data_A1H56
#
_chem_comp.id A1H56
_chem_comp.name
"~{N}-[3-[3-[[5-[(2-hydroxyethylamino)methyl]pyridin-2-yl]carbonylamino]-2-methyl-phenyl]-2-methyl-phenyl]-5-[[3-(methylsulfonylamino)propylamino]methyl]pyridine-2-carboxamide"
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_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C34 H41 N7 O5 S"
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_chem_comp.one_letter_code ?
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_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 9EO0
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_chem_comp.pdbx_processing_site PDBE
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
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_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
A1H56 C15 C1 C 0 1 N N N N N N 54.950 -12.644 52.361 6.747 -0.739 2.009 C15 A1H56 1
A1H56 C16 C2 C 0 1 N N N N N N 55.409 -15.023 51.759 8.474 0.664 1.053 C16 A1H56 2
A1H56 C17 C3 C 0 1 N N N N N N 55.651 -14.805 50.271 9.019 1.235 -0.257 C17 A1H56 3
A1H56 C18 C4 C 0 1 N N N N N N 55.609 -16.024 49.358 10.243 2.105 0.037 C18 A1H56 4
A1H56 C19 C5 C 0 1 N N N N N N 54.753 -19.816 50.969 13.317 3.226 -0.386 C19 A1H56 5
A1H56 C20 C6 C 0 1 Y N N N N N 55.159 -11.284 50.221 5.697 -2.938 1.405 C20 A1H56 6
A1H56 C21 C7 C 0 1 Y N N N N N 55.837 -10.377 49.426 4.565 -3.684 1.114 C21 A1H56 7
A1H56 C22 C8 C 0 1 Y N N N N N 59.331 -6.319 48.261 -0.336 -5.281 1.129 C22 A1H56 8
A1H56 C23 C9 C 0 1 Y N N N N N 60.225 -5.404 47.778 -1.483 -6.032 0.961 C23 A1H56 9
A1H56 C24 C10 C 0 1 Y N N N N N 61.503 -5.341 48.298 -2.563 -5.507 0.280 C24 A1H56 10
A1H56 C25 C11 C 0 1 Y N N N N N 63.807 -4.949 50.634 -4.401 -2.615 -0.410 C25 A1H56 11
A1H56 C26 C12 C 0 1 N N N N N N 62.901 -3.879 51.182 -4.025 -2.062 0.941 C26 A1H56 12
A1H56 C27 C13 C 0 1 Y N N N N N 66.860 -1.954 52.596 -7.630 0.954 -0.755 C27 A1H56 13
A1H56 C28 C14 C 0 1 Y N N N N N 68.040 -0.164 53.421 -8.228 2.162 1.117 C28 A1H56 14
A1H56 O1 O1 O 0 1 N N N N N N 67.785 -3.419 50.947 -6.927 -0.382 -2.542 O1 A1H56 15
A1H56 C1 C15 C 0 1 N N N N N N 66.841 -3.175 51.700 -6.908 -0.200 -1.340 C1 A1H56 16
A1H56 N1 N1 N 0 1 N N N N N N 65.712 -3.925 51.778 -6.230 -1.047 -0.541 N1 A1H56 17
A1H56 C2 C16 C 0 1 Y N N N N N 65.184 -4.913 50.912 -5.485 -2.090 -1.099 C2 A1H56 18
A1H56 C3 C17 C 0 1 Y N N N N N 66.031 -5.903 50.431 -5.829 -2.601 -2.344 C3 A1H56 19
