data_8Q1
#
_chem_comp.id 8Q1
_chem_comp.name
"S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C23 H45 N2 O8 P S"
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_chem_comp.pdbx_synonyms "S-dodecanoyl-4'-phosphopantetheine"
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2017-02-28
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_chem_comp.formula_weight 540.651
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_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5USR
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
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_chem_comp_atom.type_symbol
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_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
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_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
8Q1 O4 O1 O 0 1 N Y N N N N -36.895 -2.617 -25.605 4.079 -0.495 0.416 O4 8Q1 1
8Q1 C16 C1 C 0 1 N N N N N N -47.448 5.919 -27.839 17.687 1.547 0.920 C16 8Q1 2
8Q1 O3 O2 O 0 1 N N N N N N -30.241 -6.965 -36.203 -9.952 2.445 -1.479 O3 8Q1 3
8Q1 C15 C2 C 0 1 N N N N N N -46.675 4.825 -27.134 16.282 1.533 1.526 C15 8Q1 4
8Q1 C14 C3 C 0 1 N N N N N N -45.280 4.676 -27.728 15.275 1.077 0.469 C14 8Q1 5
8Q1 C13 C4 C 0 1 N N N N N N -44.454 3.654 -26.954 13.870 1.063 1.074 C13 8Q1 6
8Q1 O2 O3 O 0 1 N N N N N N -28.303 -5.653 -35.436 -9.060 4.349 -0.083 O2 8Q1 7
8Q1 C12 C5 C 0 1 N N N N N N -42.986 3.750 -27.348 12.863 0.606 0.017 C12 8Q1 8
8Q1 C11 C6 C 0 1 N N N N N N -42.092 2.951 -26.407 11.458 0.592 0.623 C11 8Q1 9
8Q1 C10 C7 C 0 1 N N N N N N -42.033 1.478 -26.796 10.451 0.136 -0.435 C10 8Q1 10
8Q1 C9 C8 C 0 1 N N N N N N -40.878 0.793 -26.074 9.047 0.122 0.171 C9 8Q1 11
8Q1 C8 C9 C 0 1 N N N N N N -40.671 -0.638 -26.554 8.040 -0.335 -0.887 C8 8Q1 12
8Q1 C7 C10 C 0 1 N N N N N N -39.258 -1.115 -26.235 6.635 -0.349 -0.281 C7 8Q1 13
8Q1 C6 C11 C 0 1 N N N N N N -39.198 -2.637 -26.178 5.628 -0.805 -1.339 C6 8Q1 14
8Q1 C1 C12 C 0 1 N N N N N N -37.769 -3.109 -26.299 4.244 -0.819 -0.742 C1 8Q1 15
8Q1 C28 C13 C 0 1 N N N N N N -29.795 -5.401 -32.696 -8.392 0.438 0.339 C28 8Q1 16
8Q1 C29 C14 C 0 1 N N N N N N -29.780 -6.159 -31.376 -8.194 -0.246 1.693 C29 8Q1 17
8Q1 C30 C15 C 0 1 N N N N N N -28.783 -7.305 -31.446 -6.948 0.322 2.375 C30 8Q1 18
8Q1 C31 C16 C 0 1 N N N N N N -29.382 -5.192 -30.272 -9.418 0.007 2.576 C31 8Q1 19
8Q1 C32 C17 C 0 1 N N R N N N -31.182 -6.709 -31.104 -8.019 -1.752 1.483 C32 8Q1 20
8Q1 C34 C18 C 0 1 N N N N N N -31.179 -7.796 -30.062 -6.899 -1.995 0.505 C34 8Q1 21
8Q1 C37 C19 C 0 1 N N N N N N -31.545 -8.215 -27.691 -4.551 -1.859 -0.130 C37 8Q1 22
