`52`	`12`	`12298`	`431.9`	`0.2`	`0.628`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
	`60`		U	`55`	`15`	`12001`	`◊`	2	`49`	`13`	`12221`	`424.5`	`-0.7`	`0.535`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`428.2`	`-0.2`	`0.581`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
32	`61`		S	`41`	`10`	`12216`	`◊`	Z	`35`	`9`	`10043`	`402.8`	`-3.4`	`0.310`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
	`62`		E	`41`	`10`	`12109`	`◊`	L	`35`	`9`	`9945`	`400.6`	`-3.4`	`0.315`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`401.7`	`-3.4`	`0.313`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
33	`63`		R	`43`	`13`	`12573`	`◊`	Z	`41`	`15`	`10043`	`394.3`	`0.6`	`0.699`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
	`64`		D	`44`	`12`	`12617`	`◊`	L	`41`	`15`	`9945`	`392.0`	`-0.1`	`0.642`	`2`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`393.2`	`0.3`	`0.671`	`2`	`7`	`0`	`0.000`
34	`65`		D	`47`	`11`	`12617`	`◊`	K	`38`	`9`	`9898`	`384.8`	`-3.9`	`0.203`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
	`66`		R	`46`	`11`	`12573`	`◊`	Y	`40`	`9`	`9873`	`376.9`	`-3.9`	`0.206`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`380.9`	`-3.9`	`0.204`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
35	`67`		A	`44`	`13`	`12636`	`◊`	H	`45`	`10`	`9333`	`377.1`	`-3.6`	`0.331`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		O	`47`	`13`	`12392`	`◊`	V	`44`	`10`	`9340`	`375.7`	`-3.9`	`0.324`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`376.4`	`-3.8`	`0.328`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`69`		F	`43`	`11`	`11239`	`◊`	M	`37`	`8`	`11534`	`339.8`	`-1.5`	`0.455`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`70`		T	`44`	`11`	`11308`	`◊`	1	`37`	`8`	`11615`	`335.7`	`-1.7`	`0.438`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`337.8`	`-1.6`	`0.446`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
37	`71`		B	`12`	`4`	`13182`	`◊`	G	`24`	`7`	`12069`	`171.4`	`-3.5`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		P	`3`	`1`	`12642`	`◊`	U	`3`	`1`	`12001`	`32.2`	`0.4`	`0.777`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`101.8`	`-1.6`	`0.428`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`73`		A	`19`	`3`	`12636`	`◊`	C	`21`	`4`	`12334`	`151.5`	`-1.8`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		O	`16`	`3`	`12392`	`◊`	Q	`19`	`4`	`12609`	`132.4`	`-2.4`	`0.201`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`141.9`	`-2.1`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`75`		Q	`14`	`4`	`12609`	`◊`	U	`14`	`5`	`12001`	`131.4`	`0.5`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		C	`9`	`3`	`12334`	`◊`	G	`14`	`6`	`12069`	`114.6`	`0.7`	`0.690`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`123.0`	`0.6`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`77`		B	`11`	`3`	`13182`	`◊`	D	`15`	`4`	`12617`	`117.3`	`-0.3`	`0.564`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
	`78`		P	`8`	`2`	`12642`	`◊`	R	`11`	`2`	`12573`	`77.8`	`-1.7`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`97.5`	`-1.0`	`0.409`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
41	`79`		C	`10`	`2`	`12334`	`◊`	E	`15`	`5`	`12109`	`114.6`	`2.1`	`0.834`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	`80`		Q	`10`	`2`	`12609`	`◊`	S	`13`	`4`	`12216`	`96.3`	`0.7`	`0.714`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`105.4`	`1.4`	`0.774`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
42	`81`		Q	`9`	`4`	`12609`	`◊`	T	`16`	`5`	`11308`	`106.3`	`0.5`	`0.648`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	`82`		C	`4`	`2`	`12334`	`◊`	F	`5`	`1`	`11239`	`33.8`	`-0.2`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`70.0`	`0.1`	`0.541`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
43	`83`		O	`7`	`3`	`12392`	`◊`	N	`9`	`3`	`12298`	`77.8`	`1.0`	`0.740`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	`84`		A	`7`	`3`	`12636`	`◊`	2	`9`	`3`	`12221`	`77.2`	`1.0`	`0.739`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`77.5`	`1.0`	`0.740`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
44	`85`		I	`6`	`2`	`12558`	`◊`	Z	`7`	`3`	`10043`	`73.7`	`-2.1`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		W	`6`	`2`	`12535`	`◊`	L	`7`	`3`	`9945`	`63.1`	`-1.8`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.4`	`-2.0`	`0.149`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`87`		B	`8`	`2`	`13182`	`◊`	F	`6`	`3`	`11239`	`41.4`	`-0.0`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`88`		B	`3`	`1`	`13182`	`◊`	E	`6`	`1`	`12109`	`32.7`	`0.5`	`0.702`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`89`		C	`1`	`1`	`12334`	`◊`	I	`1`	`1`	`12558`	`0.2`	`-0.0`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe