PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=552-67-2AH)

Interfaces in PDB 7nd6

EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN IN COMPLEX WITH COVOX-40 FAB

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`539`	`155`	`51207`	`◊`	C	`520`	`153`	`50550`	`5005.8`	`-51.8`	`0.191`	`35`	`6`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`474`	`142`	`51207`	`◊`	B	`510`	`149`	`50929`	`4605.9`	`-49.2`	`0.189`	`34`	`10`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`430`	`124`	`50929`	`◊`	C	`478`	`137`	`50550`	`4225.0`	`-44.9`	`0.218`	`32`	`8`	`0`	`0.000`
4	`4`		H	`183`	`55`	`11736`	`◊`	L	`182`	`52`	`11689`	`1692.4`	`-23.7`	`0.092`	`17`	`6`	`1`	`0.000`
5	`5`		B	`68`	`21`	`50929`	`◊`	H	`69`	`22`	`11736`	`646.6`	`-0.7`	`0.786`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		B	`60`	`22`	`50929`	`◊`	L	`48`	`16`	`11689`	`492.9`	`1.9`	`0.769`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`12`	`7`	`50929`	`c`	[NAG]B:1305	`9`	`1`	`362`	`141.5`	`3.7`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`15`	`5`	`51207`	`c`	[NAG]G:1	`13`	`1`	`363`	`138.5`	`3.1`	`0.304`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		C	`17`	`9`	`50550`	`c`	[NAG]N:1	`12`	`1`	`363`	`138.1`	`3.2`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		A	`12`	`7`	`51207`	`c`	[NAG]A:1303	`8`	`1`	`357`	`133.7`	`3.6`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		C	`13`	`5`	`50550`	`c`	[NAG]C:1307	`11`	`1`	`359`	`133.3`	`3.6`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		B	`16`	`5`	`50929`	`c`	[NAG]K:1	`11`	`1`	`361`	`132.7`	`3.3`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		C	`15`	`5`	`50550`	`c`	[NAG]P:1	`12`	`1`	`361`	`132.0`	`3.4`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		B	`12`	`5`	`50929`	`c`	[NAG]B:1311	`11`	`1`	`356`	`129.8`	`3.6`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		A	`13`	`7`	`51207`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`362`	`128.2`	`2.7`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		B	`15`	`7`	`50929`	`c`	[NAG]B:1310	`13`	`1`	`365`	`125.3`	`3.0`	`0.327`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		A	`15`	`5`	`51207`	`c`	[NAG]A:1308	`11`	`1`	`355`	`124.9`	`3.6`	`0.469`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		C	`11`	`4`	`50550`	`c`	[NAG]C:1306	`8`	`1`	`360`	`116.8`	`3.4`	`0.559`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		A	`13`	`5`	`51207`	`c`	[NAG]A:1307	`7`	`1`	`362`	`116.8`	`3.0`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		A	`13`	`6`	`51207`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`362`	`116.4`	`3.3`	`0.367`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`21`		C	`15`	`5`	`50550`	`c`	[NAG]O:1	`11`	`1`	`358`	`110.5`	`3.2`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		A	`11`	`4`	`51207`	`c`	[NAG]A:1302	`13`	`1`	`358`	`109.3`	`2.9`	`0.239`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`23`		B	`13`	`5`	`50929`	`c`	[NAG]J:1	`11`	`1`	`362`	`106.3`	`3.0`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		B	`10`	`4`	`50929`	`c`	[NAG]B:1309	`9`	`1`	`364`	`102.2`	`2.8`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		B	`13`	`4`	`50929`	`c`	[NAG]B:1304	`10`	`1`	`364`	`101.1`	`3.2`	`0.417`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		C	`12`	`3`	`50550`	`c`	[NAG]C:1303	`9`	`1`	`357`	`100.5`	`3.3`	`0.466`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		A	`9`	`3`	`51207`	`c`	[NAG]D:1	`11`	`1`	`361`	`100.4`	`1.6`	`0.265`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		C	`16`	`5`	`50550`	`c`	[NAG]C:1301	`7`	`1`	`357`	`99.3`	`3.1`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		C	`20`	`8`	`50550`	`c`	[NAG]C:1304	`8`	`1`	`365`	`97.7`	`3.1`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		B	`13`	`4`	`50929`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`364`	`97.5`	`2.0`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		B	`12`	`4`	`50929`	`c`	[NAG]B:1301	`9`	`1`	`361`	`95.7`	`2.4`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`32`		C	`12`	`5`	`50550`	`◊`	[NAG]D:1	`5`	`1`	`361`	`87.5`	`3.0`	`0.746`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`33`		A	`11`	`3`	`51207`	`c`	[NAG]A:1305	`8`	`1`	`360`	`87.5`	`2.3`	`0.424`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`34`		A	`11`	`5`	`51207`	`c`	[NAG]A:1301	`6`	`1`	`362`	`87.3`	`2.9`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`35`		B	`6`	`3`	`50929`	`c`	[NAG]B:1303	`8`	`1`	`359`	`85.5`	`3.2`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`36`		B	`9`	`3`	`50929`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`363`	`84.2`	`2.9`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`37`		C	`12`	`4`	`50550`	`c`	[NAG]C:1308	`8`	`1`	`362`	`81.6`	`2.5`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`38`		B	`12`	`4`	`50929`	`c`	[NAG]M:1	`8`	`1`	`363`	`80.8`	`2.