PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=582-HN-4E6)

Interfaces in PDB 7nd3

EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN IN COMPLEX WITH COVOX-40 FAB

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`549`	`159`	`51621`	`◊`	C	`525`	`152`	`50606`	`5014.7`	`-51.2`	`0.227`	`33`	`8`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`470`	`142`	`51621`	`◊`	B	`512`	`150`	`51073`	`4537.3`	`-48.6`	`0.189`	`30`	`10`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`430`	`127`	`51073`	`◊`	C	`465`	`137`	`50606`	`4177.4`	`-44.9`	`0.201`	`34`	`9`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`69`	`19`	`51073`	`◊`	H	`57`	`19`	`5631`	`610.9`	`-2.2`	`0.700`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		H	`61`	`16`	`5631`	`◊`	L	`65`	`21`	`5562`	`555.8`	`-8.3`	`0.250`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		B	`47`	`16`	`51073`	`◊`	L	`36`	`13`	`5562`	`385.4`	`0.1`	`0.753`	`10`	`1`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`12`	`7`	`51073`	`c`	[NAG]B:1305	`8`	`1`	`357`	`140.4`	`3.7`	`0.536`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`15`	`5`	`51621`	`c`	[NAG]G:1	`13`	`1`	`363`	`138.3`	`3.0`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		C	`15`	`5`	`50606`	`c`	[NAG]C:1307	`11`	`1`	`357`	`134.9`	`3.4`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		B	`15`	`7`	`51073`	`c`	[NAG]B:1310	`12`	`1`	`364`	`133.9`	`2.9`	`0.365`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		A	`12`	`7`	`51621`	`c`	[NAG]A:1303	`8`	`1`	`355`	`133.3`	`3.6`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		B	`11`	`5`	`51073`	`c`	[NAG]B:1311	`11`	`1`	`357`	`131.3`	`3.7`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		B	`16`	`5`	`51073`	`c`	[NAG]K:1	`11`	`1`	`362`	`130.7`	`3.2`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		C	`15`	`5`	`50606`	`c`	[NAG]P:1	`12`	`1`	`361`	`130.5`	`3.4`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		C	`14`	`9`	`50606`	`c`	[NAG]N:1	`12`	`1`	`361`	`129.5`	`2.9`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		A	`13`	`7`	`51621`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`365`	`126.4`	`2.6`	`0.284`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		A	`13`	`6`	`51621`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`362`	`122.9`	`3.2`	`0.400`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		A	`12`	`4`	`51621`	`c`	[NAG]A:1308	`11`	`1`	`354`	`120.9`	`3.2`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		C	`11`	`5`	`50606`	`c`	[NAG]C:1306	`9`	`1`	`361`	`117.3`	`3.4`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		A	`12`	`5`	`51621`	`c`	[NAG]A:1302	`13`	`1`	`362`	`116.3`	`2.8`	`0.213`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`21`		B	`13`	`5`	`51073`	`c`	[NAG]J:1	`11`	`1`	`363`	`115.8`	`3.4`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		A	`13`	`5`	`51621`	`c`	[NAG]A:1307	`7`	`1`	`364`	`111.2`	`2.9`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`23`		B	`12`	`4`	`51073`	`c`	[NAG]B:1309	`7`	`1`	`363`	`106.6`	`2.7`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		C	`14`	`5`	`50606`	`c`	[NAG]O:1	`11`	`1`	`361`	`105.3`	`3.0`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		A	`10`	`3`	`51621`	`c`	[NAG]D:1	`12`	`1`	`363`	`103.7`	`1.6`	`0.224`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		B	`13`	`4`	`51073`	`c`	[NAG]B:1304	`10`	`1`	`363`	`102.9`	`3.3`	`0.434`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		C	`10`	`3`	`50606`	`c`	[NAG]C:1303	`10`	`1`	`356`	`99.7`	`3.3`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		B	`13`	`4`	`51073`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`363`	`96.0`	`2.0`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		C	`15`	`4`	`50606`	`c`	[NAG]C:1301	`7`	`1`	`357`	`95.4`	`2.8`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		B	`12`	`4`	`51073`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`361`	`94.3`	`2.3`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		C	`18`	`8`	`50606`	`c`	[NAG]C:1304	`8`	`1`	`364`	`94.0`	`3.0`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`32`		B	`11`	`4`	`51073`	`c`	[NAG]M:1	`7`	`1`	`363`	`92.7`	`3.0`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`33`		C	`13`	`4`	`50606`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`364`	`87.2`	`2.8`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`34`		C	`13`	`5`	`50606`	`◊`	[NAG]D:1	`7`	`1`	`363`	`86.9`	`2.9`	`0.589`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`35`		B	`6`	`3`	`51073`	`c`	[NAG]B:1303	`8`	`1`	`356`	`85.0`	`3.2`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`36`		B	`9`	`3`	`51073`	`c`	[NAG]B:1308	`8`	`1`	`365`	`82.5`	`2.9`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`37`		A	`9`	`4`	`51621`	`c`	[NAG]A:1301	`7`	`1`	`363`	`82.4`	