PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=362-HB-586)

Interfaces in PDB 7lyk

SOUTH AFRICAN (B.1.351) SARS-COV-2 SPIKE PROTEIN VARIANT (S-GSAS- B.1.351) IN THE 2-RBD-UP CONFORMATION

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		A	`538`	`153`	`51543`	`◊`	C	`510`	`144`	`50570`	`4812.5`	`-57.6`	`0.083`	`49`	`8`	`0`	`0.000`
`2`		B	`442`	`125`	`51322`	`◊`	C	`487`	`136`	`50570`	`4355.0`	`-50.8`	`0.105`	`41`	`14`	`0`	`0.000`
`3`		A	`444`	`125`	`51543`	`◊`	B	`483`	`139`	`51322`	`4229.5`	`-54.4`	`0.055`	`40`	`7`	`0`	`0.000`
`4`		A	`15`	`7`	`51543`	`c`	[NAG]A:1305	`12`	`1`	`362`	`143.2`	`2.9`	`0.324`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`5`		C	`15`	`8`	`50570`	`c`	[NAG]C:1306	`13`	`1`	`352`	`140.9`	`2.3`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`6`		B	`14`	`8`	`51322`	`c`	[NAG]B:1305	`12`	`1`	`351`	`136.4`	`2.4`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`7`		C	`18`	`8`	`50570`	`c`	[NAG]C:1307	`11`	`1`	`357`	`132.4`	`4.2`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`8`		A	`15`	`8`	`51543`	`c`	[NAG]A:1304	`7`	`1`	`361`	`130.9`	`3.7`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`9`		B	`12`	`6`	`51322`	`c`	[NAG]B:1304	`8`	`1`	`359`	`126.2`	`3.7`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`10`		C	`10`	`4`	`50570`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`352`	`125.6`	`3.4`	`0.509`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		A	`13`	`5`	`51543`	`c`	[NAG]A:1307	`10`	`1`	`356`	`124.9`	`3.2`	`0.400`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`12`		C	`14`	`7`	`50570`	`c`	[NAG]C:1305	`8`	`1`	`361`	`124.6`	`3.4`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`13`		C	`12`	`4`	`50570`	`c`	[NAG]C:1302	`12`	`1`	`364`	`124.2`	`3.8`	`0.347`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`14`		B	`12`	`4`	`51322`	`c`	[NAG]B:1307	`9`	`1`	`357`	`121.5`	`3.1`	`0.467`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		A	`16`	`7`	`51543`	`c`	[NAG]A:1306	`11`	`1`	`360`	`118.8`	`3.8`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		B	`15`	`6`	`51322`	`c`	[NAG]B:1306	`10`	`1`	`359`	`118.0`	`3.3`	`0.470`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		C	`12`	`4`	`50570`	`c`	[NAG]C:1303	`10`	`1`	`355`	`106.3`	`2.6`	`0.406`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		C	`15`	`5`	`50570`	`c`	[NAG]C:1304	`8`	`1`	`359`	`102.6`	`3.0`	`0.488`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		B	`11`	`4`	`51322`	`c`	[NAG]B:1302	`9`	`1`	`353`	`101.8`	`2.3`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`20`		A	`10`	`4`	`51543`	`c`	[NAG]A:1303	`10`	`1`	`361`	`96.2`	`2.8`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`21`		A	`13`	`4`	`51543`	`c`	[NAG]A:1302	`9`	`1`	`356`	`94.8`	`2.5`	`0.381`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`22`		A	`9`	`3`	`51543`	`c`	[NAG]A:1301	`8`	`1`	`352`	`94.1`	`2.5`	`0.445`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`23`		B	`11`	`3`	`51322`	`c`	[NAG]B:1303	`7`	`1`	`361`	`90.2`	`3.2`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`24`		B	`11`	`3`	`51322`	`c`	[NAG]B:1308	`7`	`1`	`364`	`89.3`	`3.1`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`25`		C	`10`	`3`	`50570`	`c`	[NAG]C:1309	`6`	`1`	`361`	`87.9`	`3.1`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`26`		C	`8`	`3`	`50570`	`c`	[NAG]C:1301	`7`	`1`	`360`	`86.8`	`2.9`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`27`		A	`10`	`3`	`51543`	`c`	[NAG]A:1308	`7`	`1`	`360`	`86.0`	`3.0`	`0.600`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`28`		B	`11`	`4`	`51322`	`c`	[NAG]B:1301	`11`	`1`	`359`	`85.4`	`2.4`	`0.274`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`29`		B	`5`	`1`	`51322`	`◊`	[NAG]C:1301	`5`	`1`	`360`	`49.3`	`0.4`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`30`		C	`5`	`1`	`50570`	`◊`	[NAG]A:1301	`5`	`1`	`352`	`41.4`	`0.3`	`0.252`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`31`		A	`5`	`2`	`51543`	`◊`	[NAG]C:1305	`4`	`1`	`361`	`33.9`	`0.4`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`32`		B	`3`	`1`	`51322`	`◊`	[NAG]A:1304	`4`	`1`	`361`	`25.9`	`0.4`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`33`		C	`2`	`1`	`50570`	`◊`	[NAG]B:1304	`4`	`1`	`359`	`25.2`	`0.5`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`34`		B	`3`	`1`	`51322`	`◊`	[NAG]A:1307	`3`	`1`	`356`	`19.0`	`0.8`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`35`		A	`2`	`1`	`51543`	`◊`	[NAG]C:1308	`4`	`1`	`352`	`16.1`	`0.5`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`36`		C	`2`	`1`	`50570`	`◊`	[NAG]B:1307	`3`	`1`	`357`	`14.8`	`0.6`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe