PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=685-72-1PH)

Interfaces in PDB 7ndb

EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN IN COMPLEX WITH COVOX- 253H165L FAB

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`593`	`171`	`50981`	`◊`	C	`571`	`164`	`51375`	`5444.6`	`-55.5`	`0.177`	`36`	`8`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`546`	`169`	`50981`	`◊`	B	`577`	`167`	`51951`	`5232.4`	`-55.7`	`0.143`	`38`	`9`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`454`	`139`	`51951`	`◊`	C	`500`	`147`	`51375`	`4386.4`	`-46.3`	`0.201`	`32`	`6`	`0`	`0.000`
4	`4`		H	`183`	`53`	`11551`	`◊`	L	`189`	`54`	`11335`	`1703.9`	`-26.0`	`0.030`	`12`	`2`	`0`	`0.000`
5	`5`		B	`44`	`17`	`51951`	`◊`	H	`52`	`18`	`11551`	`402.1`	`-4.1`	`0.458`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`18`	`9`	`50981`	`c`	[NAG]E:1	`13`	`1`	`364`	`142.0`	`3.0`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`16`	`5`	`51951`	`c`	[NAG]J:1	`12`	`1`	`361`	`140.1`	`3.6`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		C	`15`	`9`	`51375`	`c`	[NAG]M:1	`12`	`1`	`363`	`139.9`	`3.5`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`15`	`5`	`50981`	`c`	[NAG]A:1309	`12`	`1`	`362`	`137.4`	`3.3`	`0.363`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		B	`15`	`7`	`51951`	`c`	[NAG]B:1308	`12`	`1`	`363`	`136.4`	`3.4`	`0.374`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		C	`14`	`5`	`51375`	`c`	[NAG]C:1306	`12`	`1`	`363`	`133.5`	`3.6`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		C	`15`	`5`	`51375`	`c`	[NAG]O:1	`13`	`1`	`361`	`132.5`	`3.5`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		B	`15`	`6`	`51951`	`c`	[NAG]B:1304	`11`	`1`	`363`	`128.5`	`3.5`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		A	`12`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]A:1308	`11`	`1`	`360`	`128.3`	`3.6`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		B	`14`	`6`	`51951`	`c`	[NAG]B:1307	`7`	`1`	`363`	`127.9`	`3.3`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		B	`19`	`6`	`51951`	`c`	[NAG]B:1301	`11`	`1`	`354`	`125.7`	`3.3`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		B	`12`	`4`	`51951`	`c`	[NAG]B:1309	`11`	`1`	`360`	`124.7`	`3.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		C	`13`	`5`	`51375`	`c`	[NAG]C:1305	`8`	`1`	`360`	`124.3`	`3.5`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		B	`14`	`7`	`51951`	`c`	[NAG]B:1310	`9`	`1`	`360`	`124.1`	`3.7`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		A	`13`	`5`	`50981`	`c`	[NAG]A:1307	`7`	`1`	`359`	`123.2`	`3.3`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`21`		A	`12`	`7`	`50981`	`c`	[NAG]A:1303	`8`	`1`	`357`	`122.9`	`3.5`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		B	`14`	`3`	`51951`	`◊`	L	`14`	`4`	`11335`	`122.8`	`-2.4`	`0.223`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`23`		C	`13`	`4`	`51375`	`c`	[NAG]C:1302	`10`	`1`	`363`	`119.7`	`3.6`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		B	`15`	`7`	`51951`	`c`	[NAG]I:1	`10`	`1`	`361`	`114.0`	`3.5`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		H	`12`	`5`	`11551`	`c`	[NAG]P:1	`11`	`1`	`362`	`109.3`	`2.7`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		A	`13`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]A:1304	`10`	`1`	`362`	`109.0`	`3.4`	`0.424`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		C	`13`	`6`	`51375`	`c`	[NAG]N:1	`10`	`1`	`365`	`104.9`	`3.1`	`0.431`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		A	`14`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]A:1302	`9`	`1`	`363`	`103.7`	`2.4`	`0.412`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		C	`11`	`7`	`51375`	`c`	[NAG]C:1308	`11`	`1`	`356`	`101.6`	`2.1`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		H	`19`	`7`	`11551`	`◊`	[FUC]P:3	`6`	`1`	`281`	`100.5`	`2.2`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		C	`20`	`7`	`51375`	`c`	[NAG]C:1303	`10`	`1`	`361`	`94.3`	`2.7`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`32`		C	`11`	`4`	`51375`	`c`	[NAG]C:1301	`7`	`1`	`364`	`92.6`	`3.1`	`0.575`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`33`		A	`8`	`3`	`50981`	`c`	[NAG]F:1	`10`	`1`	`358`	`90.7`	`2.9`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`34`		A	`7`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]D:1	`9`	`1`	`356`	`89.5`	`2.1`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`35`		B	`10`	`3`	`51951`	`c`	[NAG]B:1306	`7`	`1`	`363`	`89.0`	`3.0`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`36`		B	`11`	`4`	`51951`	`c`	[NAG]B:1305	`7`	`1`	`359`	`87.8`	`3.2`	`0.600`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`37`		B	`9`	`3`	`51951`	`c`	[NAG]B:1302	`9`	`1`	`355`	`85.7`	`2.3`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`38`		C	`12`	`5`	`51375`	`c`	[NAG]C:1307	`10`	`1`	`363`	`85.0`	`1.7`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`39`		A	`11`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]A:1305	`8`	`1`	`360`	`84.0`	`2.2`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`40`		A	`11`	`3`	`50981`	`c`	[NAG]A:1306	`9`	`1`	`364`	`83.6`	`2.8`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`41`		B	`7`	`3`	`51951`	`c`	[NAG]B:1303	`7`	`1`	`358`	`83.6`	`3.1`	