A1H56 C4 C18 C 0 1 Y N N N N N 65.548 -6.903 49.621 -5.095 -3.633 -2.899 C4 A1H56 20
A1H56 C5 C19 C 0 1 Y N N N N N 64.207 -6.956 49.285 -4.015 -4.160 -2.220 C5 A1H56 21
A1H56 C6 C20 C 0 1 Y N N N N N 63.312 -6.026 49.805 -3.659 -3.650 -0.972 C6 A1H56 22
A1H56 C7 C21 C 0 1 Y N N N N N 61.894 -6.169 49.350 -2.499 -4.216 -0.240 C7 A1H56 23
A1H56 C8 C22 C 0 1 Y N N N N N 60.974 -7.134 49.859 -1.343 -3.458 -0.072 C8 A1H56 24
A1H56 C9 C23 C 0 1 N N N N N N 61.363 -8.067 50.972 -1.266 -2.062 -0.633 C9 A1H56 25
A1H56 C10 C24 C 0 1 Y N N N N N 59.680 -7.181 49.289 -0.262 -3.993 0.613 C10 A1H56 26
A1H56 N2 N2 N 0 1 N N N N N N 58.667 -8.086 49.762 0.899 -3.234 0.790 N2 A1H56 27
A1H56 C11 C25 C 0 1 N N N N N N 57.801 -8.870 49.080 2.104 -3.837 0.798 C11 A1H56 28
A1H56 C12 C26 C 0 1 Y N N N N N 57.012 -9.842 49.918 3.323 -3.054 1.107 C12 A1H56 29
A1H56 N3 N3 N 0 1 Y N N N N N 57.502 -10.172 51.124 3.221 -1.758 1.377 N3 A1H56 30
A1H56 C13 C27 C 0 1 Y N N N N N 56.825 -11.053 51.872 4.278 -1.027 1.656 C13 A1H56 31
A1H56 C14 C28 C 0 1 Y N N N N N 55.650 -11.636 51.478 5.545 -1.588 1.680 C14 A1H56 32
A1H56 N4 N4 N 0 1 N N N N N N 55.800 -13.843 52.547 7.299 -0.172 0.771 N4 A1H56 33
A1H56 N5 N5 N 0 1 N N N N N N 55.578 -17.306 50.078 10.765 2.653 -1.218 N5 A1H56 34
A1H56 S1 S1 S 0 1 N N N N N N 54.398 -18.401 49.885 11.841 3.911 -1.187 S1 A1H56 35
A1H56 O2 O2 O 0 1 N N N N N N 53.200 -17.783 50.350 11.224 4.880 -0.351 O2 A1H56 36
A1H56 O3 O3 O 0 1 N N N N N N 54.455 -18.848 48.528 12.100 4.185 -2.557 O3 A1H56 37
A1H56 O4 O4 O 0 1 N N N N N N 57.704 -8.889 47.865 2.191 -5.024 0.551 O4 A1H56 38
A1H56 N6 N6 N 0 1 Y N N N N N 67.985 -1.230 52.609 -7.605 1.148 0.558 N6 A1H56 39
A1H56 C29 C29 C 0 1 Y N N N N N 67.018 0.234 54.247 -8.938 3.072 0.349 C29 A1H56 40
A1H56 C30 C30 C 0 1 N N N N N N 67.124 1.499 55.064 -9.647 4.230 1.003 C30 A1H56 41
A1H56 N7 N7 N 0 1 N N N N N N 67.143 2.669 54.128 -8.737 5.381 1.080 N7 A1H56 42
A1H56 C31 C31 C 0 1 N N N N N N 66.430 3.860 54.602 -9.395 6.531 1.713 C31 A1H56 43
A1H56 C32 C32 C 0 1 N N N N N N 67.289 4.712 55.543 -8.419 7.707 1.775 C32 A1H56 44
A1H56 O5 O5 O 0 1 N N N N N N 66.595 5.166 56.699 -8.104 8.135 0.448 O5 A1H56 45
A1H56 C33 C33 C 0 1 Y N N N N N 65.858 -0.521 54.214 -8.990 2.907 -1.026 C33 A1H56 46
A1H56 C34 C34 C 0 1 Y N N N N N 65.771 -1.619 53.385 -8.324 1.829 -1.588 C34 A1H56 47
A1H56 H10 H1 H 0 1 N N N N N N 54.746 -12.188 53.341 6.449 0.068 2.677 H10 A1H56 48