`2.9`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`38`		A	`10`	`3`	`51621`	`c`	[NAG]A:1305	`7`	`1`	`364`	`82.3`	`2.3`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`39`		A	`12`	`3`	`51621`	`c`	[NAG]A:1306	`9`	`1`	`362`	`79.8`	`2.8`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`40`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`363`	`78.9`	`2.0`	`0.127`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]F:2	`8`	`1`	`366`	`74.2`	`1.7`	`0.115`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]O:2	`8`	`1`	`361`	`73.9`	`1.8`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`364`	`69.7`	`1.7`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`74.2`	`1.8`	`0.114`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`44`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`361`	`74.6`	`2.3`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`45`		C	`9`	`3`	`50606`	`c`	[NAG]C:1302	`6`	`1`	`357`	`73.1`	`2.6`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]D:2	`8`	`1`	`358`	`71.8`	`1.6`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`47`		C	`8`	`3`	`50606`	`c`	[NAG]C:1305	`8`	`1`	`362`	`70.9`	`2.4`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		[NAG]K:1	`7`	`1`	`362`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`363`	`70.8`	`1.4`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`49`		A	`10`	`4`	`51621`	`◊`	[NAG]E:2	`6`	`1`	`362`	`68.5`	`1.4`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`50`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`362`	`67.6`	`1.4`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]N:1	`5`	`1`	`361`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`361`	`65.5`	`1.5`	`0.103`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.6`	`1.4`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`52`		A	`9`	`4`	`51621`	`c`	[NAG]I:1	`8`	`1`	`363`	`66.8`	`2.0`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		A	`9`	`3`	`51621`	`◊`	[NAG]G:2	`5`	`1`	`360`	`66.6`	`1.7`	`0.539`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`54`		[NAG]G:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]G:2	`8`	`1`	`360`	`66.2`	`1.5`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`55`		[NAG]P:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]P:2	`10`	`1`	`364`	`65.8`	`1.2`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`56`		C	`9`	`4`	`50606`	`◊`	[NAG]N:2	`6`	`1`	`361`	`62.6`	`1.1`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`57`		B	`4`	`1`	`51073`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`363`	`60.4`	`1.9`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`58`		A	`6`	`2`	`51621`	`c`	[NAG]A:1304	`7`	`1`	`363`	`57.5`	`1.9`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`59`		C	`8`	`3`	`50606`	`◊`	[NAG]P:2	`5`	`1`	`364`	`55.8`	`1.5`	`0.467`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`60`		B	`5`	`2`	`51073`	`c`	[NAG]B:1307	`7`	`1`	`355`	`54.0`	`1.8`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`61`		C	`8`	`3`	`50606`	`◊`	[NAG]O:2	`4`	`1`	`361`	`47.3`	`1.8`	`0.627`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`62`		B	`6`	`2`	`51073`	`◊`	[NAG]K:2	`4`	`1`	`363`	`45.9`	`1.2`	`0.484`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`63`		B	`5`	`3`	`51073`	`◊`	[NAG]J:2	`2`	`1`	`364`	`35.6`	`1.3`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`64`		A	`5`	`2`	`51621`	`◊`	[NAG]D:2	`4`	`1`	`358`	`34.8`	`0.7`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`65`		C	`3`	`1`	`50606`	`◊`	[NAG]B:1309	`5`	`1`	`363`	`32.5`	`0.6`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`66`		C	`4`	`2`	`50606`	`◊`	[NAG]D:2	`3`	`1`	`358`	`26.8`	`0.5`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`67`		A	`1`	`1`	`51621`	`◊`	[NAG]C:1307	`5`	`1`	`357`	`26.2`	`1.1`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`68`		C	`3`	`1`	`50606`	`◊`	[NAG]B:1311	`4`	`1`	`357`	`24.2`	`1.0`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`69`		A	`1`	`1`	`51621`	`◊`	[NAG]B:1303	`5`	`1`	`356`	`20.2`	`0.0`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`70`		B	`1`	`1`	`51073`	`◊`	[NAG]A:1308	`2`	`1`	`354`	`17.7`	`0.8`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`71`		B	`1`	`1`	`51073`	`◊`	[NAG]A:1307	`3`	`1`	`364`	`15.1`	`-0.4`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`72`		B	`1`	`1`	`51073`	`◊`	[NAG]C:1302	`2`	`1`	`357`	`15.1`	`-0.1`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`73`		A	`3`	`2`	`51621`	`◊`	[NAG]C:1306	`4`	`1`	`361`	`13.6`	`-0.1`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`74`		A	`3`	`2`	`51621`	`◊`	[NAG]F:2	`1`	`1`	`366`	`10.0`	`0.3`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`75`		C	`3`	`2`	`50606`	`◊`	[NAG]A:1301	`4`	`1`	`363`	`9.5`	`-0.3`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe