PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=835-C3-JE3)

Interfaces in PDB 7n0g

CRYOEM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE PROTEIN (S-6P, 1-UP) IN COMPLEX WITH SYBODIES (SB45)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`482`	`141`	`54754`	`◊`	C	`510`	`145`	`55008`	`4682.6`	`-43.5`	`0.186`	`38`	`7`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`504`	`147`	`55178`	`◊`	C	`462`	`142`	`55008`	`4485.1`	`-43.0`	`0.203`	`36`	`5`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`444`	`131`	`55178`	`◊`	B	`491`	`134`	`54754`	`4353.5`	`-45.7`	`0.131`	`32`	`9`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`118`	`35`	`54754`	`◊`	Y	`114`	`27`	`7245`	`1071.4`	`-7.0`	`0.520`	`13`	`1`	`0`	`0.000`
	`5`		C	`112`	`33`	`55008`	`◊`	Z	`116`	`29`	`6899`	`997.3`	`-5.3`	`0.638`	`12`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1034.3`	`-6.1`	`0.579`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`122`	`37`	`55178`	`◊`	X	`120`	`29`	`7175`	`1062.2`	`-6.6`	`0.566`	`13`	`6`	`0`	`0.000`
6	`7`		A	`44`	`18`	`55178`	`◊`	Z	`59`	`16`	`6899`	`393.4`	`-1.1`	`0.591`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		C	`26`	`11`	`55008`	`◊`	Y	`22`	`6`	`7245`	`233.0`	`-3.1`	`0.254`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		A	`18`	`8`	`55178`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`357`	`150.8`	`3.8`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		C	`17`	`8`	`55008`	`c`	[NAG]V:1	`11`	`1`	`355`	`147.2`	`3.3`	`0.354`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		B	`19`	`9`	`54754`	`c`	[NAG]B:1303	`12`	`1`	`359`	`145.1`	`4.0`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		A	`18`	`9`	`55178`	`c`	[NAG]P:1	`11`	`1`	`363`	`143.0`	`3.6`	`0.450`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		C	`13`	`5`	`55008`	`c`	[NAG]C:1311	`12`	`1`	`359`	`136.7`	`3.2`	`0.341`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		B	`14`	`5`	`54754`	`c`	[NAG]B:1313	`11`	`1`	`359`	`135.1`	`3.1`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		B	`18`	`8`	`54754`	`c`	[NAG]B:1312	`12`	`1`	`364`	`130.9`	`2.9`	`0.315`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		C	`10`	`4`	`55008`	`c`	[NAG]N:1	`11`	`1`	`361`	`130.7`	`3.1`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		A	`17`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]I:1	`12`	`1`	`349`	`130.7`	`3.4`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		C	`16`	`5`	`55008`	`c`	[NAG]C:1305	`13`	`1`	`361`	`127.5`	`2.4`	`0.259`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		C	`23`	`6`	`55008`	`c`	[NAG]C:1303	`10`	`1`	`361`	`125.1`	`2.5`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		B	`14`	`5`	`54754`	`c`	[NAG]K:1	`11`	`1`	`361`	`124.8`	`3.3`	`0.371`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		A	`15`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]H:1	`10`	`1`	`356`	`124.0`	`3.5`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		A	`14`	`8`	`55178`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`362`	`123.3`	`3.1`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		C	`16`	`7`	`55008`	`c`	[NAG]L:1	`11`	`1`	`361`	`123.1`	`2.3`	`0.341`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		B	`14`	`7`	`54754`	`c`	[NAG]B:1305	`10`	`1`	`344`	`121.1`	`3.1`	`0.448`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		A	`11`	`4`	`55178`	`c`	[NAG]A:1304	`13`	`1`	`359`	`120.9`	`3.2`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		B	`12`	`4`	`54754`	`c`	[NAG]B:1304	`13`	`1`	`359`	`119.6`	`3.4`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		C	`13`	`6`	`55008`	`c`	[NAG]W:1	`9`	`1`	`352`	`117.5`	`2.5`	`0.380`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		B	`14`	`5`	`54754`	`c`	[NAG]B:1311	`9`	`1`	`363`	`115.7`	`2.9`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		C	`12`	`5`	`55008`	`c`	[NAG]C:1310	`7`	`1`	`363`	`103.2`	`3.0`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`109.5`	`2.9`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		A	`14`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]A:1301	`8`	`1`	`353`	`115.6`	`3.6`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		A	`9`	`4`	`55178`	`c`	[NAG]G:1	`10`	`1`	`357`	`114.8`	`3.9`	`0.427`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		C	`10`	`4`	`55008`	`c`	[NAG]M:1	`9`	`1`	`360`	`113.7`	`3.8`	`0.555`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		B	`14`	`7`	`54754`	`c`	[NAG]B:1302	`10`	`1`	`352`	`112.0`	`2.5`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		A	`18`	`6`	`55178`	`c`	[NAG]A:1302	`11`	`1`	`359`	`111.3`	`3.1`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		C	`13`	`8`	`55008`	`c`	[NAG]C:1304	`9`	`1`	`360`	`109.1`	`3.6`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		B	`12`	`4`	`54754`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`361`	`108.1`	`2.7`	`0.400`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		B	`13`	`4`	`54754`	`c`	[NAG]R:1	`8`	`1`	`352`	