data_Q1S
#
_chem_comp.id Q1S
_chem_comp.name N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]isoquinolin-1-amine
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C20 H21 N5 O2"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2019-09-06
_chem_comp.pdbx_modified_date 2019-11-29
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 363.413
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code Q1S
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6U8L
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
Q1S C01 C1 C 0 1 Y N N N N N 5.629 12.765 42.158 1.805 0.336 0.082 C01 Q1S 1
Q1S N02 N1 N 0 1 N N N N N N 5.019 11.521 42.306 0.472 0.380 -0.288 N02 Q1S 2
Q1S C03 C2 C 0 1 Y N N N N N 5.640 10.258 42.242 -0.316 -0.775 -0.203 C03 Q1S 3
Q1S C04 C3 C 0 1 Y N N N N N 6.564 9.877 43.216 0.277 -2.027 -0.256 C04 Q1S 4
Q1S C05 C4 C 0 1 Y N N N N N 7.170 8.630 43.143 -0.503 -3.166 -0.171 C05 Q1S 5
Q1S C06 C5 C 0 1 Y N N N N N 6.891 7.739 42.108 -1.875 -3.060 -0.034 C06 Q1S 6
Q1S C07 C6 C 0 1 Y N N N N N 5.972 8.120 41.124 -2.475 -1.816 0.019 C07 Q1S 7
Q1S C08 C7 C 0 1 Y N N N N N 5.335 9.374 41.173 -1.700 -0.669 -0.060 C08 Q1S 8
Q1S N09 N2 N 0 1 N N N N N N 4.445 9.719 40.169 -2.305 0.592 -0.006 N09 Q1S 9
Q1S C10 C8 C 0 1 N N N N N N 4.826 10.859 39.331 -3.262 0.765 -1.108 C10 Q1S 10
Q1S C11 C9 C 0 1 N N N N N N 3.673 11.350 38.439 -3.841 2.181 -1.060 C11 Q1S 11
Q1S N12 N3 N 0 1 N N N N N N 3.061 10.258 37.646 -4.494 2.396 0.239 N12 Q1S 12
Q1S C13 C10 C 0 1 N N N N N N 2.671 9.108 38.498 -3.537 2.224 1.341 C13 Q1S 13
Q1S C14 C11 C 0 1 N N N N N N 3.784 8.624 39.452 -2.958 0.808 1.293 C14 Q1S 14
Q1S C15 C12 C 0 1 Y N N N N N 4.935 13.971 42.421 2.635 1.462 -0.121 C15 Q1S 15
Q1S C16 C13 C 0 1 Y N N N N N 5.650 15.176 42.226 3.995 1.380 0.272 C16 Q1S 16
Q1S C17 C14 C 0 1 Y N N N N N 6.981 15.135 41.808 4.452 0.177 0.845 C17 Q1S 17
Q1S C18 C15 C 0 1 Y N N N N N 7.564 13.907 41.594 3.576 -0.852 0.999 C18 Q1S 18
Q1S N19 N4 N 0 1 Y N N N N N 6.914 12.738 41.746 2.306 -0.755 0.630 N19 Q1S 19
Q1S C20 C16 C 0 1 Y N N N N N 3.590 14.059 42.853 2.154 2.646 -0.694 C20 Q1S 20
Q1S C21 C17 C 0 1 Y N N N N N 2.989 15.297 43.091 3.000 3.701 -0.866 C21 Q1S 21
Q1S C22 C18 C 0 1 Y N N N N N 3.700 16.469 42.883 4.336 3.620 -0.481 C22 Q1S 22