A1H56 H11 H2 H 0 1 N N N N N N 54.001 -12.941 51.891 7.504 -1.354 2.495 H11 A1H56 49
A1H56 H14 H3 H 0 1 N N N N N N 54.340 -15.223 51.922 9.243 0.058 1.533 H14 A1H56 50
A1H56 H13 H4 H 0 1 N N N N N N 55.999 -15.888 52.094 8.188 1.481 1.715 H13 A1H56 51
A1H56 H16 H5 H 0 1 N N N N N N 56.646 -14.349 50.164 9.305 0.418 -0.919 H16 A1H56 52
A1H56 H15 H6 H 0 1 N N N N N N 54.885 -14.101 49.914 8.250 1.840 -0.737 H15 A1H56 53
A1H56 H18 H7 H 0 1 N N N N N N 56.503 -16.008 48.717 9.958 2.923 0.699 H18 A1H56 54
A1H56 H17 H8 H 0 1 N N N N N N 54.707 -15.957 48.731 11.012 1.500 0.517 H17 A1H56 55
A1H56 H21 H9 H 0 1 N N N N N N 54.714 -19.493 52.020 13.691 2.385 -0.970 H21 A1H56 56
A1H56 H22 H10 H 0 1 N N N N N N 54.004 -20.604 50.800 14.087 3.995 -0.322 H22 A1H56 57
A1H56 H20 H11 H 0 1 N N N N N N 55.756 -20.208 50.743 13.061 2.885 0.618 H20 A1H56 58
A1H56 H23 H12 H 0 1 N N N N N N 54.240 -11.724 49.864 6.673 -3.399 1.422 H23 A1H56 59
A1H56 H24 H13 H 0 1 N N N N N N 55.460 -10.097 48.453 4.646 -4.738 0.895 H24 A1H56 60
A1H56 H25 H14 H 0 1 N N N N N N 58.340 -6.371 47.836 0.505 -5.695 1.666 H25 A1H56 61
A1H56 H26 H15 H 0 1 N N N N N N 59.931 -4.729 46.988 -1.536 -7.033 1.364 H26 A1H56 62
A1H56 H27 H16 H 0 1 N N N N N N 62.211 -4.639 47.883 -3.459 -6.097 0.151 H27 A1H56 63
A1H56 H5 H17 H 0 1 N N N N N N 62.518 -4.190 52.165 -4.620 -2.551 1.712 H5 A1H56 64
A1H56 H6 H18 H 0 1 N N N N N N 63.465 -2.940 51.288 -2.967 -2.247 1.127 H6 A1H56 65
A1H56 H7 H19 H 0 1 N N N N N N 62.058 -3.724 50.493 -4.216 -0.989 0.960 H7 A1H56 66
A1H56 H31 H20 H 0 1 N N N N N N 68.948 0.420 53.425 -8.186 2.288 2.188 H31 A1H56 67
A1H56 H1 H21 H 0 1 N N N N N N 65.155 -3.749 52.590 -6.259 -0.933 0.422 H1 A1H56 68
A1H56 H2 H22 H 0 1 N N N N N N 67.078 -5.887 50.696 -6.673 -2.192 -2.880 H2 A1H56 69
A1H56 H3 H23 H 0 1 N N N N N N 66.223 -7.656 49.242 -5.367 -4.027 -3.867 H3 A1H56 70
A1H56 H4 H24 H 0 1 N N N N N N 63.852 -7.725 48.614 -3.444 -4.966 -2.656 H4 A1H56 71
A1H56 H12 H25 H 0 1 N N N N N N 61.793 -8.986 50.547 -1.536 -1.344 0.142 H12 A1H56 72
A1H56 H19 H26 H 0 1 N N N N N N 62.108 -7.578 51.617 -0.250 -1.863 -0.974 H19 A1H56 73
A1H56 H28 H27 H 0 1 N N N N N N 60.473 -8.320 51.566 -1.956 -1.969 -1.472 H28 A1H56 74
A1H56 H8 H28 H 0 1 N N N N N N 58.590 -8.145 50.757 0.837 -2.273 0.907 H8 A1H56 75
A1H56 H9 H29 H 0 1 N N N N N N 57.228 -11.318 52.838 4.157 0.025 1.869 H9 A1H56 76