`0.566`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`42`		A	`7`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]A:1301	`6`	`1`	`359`	`82.8`	`3.2`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`43`		A	`10`	`4`	`50981`	`c`	[NAG]G:1	`8`	`1`	`360`	`82.6`	`2.3`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`44`		B	`10`	`4`	`51951`	`c`	[NAG]K:1	`8`	`1`	`362`	`80.6`	`2.7`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`45`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`363`	`76.7`	`2.2`	`0.114`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`46`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`362`	`76.2`	`1.6`	`0.088`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`47`		C	`9`	`3`	`51375`	`c`	[NAG]C:1304	`9`	`1`	`361`	`76.0`	`2.5`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`48`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]F:2	`10`	`1`	`361`	`74.5`	`2.2`	`0.097`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`49`		A	`9`	`5`	`50981`	`◊`	[NAG]B:1302	`5`	`1`	`355`	`74.2`	`3.0`	`0.670`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`50`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`361`	`74.0`	`2.2`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`356`	`c`	[NAG]D:2	`8`	`1`	`360`	`70.9`	`1.9`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.5`	`2.1`	`0.118`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`52`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]I:2	`9`	`1`	`364`	`72.6`	`1.6`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]E:1	`5`	`1`	`364`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`360`	`66.4`	`1.4`	`0.082`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`69.5`	`1.5`	`0.087`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]J:2	`8`	`1`	`357`	`72.6`	`2.5`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`55`		[NAG]G:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]G:2	`8`	`1`	`356`	`71.5`	`1.9`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		[NAG]P:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]P:2	`9`	`1`	`361`	`70.8`	`1.5`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`57`		[NAG]O:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]O:2	`10`	`1`	`363`	`64.5`	`1.0`	`0.052`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`58`		A	`10`	`4`	`50981`	`◊`	[NAG]E:2	`6`	`1`	`360`	`64.2`	`1.1`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		C	`9`	`4`	`51375`	`◊`	[NAG]D:1	`8`	`1`	`356`	`63.2`	`2.3`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`60`		[NAG]P:1	`4`	`1`	`362`	`c`	[FUC]P:3	`5`	`1`	`281`	`53.6`	`2.3`	`0.297`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`61`		A	`10`	`3`	`50981`	`◊`	[NAG]F:2	`2`	`1`	`361`	`43.5`	`1.3`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`62`		B	`7`	`3`	`51951`	`◊`	[NAG]I:2	`3`	`1`	`364`	`41.5`	`1.5`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`63`		B	`7`	`3`	`51951`	`◊`	[NAG]P:2	`2`	`1`	`361`	`40.2`	`1.2`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		C	`4`	`2`	`51375`	`◊`	[NAG]M:2	`5`	`1`	`361`	`35.9`	`0.5`	`0.242`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		C	`4`	`1`	`51375`	`◊`	[NAG]O:2	`5`	`1`	`363`	`34.4`	`1.1`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		C	`3`	`1`	`51375`	`◊`	[NAG]B:1307	`5`	`1`	`363`	`34.2`	`0.5`	`0.267`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		B	`3`	`1`	`51951`	`◊`	[NAG]J:2	`4`	`1`	`357`	`31.1`	`0.5`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		C	`6`	`3`	`51375`	`◊`	[NAG]N:2	`3`	`1`	`362`	`30.7`	`1.1`	`0.576`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		A	`4`	`2`	`50981`	`◊`	[NAG]D:2	`3`	`1`	`360`	`27.1`	`0.5`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`70`		[NAG]P:2	`4`	`1`	`361`	`◊`	[FUC]P:3	`2`	`1`	`281`	`22.7`	`1.3`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`71`		H	`2`	`1`	`11551`	`◊`	[NAG]P:2	`4`	`1`	`361`	`21.1`	`0.4`	`0.339`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
70	`72`		A	`1`	`1`	`50981`	`◊`	[NAG]C:1306	`3`	`1`	`363`	`21.1`	`0.9`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`73`		B	`1`	`1`	`51951`	`◊`	[NAG]A:1307	`3`	`1`	`359`	`20.1`	`-0.3`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`74`		C	`2`	`1`	`51375`	`◊`	[NAG]B:1309	`2`	`1`	`360`	`18.5`	`0.8`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`75`		C	`2`	`1`	`51375`	`◊`	[NAG]A:1301	`2`	`1`	`359`	`16.7`	`-0.1`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`76`		A	`2`	`1`	`50981`	`◊`	[NAG]C:1305	`4`	`1`	`360`	`16.6`	`-0.1`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`77`		B	`1`	`1`	`51951`	`◊`	[NAG]A:1308	`2`	`1`	`360`	`15.7`	`0.7`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`78`		C	`1`	`1`	`51375`	`◊`	[NAG]B:1305	`1`	`1`	`359`	`5.9`	`0.1`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`79`		L	`1`	`1`	`11335`	`◊`	[FUC]P:3	`1`	`1`	`281`	`3.2`	`-0.1`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`80`		C	`1`	`1`	`51375`	`◊`	[NAG]D:2	`1`	`1`	`360`	`2.3`	`0.0`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`81`		A	`1`	`1`	`50981`	`◊`	[NAG]B:1303	`2`	`1`	`358`	`0.8`	`-0.0`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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