Q1S C23 C19 C 0 1 Y N N N N N 5.029 16.413 42.462 4.837 2.484 0.080 C23 Q1S 23
Q1S N24 N5 N 1 1 N N N N N N 8.130 8.270 44.176 0.132 -4.502 -0.228 N24 Q1S 24
Q1S O25 O1 O -1 1 N N N N N N 8.456 9.143 44.997 1.340 -4.596 -0.349 O25 Q1S 25
Q1S O26 O2 O 0 1 N N N N N N 8.577 7.112 44.154 -0.553 -5.506 -0.154 O26 Q1S 26
Q1S C27 C20 C 0 1 N N N N N N 1.927 10.718 36.834 -5.129 3.720 0.295 C27 Q1S 27
Q1S H1 H1 H 0 1 N N N N N N 4.034 11.525 42.476 0.083 1.209 -0.606 H1 Q1S 28
Q1S H2 H2 H 0 1 N N N N N N 6.807 10.551 44.025 1.348 -2.113 -0.363 H2 Q1S 29
Q1S H3 H3 H 0 1 N N N N N N 7.374 6.774 42.066 -2.479 -3.953 0.031 H3 Q1S 30
Q1S H4 H4 H 0 1 N N N N N N 5.748 7.441 40.314 -3.546 -1.737 0.130 H4 Q1S 31
Q1S H5 H5 H 0 1 N N N N N N 5.666 10.558 38.687 -2.752 0.612 -2.059 H5 Q1S 32
Q1S H6 H6 H 0 1 N N N N N N 5.143 11.686 39.984 -4.068 0.038 -1.007 H6 Q1S 33
Q1S H7 H7 H 0 1 N N N N N N 4.062 12.112 37.748 -3.038 2.906 -1.189 H7 Q1S 34
Q1S H8 H8 H 0 1 N N N N N N 2.898 11.797 39.079 -4.572 2.301 -1.860 H8 Q1S 35
Q1S H10 H10 H 0 1 N N N N N N 1.802 9.406 39.104 -2.731 2.950 1.240 H10 Q1S 36
Q1S H11 H11 H 0 1 N N N N N N 2.391 8.271 37.841 -4.047 2.376 2.292 H11 Q1S 37
Q1S H12 H12 H 0 1 N N N N N N 3.339 7.941 40.190 -3.761 0.082 1.422 H12 Q1S 38
Q1S H13 H13 H 0 1 N N N N N N 4.540 8.085 38.862 -2.227 0.687 2.092 H13 Q1S 39
Q1S H14 H14 H 0 1 N N N N N N 7.541 16.046 41.656 5.481 0.075 1.156 H14 Q1S 40
Q1S H15 H15 H 0 1 N N N N N N 8.599 13.880 41.287 3.924 -1.774 1.442 H15 Q1S 41
Q1S H16 H16 H 0 1 N N N N N N 3.019 13.154 43.001 1.121 2.723 -0.998 H16 Q1S 42
Q1S H17 H17 H 0 1 N N N N N N 1.967 15.342 43.438 2.628 4.614 -1.308 H17 Q1S 43
Q1S H18 H18 H 0 1 N N N N N N 3.225 17.425 43.047 4.985 4.471 -0.629 H18 Q1S 44
Q1S H19 H19 H 0 1 N N N N N N 5.584 17.328 42.317 5.875 2.434 0.375 H19 Q1S 45
Q1S H20 H20 H 0 1 N N N N N N 1.513 9.870 36.268 -5.880 3.796 -0.491 H20 Q1S 46
Q1S H21 H21 H 0 1 N N N N N N 1.150 11.134 37.492 -5.604 3.853 1.267 H21 Q1S 47
Q1S H22 H22 H 0 1 N N N N N N 2.269 11.494 36.133 -4.373 4.492 0.151 H22 Q1S 48
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
Q1S C27 N12 SING N N 1
Q1S N12 C11 SING N N 2
Q1S N12 C13 SING N N 3
Q1S C11 C10 SING N N 4
Q1S C13 C14 SING N N 5
Q1S C10 N09 SING N N 6
Q1S C14 N09 SING N N 7
Q1S N09 C08 SING N N 8
Q1S C07 C08 DOUB Y N 9
Q1S C07 C06 SING Y N 10