A1H56 H29 H30 H 0 1 N N N N N N 55.771 -14.095 53.514 6.597 0.350 0.268 H29 A1H56 77
A1H56 H34 H32 H 0 1 N N N N N N 56.429 -17.775 49.842 10.481 2.279 -2.066 H34 A1H56 78
A1H56 H33 H33 H 0 1 N N N N N N 68.051 1.482 55.656 -10.524 4.499 0.415 H33 A1H56 79
A1H56 H32 H34 H 0 1 N N N N N N 66.259 1.578 55.739 -9.957 3.945 2.009 H32 A1H56 80
A1H56 H39 H35 H 0 1 N N N N N N 66.726 2.382 53.265 -8.384 5.624 0.166 H39 A1H56 81
A1H56 H35 H37 H 0 1 N N N N N N 66.144 4.471 53.733 -10.271 6.816 1.130 H35 A1H56 82
A1H56 H36 H38 H 0 1 N N N N N N 65.525 3.541 55.140 -9.704 6.262 2.724 H36 A1H56 83
A1H56 H37 H39 H 0 1 N N N N N N 68.149 4.109 55.869 -8.876 8.531 2.323 H37 A1H56 84
A1H56 H38 H40 H 0 1 N N N N N N 67.647 5.590 54.986 -7.506 7.396 2.282 H38 A1H56 85
A1H56 H43 H41 H 0 1 N N N N N N 67.181 5.685 57.237 -7.489 8.880 0.410 H43 A1H56 86
A1H56 H40 H42 H 0 1 N N N N N N 65.020 -0.249 54.839 -9.536 3.602 -1.646 H40 A1H56 87
A1H56 H41 H43 H 0 1 N N N N N N 64.867 -2.210 53.351 -8.342 1.670 -2.656 H41 A1H56 88
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
A1H56 C23 C22 DOUB Y N 1
A1H56 C23 C24 SING Y N 2
A1H56 O4 C11 DOUB N N 3
A1H56 C22 C10 SING Y N 4
A1H56 C24 C7 DOUB Y N 5
A1H56 O3 S1 DOUB N N 6
A1H56 C11 N2 SING N N 7
A1H56 C11 C12 SING N N 8
A1H56 C5 C4 DOUB Y N 9
A1H56 C5 C6 SING Y N 10
A1H56 C10 N2 SING N N 11
A1H56 C10 C8 DOUB Y N 12
A1H56 C7 C6 SING N N 13
A1H56 C7 C8 SING Y N 14
A1H56 C18 N5 SING N N 15
A1H56 C18 C17 SING N N 16
A1H56 C21 C12 DOUB Y N 17
A1H56 C21 C20 SING Y N 18
A1H56 C4 C3 SING Y N 19
A1H56 C6 C25 DOUB Y N 20
A1H56 C8 C9 SING N N 21
A1H56 S1 N5 SING N N 22
A1H56 S1 O2 DOUB N N 23
A1H56 S1 C19 SING N N 24
A1H56 C12 N3 SING Y N 25
A1H56 C20 C14 DOUB Y N 26
A1H56 C17 C16 SING N N 27
A1H56 C3 C2 DOUB Y N 28
A1H56 C25 C2 SING Y N 29
A1H56 C25 C26 SING N N 30
A1H56 C2 N1 SING N N 31
A1H56 O1 C1 DOUB N N 32
A1H56 N3 C13 DOUB Y N 33
A1H56 C14 C13 SING Y N 34
A1H56 C14 C15 SING N N 35
A1H56 C1 N1 SING N N 36
A1H56 C1 C27 SING N N 37
A1H56 C16 N4 SING N N 38
A1H56 C15 N4 SING N N 39
A1H56 C27 N6 DOUB Y N 40
A1H56 C27 C34 SING Y N 41
A1H56 N6 C28 SING Y N 42
A1H56 C34 C33 DOUB Y N 43
A1H56 C28 C29 DOUB Y N 44
A1H56 N7 C31 SING N N 45
A1H56 N7 C30 SING N N 46
A1H56 C33 C29 SING Y N 47
A1H56 C29 C30 SING N N 48
A1H56 C31 C32 SING N N 49
A1H56 C32 O5 SING N N 50
A1H56 C15 H10 SING N N 51
A1H56 C15 H11 SING N N 52
A1H56 C16 H14 SING N N 53
A1H56 C16 H13 SING N N 54
A1H56 C17 H16 SING N N 55