8Q1 C38 C20 C 0 1 N N N N N N -32.057 -7.329 -26.562 -3.217 -1.480 0.516 C38 8Q1 23
8Q1 C39 C21 C 0 1 N N N N N N -33.139 -6.408 -27.075 -2.109 -1.628 -0.495 C39 8Q1 24
8Q1 C42 C22 C 0 1 N N N N N N -35.452 -6.133 -27.727 0.240 -1.492 -1.130 C42 8Q1 25
8Q1 C43 C23 C 0 1 N N N N N N -36.292 -5.467 -26.643 1.574 -1.113 -0.484 C43 8Q1 26
8Q1 N36 N1 N 0 1 N N N N N N -31.020 -7.430 -28.792 -5.628 -1.714 0.852 N36 8Q1 27
8Q1 N41 N2 N 0 1 N N N N N N -34.365 -6.915 -27.171 -0.837 -1.347 -0.147 N41 8Q1 28
8Q1 O27 O4 O 0 1 N N N N N N -30.086 -6.290 -33.772 -8.556 1.844 0.535 O27 8Q1 29
8Q1 O33 O5 O 0 1 N N N N N N -31.725 -7.231 -32.323 -9.231 -2.305 0.967 O33 8Q1 30
8Q1 O35 O6 O 0 1 N N N N N N -31.323 -8.963 -30.392 -7.142 -2.444 -0.596 O35 8Q1 31
8Q1 O40 O7 O 0 1 N N N N N N -32.877 -5.257 -27.381 -2.361 -2.001 -1.621 O40 8Q1 32
8Q1 P24 P1 P 0 1 N N N N N N -29.793 -5.846 -35.293 -8.786 2.878 -0.677 P24 8Q1 33
8Q1 S44 S1 S 0 1 N N N N N N -37.384 -4.306 -27.391 2.905 -1.291 -1.698 S44 8Q1 34
8Q1 O1 O8 O 0 1 N Y N N N N -29.703 -5.305 -36.436 -7.475 2.911 -1.611 O1 8Q1 35
8Q1 H1 H1 H 0 1 N N N N N N -48.450 6.007 -27.393 18.404 1.872 1.674 H1 8Q1 36
8Q1 H2 H2 H 0 1 N N N N N N -46.913 6.874 -27.730 17.946 0.544 0.581 H2 8Q1 37
8Q1 H3 H3 H 0 1 N N N N N N -47.543 5.671 -28.907 17.711 2.235 0.075 H3 8Q1 38
8Q1 H4 H4 H 0 1 N N N N N N -46.587 5.077 -26.067 16.258 0.846 2.372 H4 8Q1 39
8Q1 H5 H5 H 0 1 N N N N N N -47.216 3.874 -27.243 16.023 2.536 1.866 H5 8Q1 40
8Q1 H6 H6 H 0 1 N N N N N N -45.369 4.347 -28.774 15.299 1.764 -0.377 H6 8Q1 41
8Q1 H7 H7 H 0 1 N N N N N N -44.770 5.650 -27.693 15.534 0.074 0.129 H7 8Q1 42
8Q1 H8 H8 H 0 1 N N N N N N -44.553 3.849 -25.876 13.846 0.375 1.920 H8 8Q1 43
8Q1 H9 H9 H 0 1 N N N N N N -44.824 2.643 -27.179 13.611 2.066 1.414 H9 8Q1 44
8Q1 H10 H10 H 0 1 N N N N N N -27.962 -6.275 -36.067 -9.208 5.025 -0.759 H10 8Q1 45
8Q1 H11 H11 H 0 1 N N N N N N -42.866 3.360 -28.370 12.888 1.294 -0.829 H11 8Q1 46
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8Q1 H20 H20 H 0 1 N N N N N N -41.396 -1.296 -26.052 8.299 -1.338 -1.226 H20 8Q1 55
8Q1 H21 H21 H 0 1 N N N N N N -38.572 -0.756 -27.016 6.610 -1.036 0.564 H21 8Q1 56
8Q1 H22 H22 H 0 1 N N N N N N -38.951 -0.706 -25.261 6.376 0.654 0.058 H22 8Q1 57
8Q1 H23 H23 H 0 1 N N N N N N -39.790 -3.055 -27.006 5.652 -0.118 -2.184 H23 8Q1 58
8Q1 H24 H24 H 0 1 N N N N N N -39.614 -2.981 -25.220 5.887 -1.808 -1.678 H24 8Q1 59
8Q1 H25 H25 H 0 1 N N N N N N -28.810 -4.941 -32.862 -7.520 0.258 -0.290 H25 8Q1 60
8Q1 H26 H26 H 0 1 N N N N N N -30.564 -4.616 -32.655 -9.280 0.034 -0.146 H26 8Q1 61