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`39`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`365`	`78.2`	`2.1`	`0.125`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`40`		[NAG]F:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`364`	`75.4`	`2.0`	`0.121`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`366`	`72.6`	`1.8`	`0.134`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]E:2	`10`	`1`	`363`	`68.9`	`1.5`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.3`	`1.8`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		B	`10`	`4`	`50929`	`c`	[NAG]B:1307	`7`	`1`	`356`	`74.6`	`2.6`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		A	`9`	`3`	`51207`	`c`	[NAG]A:1306	`8`	`1`	`360`	`74.1`	`2.6`	`0.381`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		[NAG]D:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]D:2	`8`	`1`	`359`	`73.6`	`1.6`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`357`	`73.1`	`2.3`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		C	`9`	`3`	`50550`	`c`	[NAG]C:1305	`8`	`1`	`363`	`71.5`	`2.5`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`361`	`70.7`	`1.8`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		[NAG]N:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`365`	`70.3`	`1.7`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		A	`10`	`4`	`51207`	`◊`	[NAG]E:2	`5`	`1`	`363`	`69.0`	`1.3`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		[NAG]K:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`365`	`68.6`	`1.3`	`0.078`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]P:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]P:2	`9`	`1`	`364`	`67.4`	`1.1`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.0`	`1.2`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		C	`5`	`2`	`50550`	`c`	[NAG]C:1302	`6`	`1`	`357`	`67.8`	`2.4`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		C	`10`	`4`	`50550`	`◊`	[NAG]N:2	`4`	`1`	`365`	`65.8`	`1.1`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		[NAG]G:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`357`	`63.5`	`1.2`	`0.086`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		A	`7`	`3`	`51207`	`c`	[NAG]I:1	`9`	`1`	`362`	`61.9`	`2.0`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		A	`6`	`2`	`51207`	`c`	[NAG]A:1304	`7`	`1`	`362`	`60.4`	`1.8`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		B	`5`	`1`	`50929`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`363`	`59.0`	`1.8`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`59`		A	`7`	`3`	`51207`	`◊`	[NAG]G:2	`6`	`1`	`357`	`58.6`	`1.6`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`60`		C	`6`	`2`	`50550`	`◊`	[NAG]P:2	`4`	`1`	`364`	`47.6`	`1.2`	`0.532`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`61`		B	`6`	`2`	`50929`	`◊`	[NAG]K:2	`4`	`1`	`365`	`47.2`	`1.3`	`0.478`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`62`		C	`7`	`3`	`50550`	`◊`	[NAG]O:2	`4`	`1`	`361`	`43.1`	`1.6`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`63`		B	`7`	`3`	`50929`	`◊`	[NAG]J:2	`3`	`1`	`366`	`34.0`	`1.3`	`0.650`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`64`		C	`3`	`1`	`50550`	`◊`	[NAG]B:1309	`5`	`1`	`364`	`33.1`	`0.7`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`65`		C	`4`	`2`	`50550`	`◊`	[NAG]D:2	`3`	`1`	`359`	`30.3`	`0.6`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`66`		A	`4`	`2`	`51207`	`◊`	[NAG]D:2	`4`	`1`	`359`	`29.9`	`0.5`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`67`		A	`2`	`1`	`51207`	`◊`	[NAG]C:1307	`4`	`1`	`359`	`28.0`	`1.1`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`68`		C	`2`	`1`	`50550`	`◊`	[NAG]B:1311	`3`	`1`	`356`	`20.2`	`0.9`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`69`		A	`1`	`1`	`51207`	`◊`	[NAG]B:1303	`5`	`1`	`359`	`19.9`	`0.0`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`70`		B	`1`	`1`	`50929`	`◊`	[NAG]A:1308	`3`	`1`	`355`	`19.8`	`0.9`	`0.485`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`71`		B	`1`	`1`	`50929`	`◊`	[NAG]C:1302	`2`	`1`	`357`	`19.3`	`-0.1`	`0.159`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`72`		A	`4`	`3`	`51207`	`◊`	[NAG]C:1306	`4`	`1`	`360`	`18.8`	`-0.1`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`73`		B	`1`	`1`	`50929`	`◊`	[NAG]A:1307	`3`	`1`	`362`	`13.7`	`-0.3`	`0.160`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`74`		A	`4`	`2`	`51207`	`◊`	[NAG]F:2	`1`	`1`	`364`	`12.2`	`0.3`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`75`		C	`2`	`1`	`50550`	`◊`	[NAG]A:1301	`3`	`1`	`362`	`11.1`	`-0.2`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`76`		A	`2`	`1`	`51207`	`◊`	[NAG]B:1302	`1`	`1`	`364`	`2.4`	`0.1`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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