A1H56 C17 H15 SING N N 56
A1H56 C18 H18 SING N N 57
A1H56 C18 H17 SING N N 58
A1H56 C19 H21 SING N N 59
A1H56 C19 H22 SING N N 60
A1H56 C19 H20 SING N N 61
A1H56 C20 H23 SING N N 62
A1H56 C21 H24 SING N N 63
A1H56 C22 H25 SING N N 64
A1H56 C23 H26 SING N N 65
A1H56 C24 H27 SING N N 66
A1H56 C26 H5 SING N N 67
A1H56 C26 H6 SING N N 68
A1H56 C26 H7 SING N N 69
A1H56 C28 H31 SING N N 70
A1H56 N1 H1 SING N N 71
A1H56 C3 H2 SING N N 72
A1H56 C4 H3 SING N N 73
A1H56 C5 H4 SING N N 74
A1H56 C9 H12 SING N N 75
A1H56 C9 H19 SING N N 76
A1H56 C9 H28 SING N N 77
A1H56 N2 H8 SING N N 78
A1H56 C13 H9 SING N N 79
A1H56 N4 H29 SING N N 80
A1H56 N5 H34 SING N N 81
A1H56 C30 H33 SING N N 82
A1H56 C30 H32 SING N N 83
A1H56 N7 H39 SING N N 84
A1H56 C31 H35 SING N N 85
A1H56 C31 H36 SING N N 86
A1H56 C32 H37 SING N N 87
A1H56 C32 H38 SING N N 88
A1H56 O5 H43 SING N N 89
A1H56 C33 H40 SING N N 90
A1H56 C34 H41 SING N N 91
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
A1H56 InChI InChI 1.06 "InChI=1S/C34H41N7O5S/c1-23-27(28-8-5-10-30(24(28)2)41-34(44)32-14-12-26(22-38-32)20-36-17-18-42)7-4-9-29(23)40-33(43)31-13-11-25(21-37-31)19-35-15-6-16-39-47(3,45)46/h4-5,7-14,21-22,35-36,39,42H,6,15-20H2,1-3H3,(H,40,43)(H,41,44)"
A1H56 InChIKey InChI 1.06 DLMVYWVXLURSSE-UHFFFAOYSA-N
A1H56 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "Cc1c(NC(=O)c2ccc(CNCCO)cn2)cccc1c3cccc(NC(=O)c4ccc(CNCCCN[S](C)(=O)=O)cn4)c3C"
A1H56 SMILES CACTVS 3.385 "Cc1c(NC(=O)c2ccc(CNCCO)cn2)cccc1c3cccc(NC(=O)c4ccc(CNCCCN[S](C)(=O)=O)cn4)c3C"
A1H56 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "Cc1c(cccc1NC(=O)c2ccc(cn2)CNCCCNS(=O)(=O)C)c3cccc(c3C)NC(=O)c4ccc(cn4)CNCCO"
A1H56 SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "Cc1c(cccc1NC(=O)c2ccc(cn2)CNCCCNS(=O)(=O)C)c3cccc(c3C)NC(=O)c4ccc(cn4)CNCCO"
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id A1H56
_pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
"~{N}-[3-[3-[[5-[(2-hydroxyethylamino)methyl]pyridin-2-yl]carbonylamino]-2-methyl-phenyl]-2-methyl-phenyl]-5-[[3-(methylsulfonylamino)propylamino]methyl]pyridine-2-carboxamide"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
A1H56 'Create component' 2024-03-14 PDBE
A1H56 'Initial release' 2024-06-19 RCSB
#
loop_
_software.name
_software.version
_software.description
rdkit 2023.03.3 'Core functionality.'
pdbeccdutils 0.8.4 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.'