`106.1`	`3.1`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		B	`12`	`4`	`54754`	`c`	[NAG]J:1	`10`	`1`	`356`	`105.0`	`3.2`	`0.396`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		C	`14`	`4`	`55008`	`c`	[NAG]U:1	`9`	`1`	`364`	`104.7`	`3.1`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		A	`12`	`4`	`55178`	`c`	[NAG]D:1	`11`	`1`	`354`	`104.0`	`3.0`	`0.321`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		A	`14`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]A:1307	`7`	`1`	`352`	`101.3`	`2.5`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		A	`9`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]O:1	`10`	`1`	`349`	`100.6`	`1.6`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		C	`8`	`2`	`55008`	`c`	[NAG]C:1302	`9`	`1`	`360`	`100.5`	`2.4`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		C	`14`	`6`	`55008`	`c`	[NAG]C:1306	`10`	`1`	`358`	`98.0`	`3.1`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		A	`10`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]Q:1	`9`	`1`	`364`	`94.3`	`2.1`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[NAG]W:1	`10`	`1`	`352`	`c`	[NAG]W:2	`11`	`1`	`361`	`91.7`	`2.6`	`0.065`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		C	`10`	`3`	`55008`	`c`	[NAG]C:1309	`7`	`1`	`356`	`91.1`	`3.9`	`0.527`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		A	`11`	`4`	`55178`	`c`	[NAG]A:1303	`10`	`1`	`358`	`88.7`	`1.8`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		B	`7`	`3`	`54754`	`c`	[NAG]S:1	`7`	`1`	`354`	`87.2`	`2.2`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		B	`10`	`3`	`54754`	`c`	[NAG]B:1310	`9`	`1`	`365`	`85.8`	`2.6`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		B	`6`	`2`	`54754`	`c`	[NAG]B:1308	`12`	`1`	`351`	`84.8`	`1.4`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		A	`10`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]A:1306	`9`	`1`	`355`	`84.7`	`3.5`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		A	`7`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]C:1301	`8`	`1`	`352`	`83.4`	`2.6`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		B	`8`	`3`	`54754`	`c`	[NAG]B:1309	`8`	`1`	`359`	`83.2`	`1.3`	`0.244`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`55`		[NAG]V:1	`9`	`1`	`355`	`c`	[NAG]V:2	`9`	`1`	`357`	`82.2`	`2.5`	`0.080`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		C	`10`	`6`	`55008`	`◊`	[NAG]V:2	`8`	`1`	`357`	`81.0`	`1.7`	`0.352`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`57`		[NAG]D:1	`10`	`1`	`354`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`345`	`79.7`	`2.7`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`58`		A	`7`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]A:1305	`11`	`1`	`354`	`79.1`	`2.3`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[NAG]O:1	`9`	`1`	`349`	`c`	[NAG]O:2	`10`	`1`	`362`	`78.8`	`2.0`	`0.063`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`60`		A	`7`	`4`	`55178`	`c`	[NAG]A:1308	`7`	`1`	`356`	`78.7`	`2.6`	`0.454`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`61`		B	`8`	`4`	`54754`	`c`	[NAG]B:1314	`10`	`1`	`355`	`77.7`	`2.4`	`0.274`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`62`		C	`6`	`2`	`55008`	`c`	[NAG]C:1307	`7`	`1`	`355`	`76.6`	`2.9`	`0.544`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
61	`63`		B	`9`	`4`	`54754`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`362`	`75.3`	`2.0`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		[NAG]E:1	`7`	`1`	`357`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`356`	`75.0`	`1.7`	`0.076`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`356`	`c`	[NAG]J:2	`9`	`1`	`360`	`74.3`	`2.3`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`360`	`73.6`	`2.0`	`0.112`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		B	`6`	`2`	`54754`	`c`	[NAG]B:1307	`10`	`1`	`352`	`73.1`	`1.8`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		[NAG]G:1	`5`	`1`	`357`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`361`	`73.0`	`2.2`	`0.127`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		C	`8`	`4`	`55008`	`c`	[NAG]C:1312	`7`	`1`	`356`	`71.7`	`2.2`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`70`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]F:2	`10`	`1`	`364`	`71.4`	`1.4`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[NAG]K:1	`5`	`1`	`361`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`360`	`70.3`	`1.7`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`70.8`	`1.6`	`0.091`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`72`		[NAG]I:1	`5`	`1`	`349`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`351`	`71.1`	`1.5`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`73`		[NAG]H:1	`5`	`1`	`356`	`c`	[NAG]H:2	`9`	`1`	`361`	`70.3`	`1.9`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`74`		[NAG]N:1	`8`	`1`	`361`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`359`	`69.1`	`1.2`	`0.050`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