Q1S C08 C03 SING Y N 11
Q1S C18 N19 DOUB Y N 12
Q1S C18 C17 SING Y N 13
Q1S N19 C01 SING Y N 14
Q1S C17 C16 DOUB Y N 15
Q1S C06 C05 DOUB Y N 16
Q1S C01 N02 SING N N 17
Q1S C01 C15 DOUB Y N 18
Q1S C16 C15 SING Y N 19
Q1S C16 C23 SING Y N 20
Q1S C03 N02 SING N N 21
Q1S C03 C04 DOUB Y N 22
Q1S C15 C20 SING Y N 23
Q1S C23 C22 DOUB Y N 24
Q1S C20 C21 DOUB Y N 25
Q1S C22 C21 SING Y N 26
Q1S C05 C04 SING Y N 27
Q1S C05 N24 SING N N 28
Q1S O26 N24 DOUB N N 29
Q1S N24 O25 SING N N 30
Q1S N02 H1 SING N N 31
Q1S C04 H2 SING N N 32
Q1S C06 H3 SING N N 33
Q1S C07 H4 SING N N 34
Q1S C10 H5 SING N N 35
Q1S C10 H6 SING N N 36
Q1S C11 H7 SING N N 37
Q1S C11 H8 SING N N 38
Q1S C13 H10 SING N N 39
Q1S C13 H11 SING N N 40
Q1S C14 H12 SING N N 41
Q1S C14 H13 SING N N 42
Q1S C17 H14 SING N N 43
Q1S C18 H15 SING N N 44
Q1S C20 H16 SING N N 45
Q1S C21 H17 SING N N 46
Q1S C22 H18 SING N N 47
Q1S C23 H19 SING N N 48
Q1S C27 H20 SING N N 49
Q1S C27 H21 SING N N 50
Q1S C27 H22 SING N N 51
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
Q1S SMILES ACDLabs 12.01 c4(Nc1cc([N+]([O-])=O)ccc1N2CCN(CC2)C)c3ccccc3ccn4
Q1S InChI InChI 1.03 InChI=1S/C20H21N5O2/c1-23-10-12-24(13-11-23)19-7-6-16(25(26)27)14-18(19)22-20-17-5-3-2-4-15(17)8-9-21-20/h2-9,14H,10-13H2,1H3,(H,21,22)
Q1S InChIKey InChI 1.03 BAIHXTXZZNBSED-UHFFFAOYSA-N
Q1S SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 CN1CCN(CC1)c2ccc(cc2Nc3nccc4ccccc34)[N+]([O-])=O
Q1S SMILES CACTVS 3.385 CN1CCN(CC1)c2ccc(cc2Nc3nccc4ccccc34)[N+]([O-])=O
Q1S SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 CN1CCN(CC1)c2ccc(cc2Nc3c4ccccc4ccn3)[N+](=O)[O-]
Q1S SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 CN1CCN(CC1)c2ccc(cc2Nc3c4ccccc4ccn3)[N+](=O)[O-]
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
Q1S "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]isoquinolin-1-amine
Q1S "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 ~{N}-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitro-phenyl]isoquinolin-1-amine
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
Q1S 'Create component' 2019-09-06 RCSB
Q1S 'Initial release' 2019-12-04 RCSB
#
loop_
_software.name
_software.version
_software.description
rdkit 2023.03.3 'Core functionality.'
pdbeccdutils 0.8.4 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.'