8Q1 H27 H27 H 0 1 N N N N N N -28.779 -7.847 -30.489 -7.117 1.369 2.626 H27 8Q1 62
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8Q1 H30 H30 H 0 1 N N N N N N -29.365 -5.722 -29.308 -10.292 -0.469 2.130 H30 8Q1 65
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8Q1 H33 H33 H 0 1 N N N N N N -31.812 -5.882 -30.745 -7.780 -2.226 2.435 H33 8Q1 68
8Q1 H34 H34 H 0 1 N N N N N N -32.374 -8.837 -28.060 -4.743 -1.202 -0.979 H34 8Q1 69
8Q1 H35 H35 H 0 1 N N N N N N -30.746 -8.863 -27.302 -4.508 -2.892 -0.473 H35 8Q1 70
8Q1 H36 H36 H 0 1 N N N N N N -32.467 -7.961 -25.761 -3.260 -0.446 0.859 H36 8Q1 71
8Q1 H37 H37 H 0 1 N N N N N N -31.225 -6.728 -26.165 -3.024 -2.136 1.365 H37 8Q1 72
8Q1 H38 H38 H 0 1 N N N N N N -35.031 -5.353 -28.379 0.048 -0.836 -1.979 H38 8Q1 73
8Q1 H39 H39 H 0 1 N N N N N N -36.099 -6.796 -28.320 0.283 -2.526 -1.472 H39 8Q1 74
8Q1 H40 H40 H 0 1 N N N N N N -36.876 -6.231 -26.109 1.531 -0.079 -0.141 H40 8Q1 75
8Q1 H41 H41 H 0 1 N N N N N N -35.632 -4.947 -25.933 1.766 -1.770 0.365 H41 8Q1 76
8Q1 H42 H42 H 0 1 N N N N N N -30.522 -6.586 -28.590 -5.426 -1.416 1.753 H42 8Q1 77
8Q1 H43 H43 H 0 1 N N N N N N -34.539 -7.848 -26.856 -0.635 -1.050 0.754 H43 8Q1 78
8Q1 H44 H44 H 0 1 N N N N N N -31.860 -8.167 -32.235 -9.506 -1.928 0.119 H44 8Q1 79
8Q1 H45 H45 H 0 1 N N N N N N -29.965 -5.928 -37.103 -6.671 3.187 -1.150 H45 8Q1 80
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
8Q1 O3 P24 DOUB N N 1
8Q1 O2 P24 SING N N 2
8Q1 P24 O27 SING N N 3
8Q1 O27 C28 SING N N 4
8Q1 C28 C29 SING N N 5
8Q1 O33 C32 SING N N 6
8Q1 C30 C29 SING N N 7
8Q1 C29 C32 SING N N 8
8Q1 C29 C31 SING N N 9
8Q1 C32 C34 SING N N 10
8Q1 O35 C34 DOUB N N 11
8Q1 C34 N36 SING N N 12
8Q1 N36 C37 SING N N 13
8Q1 C16 C15 SING N N 14
8Q1 C14 C15 SING N N 15
8Q1 C14 C13 SING N N 16
8Q1 C42 N41 SING N N 17
8Q1 C42 C43 SING N N 18
8Q1 C37 C38 SING N N 19
8Q1 S44 C43 SING N N 20
8Q1 S44 C1 SING N N 21
8Q1 O40 C39 DOUB N N 22
8Q1 C12 C13 SING N N 23
8Q1 C12 C11 SING N N 24
8Q1 N41 C39 SING N N 25
8Q1 C39 C38 SING N N 26
8Q1 C10 C11 SING N N 27
8Q1 C10 C9 SING N N 28
8Q1 C8 C7 SING N N 29
8Q1 C8 C9 SING N N 30
8Q1 C1 C6 SING N N 31
8Q1 C1 O4 DOUB N N 32
8Q1 C7 C6 SING N N 33
8Q1 P24 O1 SING N N 34
8Q1 C16 H1 SING N N 35
8Q1 C16 H2 SING N N 36
8Q1 C16 H3 SING N N 37
8Q1 C15 H4 SING N N 38
8Q1 C15 H5 SING N N 39
8Q1 C14 H6 SING N N 40
8Q1 C14 H7 SING N N 41
8Q1 C13 H8 SING N N 42
8Q1 C13 H9 SING N N 43
8Q1 O2 H10 SING N N 44
8Q1 C12 H11 SING N N 45
8Q1 C12 H12 SING N N 46
8Q1 C11 H13 SING N N 47
8Q1 C11 H14 SING N N 48
8Q1 C10 H15 SING N N 49
8Q1 C10 H16 SING N N 50
8Q1 C9 H17 SING N N 51
8Q1 C9 H18 SING N N 52