72	`75`		[NAG]P:1	`9`	`1`	`363`	`c`	[NAG]P:2	`9`	`1`	`356`	`67.6`	`1.3`	`0.050`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
73	`76`		A	`8`	`5`	`55178`	`◊`	[NAG]E:2	`8`	`1`	`356`	`67.4`	`1.7`	`0.353`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
74	`77`		C	`12`	`4`	`55008`	`◊`	[NAG]L:2	`6`	`1`	`362`	`67.3`	`1.4`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`78`		[NAG]Q:1	`8`	`1`	`364`	`c`	[NAG]Q:2	`9`	`1`	`360`	`66.8`	`1.4`	`0.051`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
76	`79`		[NAG]U:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]U:2	`6`	`1`	`355`	`66.0`	`1.3`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`80`		C	`5`	`2`	`55008`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`354`	`64.7`	`1.6`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`81`		[NAG]L:1	`5`	`1`	`361`	`c`	[NAG]L:2	`10`	`1`	`362`	`64.4`	`0.8`	`0.065`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
79	`82`		A	`11`	`4`	`55178`	`◊`	[NAG]F:2	`4`	`1`	`364`	`64.3`	`1.1`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`83`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`352`	`c`	[NAG]R:2	`8`	`1`	`362`	`59.7`	`0.6`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`84`		[NAG]S:1	`6`	`1`	`354`	`c`	[NAG]S:2	`7`	`1`	`353`	`57.5`	`1.7`	`0.072`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`85`		C	`3`	`2`	`55008`	`c`	[NAG]C:1301	`5`	`1`	`352`	`57.3`	`1.9`	`0.541`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
83	`86`		C	`4`	`1`	`55008`	`c`	[NAG]B:1315	`7`	`1`	`357`	`54.8`	`1.6`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`87`		B	`3`	`1`	`54754`	`c`	[NAG]B:1315	`3`	`1`	`357`	`54.6`	`1.1`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`88`		C	`10`	`4`	`55008`	`◊`	[NAG]W:2	`5`	`1`	`361`	`52.0`	`0.9`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`89`		C	`6`	`3`	`55008`	`◊`	[NAG]N:2	`6`	`1`	`359`	`46.4`	`0.4`	`0.217`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
87	`90`		B	`4`	`2`	`54754`	`◊`	[NAG]K:2	`4`	`1`	`360`	`41.9`	`0.4`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
88	`91`		A	`4`	`2`	`55178`	`◊`	[NAG]H:2	`5`	`1`	`361`	`40.3`	`0.5`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
89	`92`		X	`3`	`2`	`7175`	`◊`	Z	`5`	`2`	`6899`	`30.4`	`0.7`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
90	`93`		A	`5`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]I:2	`5`	`1`	`351`	`29.8`	`0.6`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
91	`94`		C	`2`	`1`	`55008`	`◊`	[NAG]K:1	`5`	`1`	`361`	`28.3`	`1.2`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
92	`95`		A	`2`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]N:1	`5`	`1`	`361`	`28.0`	`1.1`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
93	`96`		B	`1`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]A:1307	`5`	`1`	`352`	`22.8`	`0.6`	`0.289`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
94	`97`		A	`3`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]C:1310	`7`	`1`	`363`	`22.7`	`0.3`	`0.198`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
95	`98`		C	`6`	`3`	`55008`	`◊`	[NAG]Q:1	`1`	`1`	`364`	`22.2`	`0.7`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
96	`99`		C	`2`	`1`	`55008`	`◊`	[NAG]B:1311	`5`	`1`	`363`	`20.9`	`0.3`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
97	`100`		A	`2`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]G:2	`2`	`1`	`361`	`20.6`	`0.9`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
98	`101`		B	`2`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]H:1	`3`	`1`	`356`	`19.5`	`0.8`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
99	`102`		C	`2`	`2`	`55008`	`◊`	[NAG]M:2	`1`	`1`	`360`	`19.1`	`0.9`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
100	`103`		A	`2`	`2`	`55178`	`◊`	[NAG]D:2	`2`	`1`	`345`	`9.9`	`0.1`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
101	`104`		A	`2`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]P:2	`3`	`1`	`356`	`8.1`	`-0.0`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
102	`105`		A	`2`	`2`	`55178`	`◊`	[NAG]B:1305	`1`	`1`	`344`	`4.8`	`0.3`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
103	`106`		B	`1`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]W:1	`1`	`1`	`352`	`4.0`	`0.2`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
104	`107`		B	`1`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]C:1306	`1`	`1`	`358`	`3.4`	`-0.1`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
105	`108`		B	`1`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]S:2	`1`	`1`	`353`	`2.6`	`0.1`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
106	`109`		B	`1`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]J:2	`1`	`1`	`360`	`1.9`	`0.1`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
107	`110`		B	`1`	`1`	`54754`	`◊`	[NAG]R:2	`1`	`1`	`362`	`1.1`	`0.0`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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