#
loop_
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.element
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal
Q1S C01 C 6.999 1.849 1
Q1S N02 N 6.999 0.349 2
Q1S C03 C 8.298 -0.401 3
Q1S C04 C 9.597 0.349 4
Q1S C05 C 10.896 -0.401 5
Q1S C06 C 10.896 -1.901 6
Q1S C07 C 9.597 -2.651 7
Q1S C08 C 8.298 -1.901 8
Q1S N09 N 6.999 -2.651 9
Q1S C10 C 5.700 -1.901 10
Q1S C11 C 4.401 -2.651 11
Q1S N12 N 4.401 -4.151 12
Q1S C13 C 5.700 -4.901 13
Q1S C14 C 6.999 -4.151 14
Q1S C15 C 5.700 2.599 15
Q1S C16 C 5.700 4.099 16
Q1S C17 C 6.999 4.849 17
Q1S C18 C 8.298 4.099 18
Q1S N19 N 8.298 2.599 19
Q1S C20 C 4.359 1.797 20
Q1S C21 C 3.000 2.568 21
Q1S C22 C 3.000 4.130 22
Q1S C23 C 4.359 4.901 23
Q1S N24 N 12.195 0.349 24
Q1S O25 O 13.494 -0.401 25
Q1S O26 O 12.195 1.849 26
Q1S C27 C 3.102 -4.901 27
#
loop_
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_2
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.value_order
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal
Q1S C27 N12 SINGLE NONE 1
Q1S N12 C11 SINGLE NONE 2
Q1S N12 C13 SINGLE NONE 3
Q1S C11 C10 SINGLE NONE 4
Q1S C13 C14 SINGLE NONE 5
Q1S C10 N09 SINGLE NONE 6
Q1S C14 N09 SINGLE NONE 7
Q1S N09 C08 SINGLE NONE 8
Q1S C07 C08 DOUBLE NONE 9
Q1S C07 C06 SINGLE NONE 10
Q1S C08 C03 SINGLE NONE 11
Q1S C18 N19 SINGLE NONE 12
Q1S C18 C17 DOUBLE NONE 13
Q1S N19 C01 DOUBLE NONE 14
Q1S C17 C16 SINGLE NONE 15
Q1S C06 C05 DOUBLE NONE 16
Q1S C01 N02 SINGLE NONE 17
Q1S C01 C15 SINGLE NONE 18
Q1S C16 C15 DOUBLE NONE 19
Q1S C16 C23 SINGLE NONE 20
Q1S C03 N02 SINGLE NONE 21
Q1S C03 C04 DOUBLE NONE 22
Q1S C15 C20 SINGLE NONE 23
Q1S C23 C22 DOUBLE NONE 24
Q1S C20 C21 DOUBLE NONE 25
Q1S C22 C21 SINGLE NONE 26
Q1S C05 C04 SINGLE NONE 27
Q1S C05 N24 SINGLE NONE 28
Q1S O26 N24 DOUBLE NONE 29
Q1S N24 O25 SINGLE NONE 30
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name
_pdbe_chem_comp_substructure.id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys
Q1S MurckoScaffold S1 scaffold c1ccc(N2CCNCC2)c(Nc2nccc3ccccc23)c1 InChI=1S/C19H20N4/c1-2-6-16-15(5-1)9-10-21-19(16)22-17-7-3-4-8-18(17)23-13-11-20-12-14-23/h1-10,20H,11-14H2,(H,21,22) ROXBCJBKIZZXQJ-UHFFFAOYSA-N
Q1S isoquinoline F1 fragment c1ccc2cnccc2c1 InChI=1S/C9H7N/c1-2-4-9-7-10-6-5-8(9)3-1/h1-7H AWJUIBRHMBBTKR-UHFFFAOYSA-N
Q1S phenyl F2 fragment c1ccccc1 InChI=1S/C6H6/c1-2-4-6-5-3-1/h1-6H UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N
Q1S piperazine F3 fragment C1CNCCN1 InChI=1S/C4H10N2/c1-2-6-4-3-5-1/h5-6H,1-4H2 GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N
Q1S pyridine F4 fragment c1ccncc1 InChI=1S/C5H5N/c1-2-4-6-5-3-1/h1-5H JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal
Q1S C01 S1 1
Q1S N02 S1 1
Q1S C03 S1 1
Q1S C04 S1 1
Q1S C05 S1 1
Q1S C06 S1 1
Q1S C07 S1 1
Q1S C08 S1 1
Q1S N09 S1 1
Q1S C10 S1 1
Q1S C11 S1 1
Q1S N12 S1 1
Q1S C13 S1 1
Q1S C14 S1 1
Q1S C15 S1 1
Q1S C16 S1 1
Q1S C17 S1 1
Q1S C18 S1 1
Q1S N19 S1 1
Q1S C20 S1 1
Q1S C21 S1 1
Q1S C22 S1 1
Q1S C23 S1 1
Q1S C22 F1 1
Q1S C23 F1 1
Q1S C16 F1 1
Q1S C15 F1 1
Q1S C20 F1 1
Q1S C21 F1 1
Q1S C01 F1 1
Q1S N19 F1 1
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