8Q1 C8 H19 SING N N 53
8Q1 C8 H20 SING N N 54
8Q1 C7 H21 SING N N 55
8Q1 C7 H22 SING N N 56
8Q1 C6 H23 SING N N 57
8Q1 C6 H24 SING N N 58
8Q1 C28 H25 SING N N 59
8Q1 C28 H26 SING N N 60
8Q1 C30 H27 SING N N 61
8Q1 C30 H28 SING N N 62
8Q1 C30 H29 SING N N 63
8Q1 C31 H30 SING N N 64
8Q1 C31 H31 SING N N 65
8Q1 C31 H32 SING N N 66
8Q1 C32 H33 SING N N 67
8Q1 C37 H34 SING N N 68
8Q1 C37 H35 SING N N 69
8Q1 C38 H36 SING N N 70
8Q1 C38 H37 SING N N 71
8Q1 C42 H38 SING N N 72
8Q1 C42 H39 SING N N 73
8Q1 C43 H40 SING N N 74
8Q1 C43 H41 SING N N 75
8Q1 N36 H42 SING N N 76
8Q1 N41 H43 SING N N 77
8Q1 O33 H44 SING N N 78
8Q1 O1 H45 SING N N 79
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
8Q1 SMILES ACDLabs 12.01 O=C(CCCCCCCCCCC)SCCNC(CCNC(C(C(COP(=O)(O)O)(C)C)O)=O)=O
8Q1 InChI InChI 1.03 InChI=1S/C23H45N2O8PS/c1-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-20(27)35-17-16-24-19(26)14-15-25-22(29)21(28)23(2,3)18-33-34(30,31)32/h21,28H,4-18H2,1-3H3,(H,24,26)(H,25,29)(H2,30,31,32)/t21-/m0/s1
8Q1 InChIKey InChI 1.03 MVHUOSAYFQKAMT-NRFANRHFSA-N
8Q1 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 CCCCCCCCCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)CO[P](O)(O)=O
8Q1 SMILES CACTVS 3.385 CCCCCCCCCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[CH](O)C(C)(C)CO[P](O)(O)=O
8Q1 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 CCCCCCCCCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@@H](C(C)(C)COP(=O)(O)O)O
8Q1 SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 CCCCCCCCCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)C(C(C)(C)COP(=O)(O)O)O
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
8Q1 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate"
8Q1 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] dodecanethioate"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
8Q1 'Create component' 2017-02-28 RCSB
8Q1 'Other modification' 2017-02-28 RCSB
8Q1 'Initial release' 2017-06-21 RCSB
8Q1 'Modify synonyms' 2020-06-05 PDBE
#
_pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal 1
_pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id 8Q1
_pdbx_chem_comp_synonyms.name "S-dodecanoyl-4'-phosphopantetheine"
_pdbx_chem_comp_synonyms.provenance ?
_pdbx_chem_comp_synonyms.type ?
#
_pdbe_chem_comp_synonyms.comp_id 8Q1
_pdbe_chem_comp_synonyms.name "S-dodecanoyl-4'-phosphopantetheine"
_pdbe_chem_comp_synonyms.provenance wwPDB
_pdbe_chem_comp_synonyms.type ?
#
loop_
_software.name
_software.version
_software.description
rdkit 2023.03.3 'Core functionality.'
pdbeccdutils 0.8.4 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.'