#
loop_
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.element
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal
A1H56 C15 C 21.187 6.941 1
A1H56 C16 C 22.486 9.191 2
A1H56 C17 C 22.486 10.691 3
A1H56 C18 C 23.785 11.441 4
A1H56 C19 C 26.383 14.441 5
A1H56 C20 C 19.887 4.691 6
A1H56 C21 C 18.588 3.941 7
A1H56 C22 C 13.392 2.441 8
A1H56 C23 C 12.093 1.690 9
A1H56 C24 C 12.093 0.191 10
A1H56 C25 C 12.093 -2.809 11
A1H56 C26 C 10.794 -2.059 12
A1H56 C27 C 9.495 -7.309 13
A1H56 C28 C 8.196 -9.559 14
A1H56 O1 O 12.093 -7.309 15
A1H56 C1 C 10.794 -6.559 16
A1H56 N1 N 10.794 -5.059 17
A1H56 C2 C 12.093 -4.309 18
A1H56 C3 C 13.392 -5.059 19
A1H56 C4 C 14.691 -4.309 20
A1H56 C5 C 14.691 -2.809 21
A1H56 C6 C 13.392 -2.059 22
A1H56 C7 C 13.392 -0.559 23
A1H56 C8 C 14.691 0.191 24
A1H56 C9 C 15.990 -0.559 25
A1H56 C10 C 14.691 1.690 26
A1H56 N2 N 15.990 2.441 27
A1H56 C11 C 15.990 3.941 28
A1H56 C12 C 17.290 4.691 29
A1H56 N3 N 17.290 6.191 30
A1H56 C13 C 18.588 6.941 31
A1H56 C14 C 19.887 6.191 32
A1H56 N4 N 21.187 8.441 33
A1H56 N5 N 23.785 12.941 34
A1H56 S1 S 25.084 13.691 35
A1H56 O2 O 25.834 12.392 36
A1H56 O3 O 24.334 14.989 37
A1H56 O4 O 14.691 4.691 38
A1H56 N6 N 9.495 -8.809 39
A1H56 C29 C 6.897 -8.809 40
A1H56 C30 C 5.598 -9.559 41
A1H56 N7 N 5.598 -11.059 42
A1H56 C31 C 4.299 -11.809 43
A1H56 C32 C 4.299 -13.309 44
A1H56 O5 O 3.000 -14.059 45
A1H56 C33 C 6.897 -7.309 46
A1H56 C34 C 8.196 -6.559 47
#
loop_
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_2
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.value_order
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal
A1H56 C23 C22 DOUBLE NONE 1
A1H56 C23 C24 SINGLE NONE 2
A1H56 O4 C11 DOUBLE NONE 3
A1H56 C22 C10 SINGLE NONE 4
A1H56 C24 C7 DOUBLE NONE 5
A1H56 O3 S1 DOUBLE NONE 6
A1H56 C11 N2 SINGLE NONE 7
A1H56 C11 C12 SINGLE NONE 8
A1H56 C5 C4 DOUBLE NONE 9
A1H56 C5 C6 SINGLE NONE 10
A1H56 C10 N2 SINGLE NONE 11
A1H56 C10 C8 DOUBLE NONE 12
A1H56 C7 C6 SINGLE NONE 13
A1H56 C7 C8 SINGLE NONE 14
A1H56 C18 N5 SINGLE NONE 15
A1H56 C18 C17 SINGLE NONE 16
A1H56 C21 C12 SINGLE NONE 17
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A1H56 C4 C3 SINGLE NONE 19
A1H56 C6 C25 DOUBLE NONE 20
A1H56 C8 C9 SINGLE NONE 21
A1H56 S1 N5 SINGLE NONE 22
A1H56 S1 O2 DOUBLE NONE 23
A1H56 S1 C19 SINGLE NONE 24
A1H56 C12 N3 DOUBLE NONE 25
A1H56 C20 C14 SINGLE NONE 26
A1H56 C17 C16 SINGLE NONE 27
A1H56 C3 C2 DOUBLE NONE 28
A1H56 C25 C2 SINGLE NONE 29
A1H56 C25 C26 SINGLE NONE 30
A1H56 C2 N1 SINGLE NONE 31
A1H56 O1 C1 DOUBLE NONE 32
A1H56 N3 C13 SINGLE NONE 33
A1H56 C14 C13 DOUBLE NONE 34
A1H56 C14 C15 SINGLE NONE 35
A1H56 C1 N1 SINGLE NONE 36
A1H56 C1 C27 SINGLE NONE 37
A1H56 C16 N4 SINGLE NONE 38
A1H56 C15 N4 SINGLE NONE 39
A1H56 C27 N6 SINGLE NONE 40