#
loop_
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.element
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal
8Q1 O4 O 23.291 1.917 1
8Q1 C16 C 37.580 -0.333 2
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8Q1 C15 C 36.281 0.417 4
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8Q1 C13 C 33.683 0.417 6
8Q1 O2 O 4.354 0.216 7
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8Q1 C11 C 31.085 0.417 9
8Q1 C10 C 29.786 -0.333 10
8Q1 C9 C 28.487 0.417 11
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8Q1 C6 C 24.590 -0.333 14
8Q1 C1 C 23.291 0.417 15
8Q1 C28 C 7.702 -1.083 16
8Q1 C29 C 9.002 -0.333 17
8Q1 C30 C 8.252 0.966 18
8Q1 C31 C 9.752 -1.632 19
8Q1 C32 C 10.301 0.417 20
8Q1 C34 C 11.600 -0.333 21
8Q1 C37 C 14.198 -0.333 22
8Q1 C38 C 15.497 0.417 23
8Q1 C39 C 16.796 -0.333 24
8Q1 C42 C 19.394 -0.333 25
8Q1 C43 C 20.693 0.417 26
8Q1 N36 N 12.899 0.417 27
8Q1 N41 N 18.095 0.417 28
8Q1 O27 O 6.404 -0.333 29
8Q1 O33 O 10.301 1.917 30
8Q1 O35 O 11.600 -1.833 31
8Q1 O40 O 16.796 -1.833 32
8Q1 P24 P 5.104 -1.083 33
8Q1 S44 S 21.992 -0.333 34
8Q1 O1 O 5.854 -2.382 35
#
loop_
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1
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_pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal
8Q1 O3 P24 DOUBLE NONE 1
8Q1 O2 P24 SINGLE NONE 2
8Q1 P24 O27 SINGLE NONE 3
8Q1 O27 C28 SINGLE NONE 4
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8Q1 C32 O33 SINGLE BEGINWEDGE 6
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8Q1 O35 C34 DOUBLE NONE 11
8Q1 C34 N36 SINGLE NONE 12
8Q1 N36 C37 SINGLE NONE 13
8Q1 C16 C15 SINGLE NONE 14
8Q1 C14 C15 SINGLE NONE 15
8Q1 C14 C13 SINGLE NONE 16
8Q1 C42 N41 SINGLE NONE 17
8Q1 C42 C43 SINGLE NONE 18
8Q1 C37 C38 SINGLE NONE 19
8Q1 S44 C43 SINGLE NONE 20
8Q1 S44 C1 SINGLE NONE 21
8Q1 O40 C39 DOUBLE NONE 22
8Q1 C12 C13 SINGLE NONE 23
8Q1 C12 C11 SINGLE NONE 24
8Q1 N41 C39 SINGLE NONE 25
8Q1 C39 C38 SINGLE NONE 26
8Q1 C10 C11 SINGLE NONE 27
8Q1 C10 C9 SINGLE NONE 28
8Q1 C8 C7 SINGLE NONE 29
8Q1 C8 C9 SINGLE NONE 30
8Q1 C1 C6 SINGLE NONE 31
8Q1 C1 O4 DOUBLE NONE 32
8Q1 C7 C6 SINGLE NONE 33
8Q1 P24 O1 SINGLE NONE 34
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name
_pdbe_chem_comp_substructure.id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys
8Q1 amide F1 fragment CC(N)=O InChI=1S/C2H5NO/c1-2(3)4/h1H3,(H2,3,4) DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N
8Q1 phosphate F2 fragment O=P(O)(O)O InChI=1S/H3O4P/c1-5(2,3)4/h(H3,1,2,3,4) NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal
8Q1 N36 F1 1
8Q1 C34 F1 1
8Q1 O35 F1 1
8Q1 C32 F1 1
8Q1 N41 F1 2
8Q1 C39 F1 2
8Q1 O40 F1 2
8Q1 C38 F1 2
8Q1 O2 F2 1
8Q1 P24 F2 1
8Q1 O3 F2 1
8Q1 O27 F2 1
8Q1 O1 F2 1
#
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.comp_id 8Q1
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#
loop_
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_pdbe_chem_comp_external_mappings.source
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_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource_id
8Q1 UniChem PDBe 8Q1
8Q1 UniChem ChEBI 132316
8Q1 UniChem ZINC ZINC000535385355
8Q1 UniChem PubChem 119058169
8Q1 UniChem MetaboLights MTBLC132316
#
loop_
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.comp_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.atom_id
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_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_method
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_ordinal
8Q1 O4 3.376 -3.812 -1.880 ETKDGv3 1
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8Q1 O2 -6.500 3.536 2.347 ETKDGv3 7
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#