A1H56 C27 C34 DOUBLE NONE 41
A1H56 N6 C28 DOUBLE NONE 42
A1H56 C34 C33 SINGLE NONE 43
A1H56 C28 C29 SINGLE NONE 44
A1H56 N7 C31 SINGLE NONE 45
A1H56 N7 C30 SINGLE NONE 46
A1H56 C33 C29 DOUBLE NONE 47
A1H56 C29 C30 SINGLE NONE 48
A1H56 C31 C32 SINGLE NONE 49
A1H56 C32 O5 SINGLE NONE 50
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name
_pdbe_chem_comp_substructure.id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys
A1H56 MurckoScaffold S1 scaffold O=C(Nc1cccc(-c2cccc(NC(=O)c3ccccn3)c2)c1)c1ccccn1 InChI=1S/C24H18N4O2/c29-23(21-11-1-3-13-25-21)27-19-9-5-7-17(15-19)18-8-6-10-20(16-18)28-24(30)22-12-2-4-14-26-22/h1-16H,(H,27,29)(H,28,30) UJBQWBOKCVFTQG-UHFFFAOYSA-N
A1H56 amide F1 fragment CC(N)=O InChI=1S/C2H5NO/c1-2(3)4/h1H3,(H2,3,4) DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N
A1H56 phenyl F2 fragment c1ccccc1 InChI=1S/C6H6/c1-2-4-6-5-3-1/h1-6H UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N
A1H56 pyridine F3 fragment c1ccncc1 InChI=1S/C5H5N/c1-2-4-6-5-3-1/h1-5H JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal
A1H56 C20 S1 1
A1H56 C21 S1 1
A1H56 C22 S1 1
A1H56 C23 S1 1
A1H56 C24 S1 1
A1H56 C25 S1 1
A1H56 C27 S1 1
A1H56 C28 S1 1
A1H56 O1 S1 1
A1H56 C1 S1 1
A1H56 N1 S1 1
A1H56 C2 S1 1
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A1H56 C12 S1 1
A1H56 N3 S1 1
A1H56 C13 S1 1
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A1H56 N6 S1 1
A1H56 C29 S1 1
A1H56 C33 S1 1
A1H56 C34 S1 1
A1H56 N1 F1 1
A1H56 C1 F1 1
A1H56 O1 F1 1
A1H56 C27 F1 1
A1H56 N2 F1 2
A1H56 C11 F1 2
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A1H56 C12 F1 2
A1H56 C22 F2 1
A1H56 C23 F2 1
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A1H56 C6 F2 2
A1H56 C5 F2 2
A1H56 C4 F2 2
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A1H56 C27 F3 1
A1H56 C34 F3 1
A1H56 C33 F3 1
A1H56 C29 F3 1
A1H56 C28 F3 1
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A1H56 C12 F3 2
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A1H56 N3 F3 2
#
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.comp_id A1H56
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#
#
loop_
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.comp_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.atom_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_x_rdkit
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_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_z_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_method
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_ordinal
A1H56 C15 8.614 -1.189 1.333 ETKDGv3 1
A1H56 C16 8.299 0.578 -0.315 ETKDGv3 2
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A1H56 C19 12.708 3.740 -1.740 ETKDGv3 5
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A1H56 C26 -3.551 0.095 1.366 ETKDGv3 12
A1H56 C27 -7.517 0.728 -0.205 ETKDGv3 13
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A1H56 O1 -6.505 -0.950 1.141 ETKDGv3 15
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A1H56 C4 -3.031 -3.406 -1.152 ETKDGv3 20
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A1H56 N2 2.154 -1.502 2.773 ETKDGv3 27
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A1H56 C13 6.325 -0.679 2.159 ETKDGv3 31
A1H56 C14 7.158 -1.532 1.540 ETKDGv3 32
A1H56 N4 8.886 -0.742 -0.041 ETKDGv3 33
A1H56 N5 10.738 1.974 -2.904 ETKDGv3 34
A1H56 S1 12.430 2.372 -2.846 ETKDGv3 35
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A1H56 C29 -9.457 2.683 -0.782 ETKDGv3 40
A1H56 C30 -10.508 3.702 -1.133 ETKDGv3 41
A1H56 N7 -11.768 3.047 -1.517 ETKDGv3 42
A1H56 C31 -11.699 2.420 -2.849 ETKDGv3 43
A1H56 C32 -11.654 0.898 -2.707 ETKDGv3 44
A1H56 O5 -11.609 0.293 -3.971 ETKDGv3 45
A1H56 C33 -9.549 1.962 0.346 ETKDGv3 46
A1H56 C34 -8.531 0.940 0.655 ETKDGv3 47
A1H56 H10 9.222 -2.097 1.534 ETKDGv3 48
A1H56 H11 8.956 -0.423 2.064 ETKDGv3 49
A1H56 H14 7.190 0.499 -0.366 ETKDGv3 50
A1H56 H13 8.560 1.299 0.491 ETKDGv3 51
A1H56 H16 8.569 0.398 -2.463 ETKDGv3 52
A1H56 H15 8.271 2.072 -1.877 ETKDGv3 53
A1H56 H18 10.862 0.446 -1.437 ETKDGv3 54
A1H56 H17 10.530 2.108 -0.802 ETKDGv3 55
A1H56 H21 13.749 4.106 -1.858 ETKDGv3 56
A1H56 H22 12.557 3.415 -0.691 ETKDGv3 57
A1H56 H20 12.001 4.560 -1.980 ETKDGv3 58
A1H56 H23 7.264 -3.507 0.512 ETKDGv3 59
A1H56 H24 4.929 -4.032 0.799 ETKDGv3 60
A1H56 H25 0.803 -1.805 5.107 ETKDGv3 61
A1H56 H26 -1.568 -2.156 5.392 ETKDGv3 62
A1H56 H27 -3.092 -2.314 3.375 ETKDGv3 63
A1H56 H5 -2.554 0.491 1.654 ETKDGv3 64
A1H56 H6 -4.054 0.898 0.790 ETKDGv3 65
A1H56 H7 -4.138 -0.117 2.284 ETKDGv3 66
A1H56 H31 -8.232 2.982 -2.623 ETKDGv3 67
A1H56 H1 -5.576 -0.213 -1.879 ETKDGv3 68
A1H56 H2 -4.756 -2.618 -2.288 ETKDGv3 69
A1H56 H3 -2.879 -4.253 -1.808 ETKDGv3 70
A1H56 H4 -1.477 -3.966 0.132 ETKDGv3 71
A1H56 H12 -0.296 -0.859 -0.192 ETKDGv3 72
A1H56 H19 0.707 -2.356 -0.092 ETKDGv3 73
A1H56 H28 1.359 -0.755 0.450 ETKDGv3 74
A1H56 H8 2.596 -0.788 3.396 ETKDGv3 75
A1H56 H9 6.685 0.270 2.536 ETKDGv3 76
A1H56 H29 8.489 -1.438 -0.716 ETKDGv3 77
A1H56 H34 10.629 1.243 -3.644 ETKDGv3 78
A1H56 H33 -10.690 4.341 -0.241 ETKDGv3 79
A1H56 H32 -10.153 4.383 -1.939 ETKDGv3 80
A1H56 H39 -12.505 3.790 -1.545 ETKDGv3 81
A1H56 H35 -10.819 2.763 -3.439 ETKDGv3 82
A1H56 H36 -12.607 2.688 -3.436 ETKDGv3 83
A1H56 H37 -10.745 0.600 -2.145 ETKDGv3 84
A1H56 H38 -12.541 0.540 -2.137 ETKDGv3 85
A1H56 H43 -12.531 0.333 -4.338 ETKDGv3 86
A1H56 H40 -10.371 2.116 1.034 ETKDGv3 87
A1H56 H41 -8.621 0.372 1.572 ETKDGv3 88
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